PSMC5
| PSMC5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identifierare | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , S8, SUG-1, SUG1, TBP10, TRIP1, p45, p45/SUG, proteasom 26S subenhet, ATPase 5, RPT6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Externa IDs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26S-proteasregulatorisk subenhet 8 , även känd som 26S-proteasom AAA-ATPas-subenhet Rpt6, är ett enzym som hos människor kodas av PSMC5 - genen . Detta protein är en av de 19 väsentliga subenheterna i ett komplett sammansatt 19S proteasomkomplex Sex 26S proteasom AAA-ATPas subenheter ( Rpt1 , Rpt2 , Rpt3 , Rpt4 , Rpt5 och Rpt6 (detta protein)) tillsammans med fyra icke-ATPase subenheter ( Rpn1 ) Rpn2 , Rpn10 och Rpn13 ) bildar bassubkomplexet av 19S regulatorisk partikel för proteasomkomplex .
Gen
Genen PSMC5 kodar för en av ATPas-subenheterna, en medlem av trippel-A-familjen av ATPaser som har en chaperonliknande aktivitet. Förutom deltagande i proteasomfunktioner kan denna subenhet delta i transkriptionsreglering eftersom den har visats interagera med sköldkörtelhormonreceptorn och retinoid X-receptor-alfa. Den humana PSMC5- genen har 13 exoner och lokaliseras i kromosombandet 17q23.3.
Protein
Det humana proteinet 26S proteasreglerande subenhet 8 är 45,6 kDa i storlek och består av 406 aminosyror. Det beräknade teoretiska pl för detta protein är 8,23.
Komplex montering
26S proteasomkomplex består vanligtvis av en 20S kärnpartikel (CP eller 20S proteasom) och en eller två 19S regulatoriska partiklar (RP, eller 19S proteasom) på endera sidan eller båda sidor av den tunnformade 20S. CP och RP avser distinkta strukturella egenskaper och biologiska funktioner. I korthet presenterar 20S subkomplex tre typer av proteolytiska aktiviteter, inklusive kaspasliknande, trypsinliknande och kymotrypsinliknande aktiviteter. Dessa proteolytiska aktiva ställen belägna på insidan av en kammare bildad av 4 staplade ringar av 20S subenheter, förhindrar slumpmässigt möte mellan proteiner och enzymer och okontrollerad proteinnedbrytning. 19S regulatoriska partiklar kan känna igen ubiquitin -märkt protein som nedbrytningssubstrat, veckla ut proteinet till linjärt, öppna porten för 20S kärnpartikel och styra substaten in i den proteolytiska kammaren. För att möta sådan funktionell komplexitet innehåller 19S regulatorisk partikel minst 18 konstitutiva subenheter. Dessa subenheter kan kategoriseras i två klasser baserat på ATP-beroendet av subenheter, ATP-beroende subenheter och ATP-oberoende subenheter. Enligt proteininteraktionen och topologiska egenskaperna hos detta multisubunit-komplex, är den regulatoriska 19S-partikeln sammansatt av en bas och ett locksubkomplex. Basen består av en ring av sex AAA ATPaser (underenhet Rpt1-6, systematisk nomenklatur) och fyra icke-ATPas subenheter ( Rpnl , Rpn2 , Rpn10 och Rpn13). Således är 26S proteasregulatorisk subenhet 4 (Rpt2) en väsentlig komponent för att bilda bassubkomplexet av 19S regulatorisk partikel. För sammansättningen av 19S bassubkomplex identifierades fyra uppsättningar av pivotala monteringsförband (Hsm3/S5b, Nas2/P27, Nas6/P28 och Rpn14/PAAF1, nomenklatur i jäst/däggdjur) av fyra grupper oberoende. Dessa 19S regulatoriska partikelbasdedikerade chaperoner binder alla till individuella ATPas-subenheter genom de C-terminala regionerna. Till exempel binder Hsm3/S5b till subenheten Rpt1 och Rpt2 (detta protein), Nas2/p27 till Rpt5 , Nas6/p28 till Rpt3 respektive Rpn14/PAAAF1 till Rpt6 (detta protein). Därefter bildas tre mellanliggande monteringsmoduler enligt följande, Nas6/p28-Rpt3-Rpt6-Rpn14/PAAF1-modulen, Nas2/p27-Rpt4-Rpt5-modulen och Hsm3/S5b-Rpt1-Rpt2-Rpn2-modulen. Så småningom sätts dessa tre moduler samman för att bilda den heterohexameriska ringen av 6 atlaser med Rpn1. Det sista tillägget av Rpn13 indikerar slutförandet av 19S bas subkomplex montering.
Fungera
Som nedbrytningsmaskineriet som är ansvarigt för ~70% av intracellulär proteolys, spelar proteasomkomplex (26S-proteasom) en avgörande roll för att upprätthålla homeostasen av cellulärt proteom. Följaktligen måste felveckade proteiner och skadat protein kontinuerligt avlägsnas för att återvinna aminosyror för ny syntes; parallellt uppfyller vissa regulatoriska nyckelproteiner sina biologiska funktioner via selektiv nedbrytning; dessutom spjälkas proteiner till peptider för MHC klass I-antigenpresentation. För att möta sådana komplicerade krav i biologisk process via rumslig och tidsmässig proteolys måste proteinsubstrat kännas igen, rekryteras och så småningom hydrolyseras på ett väl kontrollerat sätt. Således har 19S regulatoriska partiklar en serie viktiga förmågor för att hantera dessa funktionella utmaningar. För att känna igen protein som betecknat substrat har 19S-komplexet subenheter som är kapabla att känna igen proteiner med en speciell nedbrytande tagg, ubiquitinylering. Den har också subenheter som kan binda till nukleotider (t.ex. ATP) för att underlätta associeringen mellan 19S- och 20S-partiklar, samt för att orsaka bekräftelseförändringar av alfa-subenhets C-terminaler som bildar substatsingången till 20S-komplexet.
ATPas-subenheterna sätts samman till en sexledad ring med en sekvens av Rpt1–Rpt5–Rpt4–Rpt3–Rpt6–Rpt2, som interagerar med den sjuledade alfaringen av 20S kärnpartikel och etablerar ett asymmetriskt gränssnitt mellan 19S RP och 20S CP. Tre C-terminala svansar med HbYX-motiv av distinkta Rpt ATPaser infogas i fickor mellan två definierade alfa-subenheter av CP och reglerar portöppningen av de centrala kanalerna i CP-alfaringen. Bevis visade att ATPase-subenhet Rpt5, tillsammans med andra ubuiqintinerade 19S-proteasomsubenheter ( Rpn13 , Rpn10 ) och det deubiquitinerande enzymet Uch37, kan ubiquitineras in situ av proteasomassocierade ubiquitineringsenzymer. Ubiquitination av proteasomsubenheter kan reglera proteasomal aktivitet som svar på förändringen av cellulära ubiquitinationsnivåer.
Interaktioner
PSMC5 har visat sig interagera med:
- PSMC3 ,
- PSMC4 ,
- Sp1 transkriptionsfaktor och
- XPB .
Barn med PSMC5-mutationer
Från och med 2021 har endast 18 rapporter om barn med PSMC5-mutationer upptäckts. <GeneMatcher> Det finns en stiftelse som bedriver forskning med barn som har PSMC5-mutationer som kallas PSMC5 Foundation, www.psmc5.org . Syftet är att hitta terapier och lära sig mer om hur man löser problem med mutationer. De vanligaste effekterna har varit utvecklingsförseningar, allt från motoriska förseningar till minimalt uttrycksfullt språk.
Vidare läsning
- Coux O, Tanaka K, Goldberg AL (1996). "Struktur och funktioner hos 20S- och 26S-proteasomerna". Annu. Rev. Biochem . 65 (1): 801–47. doi : 10.1146/annurev.bi.65.070196.004101 . PMID 8811196 .
- Goff SP (2003). "Död genom deaminering: ett nytt värdrestriktionssystem för HIV-1" . Cell . 114 (3): 281–3. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00602-0 . PMID 12914693 . S2CID 16340355 .
- Nelbock P, Dillon PJ, Perkins A, Rosen CA (1990). "Ett cDNA för ett protein som interagerar med det mänskliga immunbristviruset Tat-transaktivatorn". Vetenskap . 248 (4963): 1650–3. Bibcode : 1990Sci...248.1650N . doi : 10.1126/science.2194290 . PMID 2194290 .
- Akiyama K, Yokota K, Kagawa S, Shimbara N, DeMartino GN, Slaughter CA, Noda C, Tanaka K (1995). "cDNA-kloning av en ny förmodad ATPase-subenhet p45 av den humana 26S-proteasomen, en homolog av jästtranskriptionsfaktor Sug1p" . FEBS Lett . 363 (1–2): 151–6. doi : 10.1016/0014-5793(95)00304-R . PMID 7729537 . S2CID 638369 .
- Lee JW, Choi HS, Gyuris J, Brent R, Moore DD (1995). "Två klasser av proteiner beroende på antingen närvaron eller frånvaron av sköldkörtelhormon för interaktion med sköldkörtelhormonreceptorn" . Mol. Endokrinol . 9 (2): 243–54. doi : 10.1210/mend.9.2.7776974 . PMID 7776974 .
- Lee JW, Ryan F, Swaffield JC, Johnston SA, Moore DD (1995). "Interaktion av sköldkörtelhormonreceptor med en konserverad transkriptionsmediator". Naturen . 374 (6517): 91–4. Bibcode : 1995Natur.374...91L . doi : 10.1038/374091a0 . PMID 7870181 . S2CID 4324595 .
- Shaw DR, Ennis HL (1993). "Molekylär kloning och utvecklingsreglering av Dictyostelium discoideum homologer av humant och jäst HIV1 Tat-bindande protein". Biochem. Biophys. Res. Commun . 193 (3): 1291–6. doi : 10.1006/bbrc.1993.1765 . PMID 8323548 .
- Ohana B, Moore PA, Ruben SM, Southgate CD, Green MR, Rosen CA (1993). "Tat-bindande protein för humant immunbristvirus av typ 1 är en transkriptionell aktivator som tillhör en ytterligare familj av evolutionärt konserverade gener. " Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 90 (1): 138–42. Bibcode : 1993PNAS...90..138O . doi : 10.1073/pnas.90.1.138 . PMC 45615 . PMID 8419915 .
- Dubiel W, Ferrell K, Rechsteiner M (1993). "Peptidsekvensering identifierar MSS1, en modulator av HIV Tat-medierad transaktivering, som subenhet 7 av 26 S-proteaset" . FEBS Lett . 323 (3): 276–8. doi : 10.1016/0014-5793(93)81356-5 . PMID 8500623 . S2CID 26726988 .
- vom Baur E, Zechel C, Heery D, Heine MJ, Garnier JM, Vivat V, Le Douarin B, Gronemeyer H, Chambon P, Losson R (1996). "Differentiella ligandberoende interaktioner mellan AF-2-aktiverande domän av nukleära receptorer och de förmodade transkriptionella intermediära faktorerna mSUG1 och TIF1" . EMBO J . 15 (1): 110–24. doi : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00339.x . PMC 449923 . PMID 8598193 .
- Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (1996). "En "dubbel adapter"-metod för förbättrad konstruktion av hagelgevärsbibliotek. Anal. Biochem . 236 (1): 107–13. doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
- Wang W, Chevray PM, Nathans D (1996). "Däggdjur Sug1 och c-Fos i den nukleära 26S-proteasomen" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (16): 8236–40. Bibcode : 1996PNAS...93.8236W . doi : 10.1073/pnas.93.16.8236 . PMC 38653 . PMID 8710853 .
- Seeger M, Ferrell K, Frank R, Dubiel W (1997). "HIV-1 tat hämmar 20S-proteasomen och dess 11S-regulatormedierade aktivering" . J. Biol. Chem . 272 (13): 8145–8. doi : 10.1074/jbc.272.13.8145 . PMID 9079628 .
- Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (1997). "Storskalig sammanlänkning av cDNA-sekvensering" . Genome Res . 7 (4): 353–8. doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 .
- Weeda G, Rossignol M, Fraser RA, Winkler GS, Vermeulen W, van 't Veer LJ, Ma L, Hoeijmakers JH, Egly JM (1997). "XPB-underenheten av reparations-/transkriptionsfaktor TFIIH interagerar direkt med SUG1, en underenhet av 26S-proteasomen och förmodad transkriptionsfaktor" . Nucleic Acids Res . 25 (12): 2274–83. doi : 10.1093/nar/25.12.2274 . PMC 146752 . PMID 9173976 .
- Chen Y, Sharp ZD, Lee WH (1997). "HEC binder till den sjunde regulatoriska subenheten av 26S-proteasomen och modulerar proteolysen av mitotiska cykliner" . J. Biol. Chem . 272 (38): 24081–7. doi : 10.1074/jbc.272.38.24081 . PMID 9295362 .
- Tipler CP, Hutchon SP, Hendil K, Tanaka K, Fishel S, Mayer RJ (1998). "Rening och karakterisering av 26S-proteasomer från mänskliga och musspermatozoer" . Mol. Brum. Reprod . 3 (12): 1053–60. doi : 10.1093/molh/3.12.1053 . PMID 9464850 .