Kortkedjigt dehydrogenas
kortkedjiga | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
dehydrogenasidentifierare | |||||||||
Symbol | adh_short | ||||||||
Pfam | PF00106 | ||||||||
InterPro | IPR002198 | ||||||||
PROSITE | PDOC00060 | ||||||||
SCOP2 | 1hdc / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
OPM superfamilj | 119 | ||||||||
OPM-protein | 1xu7 | ||||||||
CDD | cd02266 | ||||||||
Membran | 246 | ||||||||
|
Familjen med kortkedjiga dehydrogenaser/reduktaser ( SDR) är en mycket stor familj av enzymer, av vilka de flesta är kända för att vara NAD- eller NADP-beroende oxidoreduktaser . Eftersom den första medlemmen i denna familj som karakteriserades var Drosophila alkoholdehydrogenas , brukade denna familj kallades "insektstyp" eller "kortkedjiga" alkoholdehydrogenaser. De flesta medlemmar av denna familj är proteiner med cirka 250 till 300 aminosyrarester. De flesta dehydrogenaser har minst 2 domäner, den första binder till koenzymet, ofta NAD, och den andra binder substratet. Denna senare domän bestämmer substratspecificiteten och innehåller aminosyror involverade i katalys. Lite sekvenslikhet har hittats i den koenzymbindande domänen även om det finns en stor grad av strukturell likhet, och det har därför föreslagits att strukturen av dehydrogenaser har uppstått genom genfusion av en gemensam förfäders koenzymnukleotidsekvens med olika substratspecifika domäner.
Underfamiljer
- Glukos/ribitoldehydrogenas InterPro : IPR002347
- Insekt alkoholdehydrogenas familj InterPro : IPR002424
- 2,3-dihydro-2,3-dihydroxibensoatdehydrogenas InterPro : IPR003560
Humana proteiner som innehåller denna domän
BDH1 ; BDH2; CBR1 ; CBR3 ; CBR4; DCXR ; DECR1; DECR2 ; DHRS1 ; DHRS10; DHRS13; DHRS2 ; DHRS3 ; DHRS4 ; DHRS4L2; DHRS7 ; DHRS7B ; DHRS8; DHRS9 ; DHRSX ; FASN ; FVT1 ; HADH2 ; HPGD ; HSD11B1 ; HSD11B2 ; HSD17B1 ; HSD17B10 ; HSD17B12 ; HSD17B13 ; HSD17B2 ; HSD17B3 ; HSD17B4 ; HSD17B6 ; HSD17B7 ; HSD17B7P2; HSD17B8 ; HSDL1; HSDL2; PECR ; QDPR ; RDH10; RDH11 ; RDH12 ; RDH13 ; RDH14 ; RDH16 ; RDH5 ; RDH8 ; RDHE2; RDHS; SCDR10; SPR ; WWOX ;