HLA-B39
|
||
| HLA-B (alfa)-β2MG med bunden peptid | ||
|
major histokompatibilitetskomplex (humant), klass I, B39
|
||
| Alleler | B*3901, 3902, 3903, . . | |
| Struktur (Se HLA-B ) | ||
| Delad data | ||
| Ställe | chr.6 6p21.31 | |
HLA-B39 (B39) är en HLA - B- serotyp . Serotypen identifierar de vanligare HLA-B*39-genprodukterna.
B39 är ett delat antigen av det breda antigenet B16 och är en systertyp till B38 . B39 är vanligast på den västra Stillahavskanten, i Japan och högst frekvens i den nya världen. I Europa finns den i Skandinavien och norra Ryssland.
Serotyp
| B*39 | B39 | B16 | B38 | Prov | |
| allel | % | % | % | storlek (N) | |
| 95 | 476 | ||||
| 87 | 96 | ||||
| 77 | 20 | ||||
| 82 | 245 | ||||
| 94 | 508 | ||||
| 48 | 57 | ||||
| 97 | 13 | ||||
| 82 | 127 | ||||
| 69 | 16 | ||||
| Alleler länkar ut till IMGT/ HLA Database vid EBI | |||||
Serologin för de vanligaste B39-allelerna, B*3901 och B*3906 är bra, men vissa allelprodukter är inte väl detekterade. Med tanke på den differentiella inblandningen av dessa alleler i sjukdomstestning bör det innebära högupplöst typning.
| frekv | ||
| ref. | Befolkning | (%) |
| Venezuela Perja Mountain Bari | 23.9 | |
| Mexiko Mixtec Oaxaca | 8.8 | |
| USA Arizona Pima | 7.3 | |
| USA South Texas Hispanics | 5.6 | |
| Mexiko Zaptotec Oaxaca | 4.5 | |
| New Mexico Canoncito Navajo | 3.7 | |
| oman | 2.5 | |
| PNG Wanigela | 2.3 | |
| Tunisien Tunis | 2.3 | |
| Nordamerikanska infödda | 1.9 | |
| USA spansktalande | 1.7 | |
| Brasilien Belo Horizonte | 1.6 | |
| South Dakota Lakota Sioux | 1.5 | |
| Kubansk vit | 1.4 | |
| Azorerna S. Maria & S. Miguel | 1.3 | |
| Australien New South Wales | 1.1 | |
| Finland | 1.1 | |
| Portugal norr | 1.1 | |
| Portugal Center | 1.0 | |
| Spanien Östra Andalusien Gipsy | 1.0 | |
| Brasilien Terena | 0,9 | |
| Irland norra | 0,9 | |
| Azorerna Terceira Island | 0,8 | |
| USA kaukasisk pop2 | 0,8 | |
| Brasilien | 0,7 | |
| USA Philadelphia kaukasier | 0,7 | |
| Indien Andhra Pradesh Golla | 0,5 | |
| Thailand | 0,4 |
Alleler
| frekv | ||
| ref. | Befolkning | (%) |
| Taiwan Saisiat | 54,9 | |
| Taiwan Tsou | 24.5 | |
| South Dakota Lakota Sioux | 22.5 | |
| Taiwan Taroko | 21.8 | |
| Taiwan Atayal | 19.8 | |
| PNG Wanigela | 16.7 | |
| Japan Ainu Hokkaido | 16,0 | |
| Taiwan Bunun | 14.9 | |
| New Mexico Canoncito Navajo | 14.6 | |
| Taiwan Thao | 13.3 | |
| Taiwan Rukai | 13,0 | |
| Taiwan Ami | 10.2 | |
| USA Hawaii Okinawa | 7.7 | |
| Papua Nya Guinea Wosera | 7,0 | |
| Papua Nya Guinea Madang | 6.4 | |
| Mexiko Mixtec Oaxaca | 5.9 | |
| Taiwan Puyuma | 5.0 | |
| Taiwan Paiwan | 4.9 | |
| Nya Kaledonien | 4.8 | |
| Centrala Japan | 4.4 | |
| Amerikanska Samoa | 4.0 | |
| USA nordamerikanska infödda | 4.0 | |
| Taiwan Hakka | 3.6 | |
| Indig. Australiensiska Cape York-halvön | 3.5 | |
| Japan (5) | 3.5 | |
| Filippinerna Ivatan | 3.0 | |
| Brasilien | 2.9 | |
| Kina Guangxi Maonan | 2.8 | |
| Georgia Tbilisi georgier | 2.8 | |
| Kina Yunnan Nu | 2.6 | |
| Thailand | 2.5 | |
| Azorerna Terceira Island | 2.4 | |
| Singapore kinesiska | 2.4 | |
| rumänska | 2.3 | |
| Kina Yunnan Lisu | 2.2 | |
| Indig. australiska Yuendumu | 2.1 | |
| Kina Guangzhou | 2.0 | |
| Kroatien | 2.0 | |
| Frankrike sydöstra | 1.9 | |
| Georgia Svaneti Svans | 1.9 | |
| PNG Karimui-platån | 1.9 | |
| Azorerna Centralöarna | 1.8 | |
| Spanien Östra Andalusien | 1.8 | |
| Uganda Kampala | 1.6 | |
| Mexiko Zaptotec Oaxaca | 1.5 | |
| Singapore Thai | 1.5 | |
| Kina Guangzhou Han | 1.4 | |
| Kina Qinghai Hui | 1.4 | |
| Tjeckien | 1.4 | |
| Madeira | 1.4 | |
| Indig. australiensiska Kimberly | 1.3 | |
| Finland | 1.1 |
Sjukdom
B39 föreslås vara en faktor i Takayasus arterit och gallsten i Mexiko. Osteoartikulära komplikationer av brucellos verkar vara associerade med B39. Ett samband med spondylartropatier och psoriasisartrit observerades i flera studier. Psoriasisartrit verkar vara kopplad till MICA -A9 som är tätt kopplad till HLA-B39. B39 verkar också vara involverad i Fishers syndromvarianten av Guillain–Barrés syndrom .
B39 verkar vara skyddande mot kardiomyopati vid Chagas sjukdom, vilket indikerar en möjlig selektiv faktor i dess uppgång i den nya världen. Chagas sjukdom orsakas av en trypanosom som bärs av en blodsugande insekt som finns i tropiska palmodlingsområden.
Södra Kalifornien rapporterar nu fall av Chagas sjukdom från kontaminerade transfusioner och kan redan vara en livsmiljö för vektorn.
I Takayasus arterit
Takayasus arterit verkar ha en koppling till B39. Sambandet med B*3902 ökar risken för lunginfarkt , ischemisk hjärtsjukdom , aortauppstötningar , systemisk hypertoni , njurartärstenos , cerebrovaskulär sjukdom och synstörningar. B*3906, vanlig hos inhemska mesoamerikaner, har funnits associerad med samma sjukdom.
| frekv | ||
| ref. | Befolkning | (%) |
| Mexico Mixe Oaxaca | 38,7 | |
| Mexiko Zaptotec Oaxaca | 13.4 | |
| Mexiko Mixtec Oaxaca | 5.9 | |
| Mexikos mestiser | 1.2 | |
| Japansk pop5 | 0,9 | |
| Kubansk vit | 0,7 | |
| Israel Ashk. och Non Ashk. judar | 0,5 | |
| Centrala Japan | 0,5 | |
| Senegal Niokholo Mandenka | 0,5 | |
| B*3903 | ||
|---|---|---|
| PNG New Britain Rabaul | 13.2 | |
| Brasilien Terena | 11.2 | |
| Argentina Toba Rosario | 5.2 | |
| Brasilien | 0,7 | |
| Finland | 0,6 | |
| Kenya Luo | 0,6 | |
| Nordamerikanska infödda | 0,5 | |
| B*3904 | ||
| Argentina Toba Rosario | 1.2 | |
| Georgia Svaneti Svans | 0,6 | |
| Jordan Amman | 0,3 | |
| Shijiazhuang Tianjian Han | 0,1 | |
| Centrala Japan | 0,1 | |
| rumänska | 0,1 | |
| B*3905 | ||
| Venezuela Perija Yucpa | 36.1 | |
| Mexiko Zaptotec Oaxaca | 12.7 | |
| Mexiko Mixtec Oaxaca | 9.8 | |
| Mexikos mestiser | 4.9 | |
| Arizona Pima | 4.5 | |
| Mexiko Guadalajara Mestizos | 2.4 | |
| Argentina Toba Rosario | 2.3 | |
| USA spansktalande | 2.1 | |
| Mexico Mixe Oaxaca | 1.9 | |
| Kubansk vit | 1.4 | |
| Mexiko Chihuahua Tarahumara | 1.1 | |
| USA:s nordamerikanska infödda | 0,5 | |
| Shijiazhuang Tianjian Han | 0,2 | |
| B*3907 | ||
| Shijiazhuang Tianjian Han | 0,6 | |
| Singapore Thai | 0,5 | |
| Kina södra Han | 0,2 | |
| B*3908 | ||
| Mexiko Zaptotec Oaxaca | 2.2 | |
| Mexikos mestiser | 1.2 | |
| Mexiko Mixtec Oaxaca | 1.0 | |
| Brasilien | 0,7 | |
| USA spansktalande | 0,6 | |
| B*3909 | ||
| Venezuela Perija Yucpa | 34,9 | |
| Thailand pop3 | 3.1 | |
| Brasilien Terena | 1.7 | |
| Kina södra Han | 1.4 | |
| Argentina Toba Rosario | 1.2 | |
| Kina Qinghai Hui | 0,9 | |
| B*3910 | ||
| sudanesiska | 2.5 | |
| Senegal Niokholo Mandenka | 2.1 | |
| Sydafrikanska Natal Zulu | 1.5 | |
| Kamerun Beti | 1.4 | |
| Spanien Östra Andalusien | 1.2 | |
| Kenya Luo | 1.1 | |
| Israel Arab Druse | 1.0 | |
| Kenya Nandi | 1.0 | |
| Guinea Bissau | 0,8 | |
| Kenya | 0,7 | |
| Mali Bandiagara | 0,7 | |
| Marocko Nador Metalsa klass I | 0,7 | |
| Kamerun Bamileke | 0,6 | |
| Kamerun Yaounde | 0,5 | |
| Israel Ashk. och Non Ashk. judar | 0,5 | |
| Saudiarabien Guraiat och Hail | 0,5 | |