HLA-B52

Illustration of HLA-B with peptide in the binding pocket.
B*5101-β2MG med bunden peptid <a i=1>​major
major histocompatibility complex (human), class I, B52
Alleler B*5201, 5202, 5203, . . .
Struktur (Se HLA-B )
Delad data
Ställe chr.6 6p21.31

HLA-B52 (B52) är en HLA - B- serotyp . Serotypen identifierar de vanligare HLA-B*52-genprodukterna.

B52 är ett delat antigen av det breda antigenet B5 och är en systertyp till B51 . B*5201 bildades sannolikt som ett resultat av en genomvandlingshändelse mellan en annan HLA-B-allel och HLA-B*5101. Det finns ett antal alleler inom B*52-allelgruppen.

Serotyp

Serotyper B52, B5, B51 och B53 igenkänning av HLA B*5201 genprodukt
B*52 B52 B5 B51 B53 Prov
allel % % % % storlek (N)
84 2 7 1 2823
Alleler länkar ut till IMGT/ HLA Database vid EBI
HLA *5201 frekvenser
frekv
ref. Befolkning (%)
Kina Yunnan Lisu 21.7
Kina Yunnan Nu 18.6
Bulgarien Gipsy 18.2
Venezuela Sierra de Perija Yucpa 12.8
Indien Andhra Pradesh Golla 12,0
Centrala Japan 10.7
Japan 10.4
Georgien Tbilisi kurder 10.3
Mali Bandiagara 8.3
Sydafrika Natal Tamil 8.2
Israel Ashk. och icke-ask. judar 7.3
Indien norra hinduer 6.7
Kina Peking 6.1
Indien New Delhi 6.1
Indien Mumbai Marathas 5.6
Tunisien Ghannouch 5.5
Thailand pop3 5.1
Indiens västkust Parsis 5.0
Indien norra Delhi 4.9
Mexikos mestiser 4.9
Argentina Toba Rosario 4.7
Mexiko Zaptotec Oaxaca 4.5
USA spansktalande 4.5
Kina Qinghai Hui 4.1
Kina Inre Mongoliet 3.9
Kina North Han 3.8
oman 3.8
Senegal Niokholo Mandenka 3.7
Bulgarien 3.6
Thailand 3.5
Elfenbenskusten Akan Adiopodoume 3.4
Venezuela Perja Mountain Bari 3.4
Italien North pop 1 3.3
sudanesiska 3.3
rumänska 3.2
Singapore Riau Malay 3.0
Tibetaner i den autonoma regionen 2.8
Ryssland Tuva pop 2 2.8
Sydkorea pop 3 2.8
Iran Baloch 2.5
Tunisien 2.5
Jordan Amman 2.4
USA Hawaii Okinawa 2.4
Singapore javanesiska indoneser 2.0
Spanien Östra Andalusien 1.8
Makedonien pop 4 1.6
Uganda Kampala 1.6
Belgien 1.5
Mexiko Guadalajara Mestizos pop2 1.5
Singapore Thai 1.5
Brasilien 1.4
Kina Yunnan Lisu 1.4
Azorerna Santa Maria och Sao Miguel 1.3
Frankrike sydöstra 1.2
Italien Norra Pavia 1.2
Saudiarabien Guraiat och Hail 1.2
Mexiko Chihuahua State Tarahumara 1.1
Tunisien Tunis 1.1
Israel Arab Druse 1.0
Japan Ainu Hokkaido 1.0
Portugal Center 1.0
Singapore kinesiska 1.0
Taiwan Minnan pop 1 1.0
USA kaukasiska 1.0
Azorerna Centralöarna 0,9
Kina södra Han 0,9
Makedonien pop 4 0,7
Marocko Nador Metalsa klass I 0,7
Georgia Svaneti Svans 0,6
Södra Irland 0,6
Italien Bergamo 0,6

Alleler

Det finns 18 alleler, med 14 aminosyrasekvensvarianter i B52. Av dessa är endast 9 tillräckligt frekventa för att ha serotypats på ett tillförlitligt sätt. B*5201 är den vanligaste, men andra har ett stort regionalt överflöd.

Sjukdom

Vid ulcerös kolit

HLA-B52 verkar ha den starkaste kopplingen till ulcerös kolit i Japan. Denna form av sjukdom finns ofta med Takayasus arterit .

I Takayasus arterit

Takayasus arterit verkar ha en oberoende koppling till B52-associerad sjukdom. Sambandet med B*5201 ökar risken för lunginfarkt , ischemisk hjärtsjukdom , aortauppstötningar , systemisk hypertoni , njurartärstenos , cerebrovaskulär sjukdom och synstörningar.