Nodaviridae
|
|
| Nodaviridae | |
|---|---|
| Kristallstruktur av grouper nervös nekrosvirus a piscine betanodavirus | |
| Virusklassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Riboviria |
| Rike: | Orthornavirae |
| Provins: | Kitrinoviricota |
| Klass: | Magsaviricetes |
| Beställa: | Nodamuvirales |
| Familj: | Nodaviridae |
Nodaviridae är en familj av icke-höljeförsedda positiv-strängade RNA-virus . Ryggradsdjur och ryggradslösa djur fungerar som naturliga värdar. Sjukdomar associerade med denna familj inkluderar: viral encefalopati och retinopati hos fisk. Det finns nio arter i familjen, tilldelade två släkten.
Historia
Namnet på familjen kommer från den japanska byn Nodamura, Iwate Prefecture där Nodamura-viruset först isolerades från Culex tritaeniorhynchus- myggor. [ citat behövs ]
Virologi
Strukturera
Viruset är inte hölje och har en ikosaedrisk kapsid (trianguleringstal = 3) som sträcker sig från 29 till 35 nm i diameter. Kapsiden är uppbyggd av 32 kapsomerer .
Genom
Genomet är linjärt, positivt sens, tvådelat (sammansatt av två segment – RNA1 och RNA2) enkelsträngat RNA bestående av 4500 nukleotider med en 5'-terminal metylerad cap och en icke-polyadenylerad 3'-terminal.
RNA1, som är ~3,1 kilobaser i längd, kodar för ett protein som har flera funktionella domäner: en mitokondriell målsökningsdomän, en transmembrandomän, en RNA-beroende RNA-polymeras (RdRp) domän, en självinteraktionsdomän och en RNA-kapslingsdomän. Dessutom kodar RNA1 för ett subgenomiskt RNA3 som kodar för protein B2, en RNA-tystnadshämmare.
RNA2 kodar för protein α, en viral kapsidproteinprekursor, som autoklyves till två mogna proteiner, ett 38 kDa β-protein och ett 5 kDa γ-protein, vid ett konserverat Asn / Ala -ställe under virussammansättning.
Livscykel
Viral replikation är cytoplasmatisk. Inträde i värdcellen uppnås genom penetration in i värdcellen. Replikation följer den positiva strängade RNA-virusreplikationsmodellen. Transkription av positivt strängat RNA-virus, med användning av den interna initieringsmodellen för subgenomisk RNA-transkription, är metoden för transkription. Ryggradsdjur och ryggradslösa djur fungerar som den naturliga värden. Överföringsvägar är kontakt och kontaminering.
Taxonomi
Medlemmarna av släktet Alphanodavirus isolerades ursprungligen från insekter medan de av släktet Betanodavirus isolerades från fisk. Ett litet antal nodovirus verkar ligga utanför någon av dessa klader. Flockhusvirus (FHV) är det bäst studerade av nodavirusen. Det finns nio arter i denna familj, tilldelade två släkten:
-
Alfanodavirus
- Svartbaggevirus
- Boolarra virus
- Flock House-virus
- Nodamura virus
- Pariacoto-virus
-
Betanodavirus
- Barfin flundra nervös nekrosvirus
- Rödfläckig grouper nervös nekrosvirus
- Randigt jack nervös nekrosvirus
- Tigerpuffer nervnekrosvirus