PSMB10
PSMB10- | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
identifierare | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
, LMP10, MECL1, beta2i, proteasomsubenhet beta 10, proteasom 20S subenhet beta 10, PRAAS5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Externa IDs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Proteasomsubenhet beta typ-10 som kallas 20S proteasomsubenhet beta-2i är ett protein som hos människor kodas av PSMB10 -genen .
Detta protein har en viktig roll i immunsystemet som en del av en immunoproteasom som primärt induceras vid infektion och bildas genom att ersätta konstitutiva beta-subenheter med inducerbara beta-subenheter som har specifika klyvningsegenskaper som hjälper till vid frisättningen av peptider som är nödvändiga för MHC klass I-antigen presentation. Immunoproteasomen verkar ha en avgörande roll för att modulera NFκB-signalering.
Strukturera
Gen
Denna gen PSMB10 kodar för en medlem av proteasom B-typ familjen, även känd som T1B familjen, det vill säga en 20S kärna beta subenhet. Proteolytisk bearbetning krävs för att generera en mogen subenhet. Uttryck av denna gen induceras av gamma-interferon, och denna genprodukt ersätter den katalytiska subenheten beta2 (proteasomsubenhet beta typ-7) i immunproteasomen. Den humana PSMB10-genen har 8 exoner och lokaliseras i kromosombandet 16q22.1.
Proteinstruktur
Den humana proteinproteasomsubenheten beta typ-8 är 25 kDa stor och består av 234 aminosyror. Det beräknade teoretiska pl för detta protein är 6,07.
Komplex montering
Proteasomsubenhet beta typ-10 är en av de 17 väsentliga subenheterna (alfasubenheter 1-7, konstitutiva betasubenheter 1-7 och inducerbara subenheter inklusive beta1i , beta2i , beta5i ) som bidrar till den fullständiga sammansättningen av 20S proteasomkomplex . Speciellt sätts proteasomsubenheten beta-2i, tillsammans med andra betasubenheter, samman till två heptamera ringar och därefter en proteolytisk kammare för substratnedbrytning. Detta protein innehåller "Trypsin-liknande" aktivitet och kan klyvas efter basiska rester av peptid. Den eukaryota proteasomen kände igen nedbrytbara proteiner, inklusive skadade proteiner för proteinkvalitetskontroll eller viktiga regulatoriska proteinkomponenter för dynamiska biologiska processer. De konstitutiva subenheterna beta1, beta2 och beta 5 (systematisk nomenklatur) kan ersättas av deras inducerbara motsvarigheter beta1i, 2i och 5i när celler behandlas med interferon-y. Det resulterande proteasomkomplexet blir den så kallade immunoproteasomen. En väsentlig funktion hos det modifierade proteasomkomplexet, immunoproteasomen, är bearbetningen av ett flertal MHC klass-I-begränsade T-cellsepitoper.
Proteasomen är ett multikatalytiskt proteinaskomplex med en högordnad 20S kärnstruktur . Denna tunnformade kärnstruktur består av 4 axiellt staplade ringar av 28 icke-identiska underenheter: de två ändringarna är var och en bildad av 7 alfa-underenheter, och de två centrala ringarna är var och en bildad av 7 beta-underenheter. Tre beta-subenheter ( beta1 , beta2 , beta5 ) innehåller var och en ett proteolytiskt aktivt ställe och har distinkta substratpreferenser. Proteasomer är fördelade i eukaryota celler i en hög koncentration och klyver peptider i en ATP / ubiquitin -beroende process i en icke- lysosomal väg.
Fungera
Proteinfunktioner stöds av dess tertiära struktur och dess interaktion med associerande partners. Som en av 28 subenheter av 20S-proteasom bidrar proteinproteasom-subenhet beta typ-2 till att bilda en proteolytisk miljö för substratnedbrytning. Bevis på kristallstrukturerna av isolerat 20S-proteasomkomplex visar att de två ringarna av beta-subenheter bildar en proteolytisk kammare och bibehåller alla sina aktiva proteolysställen i kammaren. Samtidigt bildar ringarna av alfa-subenheter ingången för substrat som kommer in i den proteolytiska kammaren. I ett inaktiverat 20S-proteasomkomplex skyddas porten in i den interna proteolytiska kammaren av de N-terminala svansarna av specifik alfa-subenhet. Denna unika strukturdesign förhindrar slumpmässigt möte mellan proteolytiska aktiva platser och proteinsubstrat, vilket gör proteinnedbrytning till en välreglerad process. 20S proteasomkomplex i sig är vanligtvis funktionellt inaktivt. Den proteolytiska kapaciteten hos 20S kärnpartikel (CP) kan aktiveras när CP associeras med en eller två regulatoriska partiklar (RP) på ena eller båda sidor av alfaringarna. Dessa regulatoriska partiklar inkluderar 19S-proteasomkomplex, 11S-proteasomkomplex, etc. Efter CP-RP-associationen kommer bekräftelsen av vissa alfasubenheter att förändras och följaktligen orsaka att substratets ingångsport öppnas. Förutom RP kan 20S-proteasomerna också effektivt aktiveras av andra milda kemiska behandlingar, såsom exponering för låga nivåer av natriumdodecylsulfat (SDS) eller NP-14.
20S proteasomsubenheten beta-2i (systematisk nomenklatur) uttrycks ursprungligen som en prekursor med 273 aminosyror. Fragmentet av 39 aminosyror vid peptid N-terminalen är väsentligt för korrekt proteinveckning och efterföljande komplex sammansättning. I slutskedet av komplexsammansättningen klyvs det N-terminala fragmentet av beta2i-subenheten, vilket bildar den mogna beta2i-subenheten av 20S-komplexet. Under den basala sammansättningen krävs och proteolytisk bearbetning för att generera en mogen subenhet. Subenheten beta5i finns endast i immunproteasomen och ersätts av subenheten beta5 (proteasom beta 5 subenhet) i konstitutivt 20S proteasomkomplex. Detta protein har en viktig funktion i immunsystemet som en del av en immunoproteasom som har specifika klyvningsegenskaper som hjälper till vid frisättningen av peptider som är nödvändiga för MHC klass I-antigenpresentation.
Klinisk signifikans
Proteasomen och dess subenheter är av klinisk betydelse av minst två skäl: (1) en komprometterad komplex sammansättning eller en dysfunktionell proteasom kan associeras med den underliggande patofysiologin för specifika sjukdomar, och (2) de kan utnyttjas som läkemedelsmål för terapeutiska interventioner. På senare tid har mer ansträngningar gjorts för att överväga proteasomen för utvecklingen av nya diagnostiska markörer och strategier. En förbättrad och heltäckande förståelse av proteasomens patofysiologi bör leda till kliniska tillämpningar i framtiden.
Proteasomerna utgör en central komponent för ubiquitin-proteasomsystemet (UPS) och motsvarande cellulära proteinkvalitetskontroll (PQC). Protein ubiquitination och efterföljande proteolys och nedbrytning av proteasomen är viktiga mekanismer i regleringen av cellcykeln , celltillväxt och differentiering, gentranskription, signaltransduktion och apoptos . Därefter leder en komprometterad sammansättning och funktion av proteasomkomplex till minskade proteolytiska aktiviteter och ackumulering av skadade eller felveckade proteinarter. Sådan proteinackumulering kan bidra till patogenesen och fenotypiska egenskaper vid neurodegenerativa sjukdomar, kardiovaskulära sjukdomar, inflammatoriska svar och autoimmuna sjukdomar, och systemiska DNA-skador som leder till maligniteter .
Flera experimentella och kliniska studier har visat att avvikelser och avregleringar av UPS bidrar till patogenesen av flera neurodegenerativa och myodegenerativa sjukdomar, inklusive Alzheimers sjukdom , Parkinsons sjukdom och Picks sjukdom , Amyotrofisk lateralskleros (ALS), Huntingtons sjukdom, Creutzfeldts sjukdom , –Jakobs sjukdom och motoriska neuronsjukdomar, polyglutaminsjukdomar (PolyQ), muskeldystrofier och flera sällsynta former av neurodegenerativa sjukdomar associerade med demens . Som en del av ubiquitin-proteasomsystemet (UPS) upprätthåller proteasomen hjärtproteinhomeostas och spelar därmed en betydande roll vid ischemisk hjärtskada , ventrikulär hypertrofi och hjärtsvikt . Dessutom ackumuleras bevis för att UPS spelar en viktig roll i malign transformation. UPS-proteolys spelar en viktig roll i cancercellers svar på stimulerande signaler som är avgörande för utvecklingen av cancer. Följaktligen är genuttryck genom nedbrytning av transkriptionsfaktorer , såsom p53 , c-jun , c-Fos , NF-KB , c-Myc , HIF-1α, MATα2, STAT3 , sterolreglerade elementbindande proteiner och androgenreceptorer alla kontrolleras av UPS och därmed involverad i utvecklingen av olika maligniteter. Dessutom reglerar UPS nedbrytningen av tumörsuppressorgenprodukter såsom adenomatös polypos coli ( APC ) i kolorektal cancer, retinoblastom (Rb). och von Hippel–Lindau tumörsuppressor (VHL), såväl som ett antal proto-onkogener ( Raf , Myc , Myb , Rel , Src , Mos , ABL ). UPS är också involverad i regleringen av inflammatoriska svar. Denna aktivitet tillskrivs vanligtvis proteasomernas roll i aktiveringen av NF-KB som ytterligare reglerar uttrycket av pro-inflammatoriska cytokiner såsom TNF-α , IL-β, IL-8 , adhesionsmolekyler ( ICAM-1 , VCAM-1) , P-selektin ) och prostaglandiner och kväveoxid (NO). Dessutom spelar UPS också en roll i inflammatoriska svar som regulatorer av leukocytproliferation, främst genom proteolys av cykliner och nedbrytning av CDK -hämmare. Slutligen, autoimmun sjukdom med SLE , Sjögrens syndrom och reumatoid artrit (RA) uppvisar övervägande cirkulerande proteasomer som kan användas som kliniska biomarkörer.
Under antigenbearbetningen för det stora histokompatibilitetskomplexet (MHC) klass-I, är proteasomen det huvudsakliga nedbrytningsmaskineriet som bryter ned antigenet och presenterar de resulterande peptiderna för cytotoxiska T-lymfocyter. Immunproteasomen har ansetts spela en avgörande roll för att förbättra kvaliteten och kvantiteten av genererade klass I-ligander.
Vidare läsning
- Coux O, Tanaka K, Goldberg AL (1996). "Struktur och funktioner hos 20S- och 26S-proteasomerna". Årlig översyn av biokemi . 65 : 801–47. doi : 10.1146/annurev.bi.65.070196.004101 . PMID 8811196 .
- Goff SP (aug 2003). "Död genom deaminering: ett nytt värdrestriktionssystem för HIV-1" . Cell . 114 (3): 281–3. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00602-0 . PMID 12914693 . S2CID 16340355 .
- Maruyama K, Sugano S (januari 1994). "Oligo-capping: en enkel metod för att ersätta lockstrukturen för eukaryota mRNA med oligoribonukleotider". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
- Hisamatsu H, Shimbara N, Saito Y, Kristensen P, Hendil KB, Fujiwara T, Takahashi E, Tanahashi N, Tamura T, Ichihara A, Tanaka K (april 1996). "Nyligen identifierat par av proteasomala subenheter regleras ömsesidigt av interferon gamma" . Journal of Experimental Medicine . 183 (4): 1807–16. doi : 10.1084/jem.183.4.1807 . PMC 2192534 . PMID 8666937 .
- Seeger M, Ferrell K, Frank R, Dubiel W (mars 1997). "HIV-1 tat hämmar 20S-proteasomen och dess 11S-regulatormedierade aktivering" . Journal of Biological Chemistry . 272 (13): 8145–8. doi : 10.1074/jbc.272.13.8145 . PMID 9079628 .
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (okt 1997). "Konstruktion och karakterisering av ett fullängdsanrikat och ett 5'-ändsanrikat cDNA-bibliotek". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
- Foss GS, Larsen F, Solheim J, Prydz H (Mar 1998). "Konstitutivt och interferon-gamma-inducerat uttryck av den humana proteasomsubenheten multikatalytiskt endopeptidaskomplexliknande 1" . Biochimica et Biophysica Acta . 1402 (1): 17–28. doi : 10.1016/S0167-4889(97)00152-3 . PMID 9551082 .
- Madani N, Kabat D (dec 1998). "En endogen hämmare av humant immunbristvirus i humana lymfocyter övervinns av det virala Vif-proteinet" . Journal of Virology . 72 (12): 10251–5. doi : 10.1128/JVI.72.12.10251-10255.1998 . PMC 110608 . PMID 9811770 .
- Simon JH, Gaddis NC, Fouchier RA, Malim MH (dec 1998). "Bevis för en nyupptäckt cellulär anti-HIV-1-fenotyp". Naturmedicin . 4 (12): 1397–400. doi : 10.1038/3987 . PMID 9846577 . S2CID 25235070 .
- Schmidt M, Zantopf D, Kraft R, Kostka S, Preissner R, Kloetzel PM (april 1999). "Sekvensinformation inom proteasomala prosekvenser förmedlar effektiv integration av beta-subenheter i 20S-proteasomkomplexet". Journal of Molecular Biology . 288 (1): 117–28. doi : 10.1006/jmbi.1999.2660 . PMID 10329130 .
- Elenich LA, Nandi D, Kent AE, McCluskey TS, Cruz M, Iyer MN, Woodward EC, Conn CW, Ochoa AL, Ginsburg DB, Monaco JJ (sep 1999). "Den kompletta primära strukturen för mus 20S-proteasomer". Immunogenetik . 49 (10): 835–42. doi : 10.1007/s002510050562 . PMID 10436176 . S2CID 20977116 .
- Mulder LC, Muesing MA (sep 2000). "Nedbrytning av HIV-1-integras genom N-end-regelvägen" . Journal of Biological Chemistry . 275 (38): 29749–53. doi : 10.1074/jbc.M004670200 . PMID 10893419 .
- Sheehy AM, Gaddis NC, Choi JD, Malim MH (aug 2002). "Isolering av en mänsklig gen som hämmar HIV-1-infektion och undertrycks av det virala Vif-proteinet". Naturen . 418 (6898): 646–50. Bibcode : 2002Natur.418..646S . doi : 10.1038/nature00939 . PMID 12167863 . S2CID 4403228 .
- Chagnon P, Michaud J, Mitchell G, Mercier J, Marion JF, Drouin E, Rasquin-Weber A, Hudson TJ, Richter A (dec 2002). "En missense-mutation (R565W) i cirhin (FLJ14728) i nordamerikansk indisk barndomscirros" . American Journal of Human Genetics . 71 (6): 1443–9. doi : 10.1086/344580 . PMC 378590 . PMID 12417987 .
- Huang X, Seifert U, Salzmann U, Henklein P, Preissner R, Henke W, Sijts AJ, Kloetzel PM, Dubiel W (november 2002). "RTP-platsen som delas av HIV-1 Tat-proteinet och 11S-regulatorsubenheten alfa är avgörande för deras effekter på proteasomfunktionen inklusive antigenbearbetning". Journal of Molecular Biology . 323 (4): 771–82. doi : 10.1016/S0022-2836(02)00998-1 . PMID 12419264 .
- Miyagi T, Tatsumi T, Takehara T, Kanto T, Kuzushita N, Sugimoto Y, Jinushi M, Kasahara A, Sasaki Y, Hori M, Hayashi N (januari 2003). "Försämrat uttryck av proteasomsubenheter och humana leukocytantigener klass I i humana koloncancerceller". Journal of Gastroenterology and Hepatology . 18 (1): 32–40. doi : 10.1046/j.1440-1746.2003.02921.x . PMID 12519221 . S2CID 22831880 .
- Gaddis NC, Chertova E, Sheehy AM, Henderson LE, Malim MH (maj 2003). "Omfattande undersökning av den molekylära defekten i vif-defekta humana immunbristvirus typ 1 virioner" . Journal of Virology . 77 (10): 5810–20. doi : 10.1128/JVI.77.10.5810-5820.2003 . PMC 154025 . PMID 12719574 .