HLA-B47
större histokompatibilitetskomplex (människa), klass I, B47
|
||
Alleler |
B*4701 B*4702 B*4703 |
|
Struktur (se HLA-B ) | ||
Symbol(er) | HLA-B | |
EBI-HLA | B*4701 | |
EBI-HLA | B*4702 | |
EBI-HLA | B*4703 | |
Ställe | chr.6 6p21.31 |
HLA-B47 (B47) är en HLA – B serotyp . Serotypen identifierar HLA-B*47-genprodukterna (B*4701, B*4702, B*4703). Jämförelse av B47-nukleotidsekvenser med andra HLA-B-sekvenser visar ett segment på 228 bp identiskt med B44 i alfa 1-domänen och ett segment på 218 bp identiskt med B27 i alfa 2-domänen, men endast ett 91 bp segment av identitet med B13 i alfa 1-domänen. Det komplexa mönstret av substitutioner och deras grad av divergens indikerar att HLA-B13- och HLA-Bw47-alleler inte är relaterade till en enkel mutationshändelse. B47 är kopplat till (nära på kromosomen) en gen som orsakar binjurebrist. B47 är generellt låg i frekvens och med högsta kända frekvenser i Central- och Västafrika. (För terminologihjälp se: HLA-serotyphandledning )
Serotyp
B*47 | B47 | Övrig | Prov |
allel | % | % | storlek (N) |
4701 | 50 | 37 | 317 |
4702 | 40 | 40 | 5 |
4703 | 25 | 50 | 4 |
Serotypning för B47 är dålig och typning utförs bäst med SSP-PCR eller gensekvensering.
Sjukdomsföreningar
B47 är kopplat till adrenal 21-hydroxylasbrist . CYP21 - genen är belägen nära B47 mellan HLA-B och HLA-DRB1 lokus.
B*4701 frekvenser
frekv | ||
ref. | Befolkning | (%) |
Bamileke ( Kamerun ) | 2.6 | |
Zapotec ( Oaxaca , Mexiko ) | 2.2 | |
Niokholo Mandinka ( Senegal ) | 1.6 | |
Mbenzele Pygmy (CAR) | 1.5 | |
Nandi (Kenya) | 1.3 | |
sudanesiska | 1.3 | |
Yaoundé City (Kamerun) | 1.1 | |
Lusaka ( Zambia ) | 1.1 | |
Centrala Portugal | 1.0 | |
Bulgarien | 0,9 | |
Tjeckien | 0,9 | |
Kap Verdeöarna | 0,8 | |
Berber ( Marocko ) | 0,7 | |
Finland | 0,6 | |
Svans ( Georgien ) | 0,6 | |
Bergamo (Italien) | 0,6 | |
rumäner | 0,6 | |
North Delhi ((Indien)) | 0,5 | |
Orkneyöarna ( Skottland ) | 0,5 | |
baskiska ( Gipuzkoa , Spanien) | 0,5 | |
Sydöstra (Frankrike) | 0,4 | |
oman | 0,4 | |
Kenya | 0,3 |