Serinhydrolas
Serinhydrolaser är en av de största kända enzymklasserna som omfattar cirka ~200 enzymer eller 1% av generna i det mänskliga proteomet. En avgörande egenskap hos dessa enzymer är närvaron av ett speciellt serin på det aktiva stället , som används för hydrolys av substrat . Hydrolysen av ester- eller peptidbindningen fortskrider i två steg. Först acyldelen av substratet (den sura delen av en ester eller delen av en peptid som slutar i en karboxylgrupp ) till serinet, vilket skapar en ny ester- eller amidbindning och frigör den andra delen av substratet (den alkohol av en ester eller den del av peptiden som slutar på en aminogrupp ) frisätts. Senare, i ett långsammare steg, hydrolyseras bindningen mellan serin och acylgruppen av vatten eller hydroxidjon, vilket regenererar fritt enzym. Till skillnad från andra, icke-katalytiska, seriner, aktiveras det reaktiva serinet i dessa hydrolaser vanligtvis av ett protonrelä som involverar en katalytisk triad bestående av serinet, en sur rest (t.ex. aspartat eller glutamat ) och en basisk rest (vanligtvis histidin ), även om variationer på denna mekanism finns.
Superfamiljer av serinhydrolaser inkluderar:
- Serinproteaser , inklusive trypsin , kymotrypsin och subtilisin
- Extracellulära lipaser , inklusive pankreaslipas , leverlipas , gastriskt lipas , endotellipas och lipoproteinlipas
- Intracellulära lipaser , inklusive hormonkänsligt lipas , monoacylglycerollipas , fetttriglyceridlipas och diacylglycerollipas
- Kolinesteraser , inklusive acetylkolinesteras och butyrylkolinesteras
- Småmolekylära tioesteraser , inklusive fettsyrasyntas och acyl-CoA tioesteraser
- Vissa fosfolipaser , inklusive fosfolipas A2 och trombocytaktiverande faktor acetylhydrolas
- Protein- och glykanhydrolaser , inklusive proteinfosfatmetylesteras 1, acyloxiacylhydrolas och sialinsyraacetylesteras
- Vissa amidaser , inklusive fettsyraamidhydrolas
- Vissa peptidaser, inklusive dipeptidylpeptidas 4 , fibroblastaktiveringsprotein och prolylendopeptidas
