NSP3 (rotavirus)
| identifierare | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| (rotavirus). | |||||||||
| Symbol | Rota_NSP3 | ||||||||
| Pfam | PF01665 | ||||||||
| InterPro | IPR002873 | ||||||||
| CATH | 1lj2A00 | ||||||||
| SCOP2 | d1lj2a_ / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Rotavirusprotein NSP3 (NS34 ) är bundet till 3'-ändens konsensussekvens av virala mRNA i infekterade celler.
Fyra nukleotider är det minimala kravet för RNA-igenkänning av rotavirus icke-strukturellt protein NSP3: med korta oligoribonukleotider fastställdes att den minimala RNA- sekvens som krävs för bindning av NSP3A är GACC .
Rotavirus RNA-bindande protein NSP3 interagerar med eIF4GI och avlägsnar det poly(A)-bindande proteinet från eIF4F . Och NSP3A, genom att ersätta PABP på eIF4GI, är ansvarig för avstängningen av cellulär proteinsyntes.
Uttryck av NSP3 i däggdjursceller möjliggör effektiv translation av virusliknande mRNA: NSP3 bildar en länk mellan viralt mRNA och det cellulära translationsmaskineriet och är därför en funktionell analog av cellulärt poly(A)-bindande protein.
Platsstyrd mutagenes och isotermisk titreringskalorimetri dokumenterade att NSP3 och PABP använder analoga eIF4G-igenkänningsstrategier, trots markanta skillnader i tertiär struktur.
Genom att använda jästtvåhybridanalysen visade sig RoXan , ett nytt cellulärt protein, binda NSP3. Interaktionen mellan NSP3 och RoXaN försämrar inte interaktionen mellan NSP3 och eIF4GI, och ett ternärt komplex tillverkat av NSP3, RoXaN och eIF4G I kan detekteras i rotavirusinfekterade celler, vilket implicerar RoXaN i translationsreglering.