Partitiviridae
|
|
|
|
| Partitiviridae | |
|---|---|
| CryoEM av Penicillium stoloniferum virus S kapsid, | |
| TEM av Penicillium stoloniferum virus S | |
| Virusklassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Riboviria |
| Rike: | Orthornavirae |
| Provins: | Pisuviricota |
| Klass: | Duplopiviricetes |
| Beställa: | Durnavirales |
| Familj: | Partitiviridae |
Partitiviridae är en familj av dubbelsträngade RNA-virus . Växter , svampar och protozoer fungerar som naturliga värdar. Det har föreslagits att de också kan infektera bakterier . Namnet kommer från latinets partitius, som betyder delad, och syftar på det segmenterade genomet av partitivirus. Det finns fem släkten och 60 arter i familjen, varav 15 är otilldelade till ett släkte.
Strukturera
Virus i familjen Partitiviridae är icke-hölje med icosaedriska geometrier och T=1-symmetri. Diametern på partitivirus är cirka 25–43 nm.
Genom
Partitivirus har dubbelsträngade RNA- genom uppdelade i två genomiska segment, och det kan finnas ytterligare subgenomiska segment. De två genomsegmenten är förpackade i separata viruspartiklar. De kodar för två separata proteiner. Det första segmentet kodar för det RNA-beroende RNA-polymeraset (RdRp), och det andra segmentet kodar för höljesproteinet . Segmenten är cirka 1,4–3,0 kbp långa, medan den totala genomlängden är cirka 3,0–4,8 kbp.
Livscykel
Viral replikation är cytoplasmatisk. Inträde i värdcellen uppnås genom penetration in i värdcellen. Replikationen följer den dubbelsträngade RNA-virusreplikationsmodellen. Dubbelsträngad RNA-virustranskription är metoden för transkription. Viruset lämnar värdcellen genom cell-till-cell-rörelse. Svampar och växter fungerar som den naturliga värden. Cryspovirus infekterar apikomplexiska protozoer av släktet Cryptosporidium , medan virus från de andra släktena infekterar växter och svampar. Det har föreslagits att de också kan infektera bakterier.
| Släkte | Värdinformation | Vävnadstropism | Inträdesuppgifter | Releaseinformation | Replikeringsplats | Monteringsplats | Överföring |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Kryspovirus | Protister | Ingen | Celldelning; sporogenes; hyfal anastomos | Celldelning; sporogenes; hyfal anastomos | Cytoplasma | Cytoplasma | Celldelning; sporogenes; hyfal anastomos |
| Alfapartivirus | Ingen | Cytoplasma | Cytoplasma | Celldelning | |||
| Deltapartitivirus | Växter | Ingen | Viral rörelse; mekanisk ympning | Celldelning | Cytoplasma | Cytoplasma | Celldelning |
| Betapartitivirus | Ingen | Cytoplasma | Cytoplasma | Celldelning | |||
| Gammapartitivirus | Svampar | Ingen | Cytoplasmatiskt utbyte; hyfal anastomos | Cytoplasmatiskt utbyte; hyfal anastomos | Cytoplasma | Cytoplasma | Cytoplasmatiskt utbyte; hyfal anastomos |
Fylogenetik
Baserat på RNA-polymerasgenen kan denna grupp delas in i fyra klader (I-IV). Fyra isolat från djur och protozoer bildar en femte kladd. Kladerna I–IV består av blandningar av partitivirusliknande sekvenser från växter och svampar. [ citat behövs ]
Taxonomi
Det finns fem erkända släkten inom familjen Partitiviridae . Det finns ytterligare femton arter i familjen otilldelade till ett släkte:
Alfapartivirus
- Beet cryptic virus 1
- Morots kryptiska virus
- Cherry chlorotic rostig fläck associerad partitivirus
- Chondrostereum purpureum kryptiskt virus 1
- Flammulina velutipes brunningsvirus
- Helicobasidium mompa partitivirus V70
- Heterobasidion partitivirus 1
- Heterobasidion partitivirus 3
- Heterobasidion partitivirus 12
- Heterobasidion partitivirus 13
- Heterobasidion partitivirus 15
- Rosellinia necatrix partitivirus 2
- Vicia kryptiska virus
- Vitklöver kryptiskt virus 1
Betapartitivirus
- Atkinsonella hypoxylonvirus
- Cannabis kryptiskt virus
- Ceratocystis resinifera virus 1
- Crimson clover cryptic virus 2
- Dill kryptisk virus 2
- Fusarium poae virus 1
- Heterobasidion partitivirus 2
- Heterobasidion partitivirus 7
- Heterobasidion partitivirus 8
- Heterobasidion partitivirus P
- Hop trefoil cryptic virus 2
- Pleurotus ostreatus virus 1
- Primula malacoides virus 1
- Rödklöver kryptiskt virus 2
- Rhizoctonia solani virus 717
- Rosellinia necatrix virus 1
- Vitklöver kryptiskt virus 2
Deltapartitivirus
- Beet cryptic virus 2
- Beet cryptic virus 3
- Kryptiska fikonvirus
- Pepper kryptisk virus 1
- Pepper cryptic virus 2
Gammapartitivirus
- Aspergillus ochraceous virus
- Discula destructiva virus 1
- Discula destructiva virus 2
- Fusarium solani virus 1
- Gremmeniella abietina RNA-virus MS1
- Ophiostoma partitivirus 1
- Penicillium stoloniferum virus F
- Penicillium stoloniferum virus S
Otilldelad till ett släkte:
- Agaricus bisporus virus 4
- Alfalfa kryptisk virus 1
- Nejlika kryptiskt virus 1
- Morot tempererat virus 1
- Morot tempererat virus 2
- Morot tempererat virus 3
- Morot tempererat virus 4
- Gaeumannomyces graminis virus 0196A
- Gaeumannomyces graminis virus T1A
- Hop trefoil cryptic virus 1
- Hop trefoil cryptic virus 3
- Rädisgul kantvirus
- Rajgräs kryptiska virus
- Spenat tempererat virus
- Vitklöver kryptiskt virus 3