Tobamovirus
|
|
| Tobamovirus | |
|---|---|
| Tobaksmosaikvirus (TMV) diagram och elektronmikrofotografi av virioner | |
| Virusklassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Riboviria |
| Rike: | Orthornavirae |
| Provins: | Kitrinoviricota |
| Klass: | Alsuviricetes |
| Beställa: | Martellivirales |
| Familj: | Virgaviridae |
| Släkte: | Tobamovirus |
Tobamovirus är ett släkte av positivsträngade RNA-virus i familjen Virgaviridae . Många växter, inklusive tobak , potatis , tomat och squash , fungerar som naturliga värdar. Sjukdomar associerade med detta släkte inkluderar: nekrotiska lesioner på löv. Namnet Tobamovirus kommer från värden och symptomen på det första viruset som upptäcktes ( Tobacco mosaic virus) .
Det finns fyra informella undergrupper inom detta släkte: det här är tobamovirusen som infekterar växterna brassicas , gurkor , malvaceous och solanaceous växter. Huvudskillnaderna mellan dessa grupper är genomsekvenser och respektive utbud av värdväxter. [ citat behövs ] Det finns 37 arter i detta släkte.
Strukturera
Tobamovirus är icke-hölje, med spiralformade stavgeometrier och spiralformad symmetri. Diametern är cirka 18 nm, med en längd på 300–310 nm. Genomerna är linjära och icke-segmenterade, cirka 6,3–6,5 kb långa.
Genom
RNA-genomet kodar för minst fyra polypeptider : dessa är det icke-strukturella proteinet och genomläsningsprodukten som är involverade i virusreplikation (RNA-beroende RNA-polymeras, RdRp); rörelseproteinet (MP) som är nödvändigt för att viruset ska kunna röra sig mellan celler och pälsproteinet ( CP ) . Genomläsningsdelen av RdRp kan uttryckas som ett separat protein i TMV. Viruset kan replikera utan rörelse eller pälsproteiner, men de andra två är viktiga. Det icke-strukturella proteinet har domäner som tyder på att det är involverat i RNA-kapsling och genomläsningsprodukten har ett motiv för ett RNA-polymeras. Rörelseproteinerna tillverkas mycket tidigt i infektionscykeln och lokaliserade till plasmodesmata , de är troligen involverade i värdspecificitet eftersom de tros interagera med vissa värdcellsfaktorer. [ citat behövs ]
Livscykel
Viral replikation är cytoplasmatisk. Inträde i värdcellen uppnås genom penetration in i värdcellen. Replikation följer den positiva strängade RNA-virusreplikationsmodellen. Positivt strängat RNA-virustranskription är metoden för transkription. Översättning sker genom undertryckande av uppsägning. Viruset lämnar värdcellen genom monopartit icke-tubulistyrd viral rörelse. Växter fungerar som naturlig värd. Överföringsvägarna är mekaniska.
Enzymer
Tobamovirus RNA-beroende RNA-polymeraser är homologa med bromovirus , ilarvirus , tobravirus och nejlika-fläckvirus .
Smittvägar
Infektionen är lokaliserad till att börja med men om viruset förblir ohotat kommer det att spridas via kärlsystemet till en systemisk infektion. Den exakta mekanismen som viruset använder för att röra sig genom växten är okänd, men interaktionen mellan pektinmetylesteras , ett cellulärt enzym som är viktigt för cellväggsmetabolism och växtutveckling, med rörelseproteinet har varit inblandad.
Evolution
Dessa virus tros ha avvikit med sina värdar från en gemensam förfader. Det finns minst 3 distinkta klader av tobamovirus, som i viss mån följer sina värdområden: det vill säga det finns en infekterande solanaceous art; en andra infekterar gurkor och baljväxter och en tredje infekterar crucifers.
Klassificering
Arter
Släktet innehåller följande arter:
- Peppar mottle virus (BPeMV)
- Brugmansia mildt fläckvirus
- Cactus mild mottle virus (CMMoV)
- Clitoria gulfläckvirus
- Gurka frukt fläckig mosaik virus
- Gurka grön fläckig mosaikvirus (CGMMV)
- Gurka fläckvirus
- Frangipani mosaikvirus (FrMV)
- Hibiscus latent Fort Pierce-virus (HLFPV)
- Hibiscus latent Singapore-virus (HLSV)
- Kyuri grön fläckig mosaikvirus
- Maracuja mosaikvirus (MarMV)
- Obuda pepparvirus (ObPV)
- Odontoglossum ringspot virus (ORSV)
- Opuntia chlorotic ringspot virus
- Paprika milt fläckvirus
- Passionsfruktmosaikvirus
- Peppar mild fläckvirus (PMMoV)
- Plumeria mosaikvirus
- Råttsvanskaktusnekrosassocierat virus (RCNaV)
- Rehmannia mosaikvirus
- Ribgrass mosaic virus (HRV)
- Sammons's Opuntia virus (SOV)
- Streptocarpus flower break virus
- Sunn-hampa mosaikvirus (SHMV)
- Tobak latent virus
- Tobak mild grön mosaikvirus
- Tobaksmosaikvirus (TMV)
- Tomat brun rugosefruktvirus (ToBRFV)
- Tomatmosaikvirus (ToMV)
- Tomat fläckig mosaikvirus
- Tropiskt soda äppel mosaikvirus
- Rova ven-clearing virus (TVCV)
- Ullucus mild fläckvirus
- Wasabi mottle virus (WMoV)
- Gul stjärtblomma mild fläckvirus
- Youcai mosaikvirus (YoMV) aka rapsmosaikvirus (ORMV)
- Zucchini grön fläckig mosaikvirus
Föreslagna ledamöter
Föreslagna, men för närvarande okända medlemmar av släktet inkluderar:
- Chara corallina virus (CCV)
- Nicotiana velutina mosaikvirus (NVMV)
Vidare läsning
- Hagiwara, Yuka; Komoda, Keisuke; Yamanaka, Takuya; Tamai, Atsushi; Meshi, Tetsuo; Funada, Ryo; Tsuchiya, Tomohiro; Naito, Satoshi; Ishikawa, Masayuki (januari 2003). "Subcellulär lokalisering av värd- och virala proteiner associerade med tobamovirus-RNA-replikation" . EMBO Journal . 22 (2): 344–53. doi : 10.1093/emboj/cdg033 . PMC 140108 . PMID 12514140 . S2CID 39785019 .