Tristromaviridae
| Tristromaviridae | |
|---|---|
| Virusklassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Adnaviria |
| Rike: | Zilligvirae |
| Provins: | Taleaviricota |
| Klass: | Tokiviricetes |
| Beställa: | Primavirales |
| Familj: | Tristromaviridae |
Tristromaviridae är en familj av virus. Archaea av släktena Thermoproteus och Pyrobaculum fungerar som naturliga värdar. Tristromaviridae är den enda familjen i ordningen Primavirales . Det finns två släkten och tre arter i familjen.
Taxonomi
Följande släkten och arter hänförs till familjen:
-
Alphatristromavirus
- Alphatristromavirus PFV1
- Alphatristromavirus PFV2
-
Betatristromavirus
- Betatristromavirus TTV1
Strukturera
Virus i släktet Tristromaviridae är omslutna, med stavformade geometrier. Diametern är cirka 38 nm, med en längd på 410 nm. Genomerna är linjära, cirka 15,9 kb långa. TTV1-virionen innehåller fyra viruskodade proteiner, TP1-4. Proteinerna uppvisar inte någon sekvenslikhet med strukturella proteiner hos virus från andra familjer, inklusive lipotrixvirus. Nukleokapsidprotein TP1 har uppenbarligen utvecklats från ett Cas4-endonukleas, en konserverad komponent i den adaptiva CRISPR-Cas-immuniteten, som presenterar det första beskrivna fallet av exaptation av ett enzym för en viruskapsidproteinfunktion.
Högupplösande struktur av virion har bestämts med cryo-EM för Pyrobaculum filamentous virus 2 (PFV2), ett virus nära besläktat med PFV1 som representerar typen av art. Strukturen avslöjade att nukleokapsid bildas från två huvudkapsidproteiner (MCP1 och MCP2). MCP1 och MCP2 bildar en heterodimer, som sveper runt det linjära dsDNA-genomet och transformerar det till A-form. Interaktion mellan genomet och MCP:erna leder till kondensering av genomet till virion-superhelixen. Den spiralformade nukleokapsiden är omgiven av ett lipidhölje och innehåller andra virala proteiner, där VP3 är det vanligaste.
Veckningen av MCPs såväl som virionsorganisationen av tristromavirus liknar dem hos medlemmar av familjerna Rudiviridae och Lipothrixviridae , som tillsammans utgör ordningen Ligamenvirales . På grund av dessa strukturella likheter föreslogs ordningen Ligamenvirales och familjen Tristromaviridae att förenas inom en klass "Tokiviricetes" (toki betyder "tråd" på georgiska och viricetes är ett officiellt suffix för en virusklass).
Livscykel
Viral replikation är cytoplasmatisk. Inträde i värdcellen uppnås genom adsorption till värdcellen. DNA-mallrad transkription är metoden för transkription. Archaea av släktena Thermoproteus och Pyrobaculum fungerar som de naturliga värdarna. Virionerna frisätts genom lys. Överföringsvägar är passiv diffusion.