VP40
| VP40 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 VP40 matrisproteinhexamer,
| |||||||||
| ebolavirusidentifierare | |||||||||
| Symbol | VP40 | ||||||||
| Pfam | PF07447 | ||||||||
| InterPro | IPR008986 | ||||||||
| SCOP2 | 1h2c / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Inom molekylärbiologi är VP40 namnet på ett viralt matrisprotein . Vanligast förekommer det i ebolaviruset (EBOV), en typ av icke-segmenterat, negativt-strängat RNA - virus . Ebolavirus orsakar en allvarlig och ofta dödlig blödningsfeber hos människor , känd som ebolavirussjukdom . Virusmatrisproteinet VP40 är ett viktigt strukturellt protein som spelar en central roll i virussammansättning och knoppning vid plasmamembranet hos infekterade celler . VP40- proteiner fungerar genom att associera med cellulära membran, interagera med de cytoplasmatiska svansarna av glykoproteiner och binda till ribonukleoproteinkomplexet . [ citat behövs ]
Strukturera
VP40- monomeren består av två proteindomäner , den N-terminala oligomeriseringsdomänen och den C-terminala membranbindande domänen, sammankopplade med en flexibel linker. Både de N- och C-terminala domänerna viks till beta-sandwichstrukturer med liknande topologi. Inom den N-terminala domänen finns två överlappande L-domäner med sekvenserna PTAP och PPEY vid resterna 7 till 13, vilka krävs för effektiv knoppning. L-domäner tros förmedla sin funktion i knoppning genom deras interaktion med specifika värdcellulära proteiner, såsom TSG101 och vps-4.
Fungera
ebolavirusets virala livscykel . Dessa inkluderar: reglering av viral transkription , morfogenes , packning och spirande av mogna virioner.
VP40 går igenom mellanliggande monteringstillstånd (t.ex. oktamerer). Det har noterats att proteiner som kodas av EBOV (VP30, VP35 och VP40) fungerar oberoende som suppressorer av RNA-tystnad , vilket indikerar att viruset aktivt motstår cellulärt RNAi under replikering.
Betydelsen av VP40
Studie av matrisproteinet VP40 är viktig på grund av den höga dödligheten av ebolaviruset, som är listat som en WHO riskgrupp 4 patogen, ett HHS Select Agent , en NIH / NIAID Kategori A prioriterad patogen, en CDC Kategori A Bioterrorism Agent. och ett biologiskt medel för exportkontroll av Australia Group .
Expression av matrisproteinet VP40 är tillräckligt för att generera virusliknande partiklar ( inget viralt genetiskt material ) i en däggdjursvärd som är anmärkningsvärt omöjliga att skilja från levande virus, ur en morfologisk synpunkt.
Västafrikanska ebolavirusutbrottet
Under och efter 2014-2016 söktes behandlingsalternativ för den västafrikanska ebolavirusepidemin ; bland dem var VP40-matrisproteinet som ett mål för möjlig forskning som kan ( eller kanske inte ) leda till ett terapeutiskt alternativ.