RDH13
| RDH13- | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| identifierare | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , SDR7C3, retinoldehydrogenas 13 (all-trans/9-cis), retinoldehydrogenas 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| externa ID:n | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Retinoldehydrogenas 13 (all-trans/9-cis) är ett protein som hos människor kodas av RDH13- genen . Denna gen kodar för ett mitokondriellt kortkedjigt dehydrogenas/reduktas, som katalyserar reduktionen och oxidationen av retinoider. Det kodade enzymet kan fungera i retinsyraproduktion och kan också skydda mitokondrierna mot oxidativ stress. Alternativt splitsade transkriptvarianter har beskrivits.
Gen
Den mänskliga RDH13-genen finns på den 19:e kromosomen, med dess specifika lokalisering 19q13.42. Genen innehåller totalt 12 exoner.
Strukturera
Analysen av den submitokondriella lokaliseringen av RDH13 indikerar dess association med det inre mitokondriella membranet. Den primära strukturen av RDH13 innehåller två hydrofoba segment, 2–21 och 242–261, som är tillräckligt långa för att fungera som transmembransegment; dock, som visas i föreliggande studie, avlägsnar alkalisk extraktion proteinet fullständigt från membranet, vilket indikerar att RDH13 är ett perifert membranprotein. Den perifera associationen av RDH13 med membranet skiljer ytterligare detta protein från de mikrosomala retinaldehydreduktaserna, som är integrerade membranproteiner som verkar vara förankrade i membranet via sina N-terminala hydrofoba segment.
Fungera
RDH13 är närmast besläktat med de NADP+-beroende mikrosomala enzymerna RDH11, RDH12 och RDH14. Renad RDH13 verkar på retinoider på ett oxidativt reduktivt sätt och föredrar starkt kofaktorn NADPH framför NADH. Dessutom har RDH13 mycket effektivare reduktasaktivitet än dehydrogenasaktivitet. RDH13 som ett retinaldehydreduktas är betydligt mindre aktivt än det för ett relaterat protein RDH11, främst på grund av det mycket högre Km-värdet för retinaldehyd. Men kcat-värdet för RDH13 för retinaldehydreduktion. odlingsbar med den för RDH11, och Km-värdena för de två enzymerna för NADPH är också mycket lika. Således, i överensstämmelse med dess sekvenslikhet med RDH11, RDH12 och RDH14, fungerar RDH13 som ett NADP+-beroende retinaldehydreduktas.
RDH13 är lokaliserad i mitokondrierna, vilket skiljer sig från de andra medlemmarna i denna familj, eftersom de lokaliseras till det endoplasmatiska retikulumet. Den exakta sekvensen som riktar RDH13 till mitokondrierna återstår att fastställa.
Klinisk signifikans
RDH13 är en del av en underfamilj av fyra retinoldehydrogenaser, RDH11, RDH12, RDH13 och RDH14, som uppvisar dubbelsubstratspecificitet, som unikt metaboliserar all-trans- och cis-retinoler med C(15) pro-R-specificitet. Metaboliterna som är involverade i dessa reaktioner är kända som retinoider, som är kromoforer involverade i syn, transkriptionell reglering och cellulär differentiering. RDH11-14 kan vara involverad i det första steget av all-trans- och 9-cis-retinsyraproduktion i många vävnader. RDH11-14 fyller luckan i vår förståelse av 11-cis-retinala och all-trans-retinala transformationer i fotoreceptor- och retinala pigmentepitelceller. Den dubbla substratspecificiteten för denna underfamilj förklarar den mindre fenotypen associerad med mutationer i 11-cis-retinoldehydrogenas (RDH5) som orsakar fundus albipunctatus hos människor.
Vidare läsning
- Persson B, Kallberg Y, Bray JE, Bruford E, Dellaporta SL, Favia AD, Duarte RG, Jörnvall H, Kavanagh KL, Kedishvili N, Kisiela M, Maser E, Mindnich R, Orchard S, Penning TM, Thornton JM, Adamski J , Oppermann U (mars 2009). "SDR (kortkedjigt dehydrogenas/reduktas och relaterade enzymer) nomenklaturinitiativet" . Kemisk-biologiska interaktioner . 178 (1–3): 94–8. doi : 10.1016/j.cbi.2008.10.040 . PMC 2896744 . PMID 19027726 .
- Belyaeva OV, Korkina OV, Stetsenko AV, Kedishvili NY (januari 2008). "Humant retinoldehydrogenas 13 (RDH13) är ett mitokondriellt kortkedjigt dehydrogenas/reduktas med en retinaldehydreduktasaktivitet" . FEBS Journal . 275 (1): 138–47. doi : 10.1111/j.1742-4658.2007.06184.x . PMC 2573044 . PMID 18039331 .
- Alkhaja AK, Jans DC, Nikolov M, Vukotic M, Lytovchenko O, Ludewig F, Schliebs W, Riedel D, Urlaub H, Jakobs S, Deckers M (Jan 2012). "MINOS1 är en konserverad komponent av mitofilinkomplex och krävs för mitokondriell funktion och kristae-organisation" . Cellens molekylärbiologi . 23 (2): 247–57. doi : 10.1091/mbc.E11-09-0774 . PMC 3258170 . PMID 22114354 .
- Haeseleer F, Jang GF, Imanishi Y, Driessen CA, Matsumura M, Nelson PS, Palczewski K (nov 2002). "Dubbelsubstratspecificitet kortkedjiga retinoldehydrogenaser från ryggradsnäthinnan" . Journal of Biological Chemistry . 277 (47): 45537–46. doi : 10.1074/jbc.M208882200 . PMC 1435693 . PMID 12226107 .
Denna artikel innehåller text från United States National Library of Medicine, som är allmän egendom .