Alfa/beta hydrolas superfamilj
 Ett bakteriellt lipas , en av dessa familjemedlemmar
| |||||||||
| Identifierare | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Symbol | Abhydrolas_1 | ||||||||
| Pfam | PF00561 | ||||||||
| InterPro | IPR000073 | ||||||||
| SCOP2 | 1ede / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| OPM superfamilj | 127 | ||||||||
| OPM-protein | 1qge | ||||||||
| CDD | cl21494 | ||||||||
| Membran | 300 | ||||||||
| |||||||||
Alfa /beta-hydrolas-superfamiljen är en superfamilj av hydrolytiska enzymer med vitt skilda fylogenetiska ursprung och katalytiska funktioner som delar en gemensam veck . Kärnan i varje enzym är ett alfa/beta-ark (snarare än ett fat ), som innehåller 8 beta-strängar förbundna med 6 alfa-helixar . Enzymerna tros ha avvikit från en gemensam förfader, behållit liten uppenbar sekvenslikhet , men bevarat arrangemanget av de katalytiska resterna. Alla har en katalytisk triad , vars element bärs på slingor, som är de bäst bevarade strukturella egenskaperna hos vecket.
Alfa/beta-hydrolasvecket inkluderar proteaser , lipaser , peroxidaser , esteraser , epoxidhydrolaser och dehalogenaser .
Databas
ESTHER-databasen tillhandahåller en stor samling information om denna superfamilj av proteiner.
Underfamiljer
Humana proteiner som innehåller denna domän
ABHD10; ABHD11 ; ABHD12 ; ABHD12B; ABHD13; ABHD2 ; ABHD3 ; ABHD4; ABHD5 ; ABHD6 ; ABHD7; ABHD8; ABHD9; BAT5 ; BPHL; C20orf135; EPHX1 ; EPHX2 ; FAM108B1; LIPA; LIPF; LIPJ; LIPK ; LIPM; LIPN ; LYPLAL1 ; MEST ; MGLL ; PPME1 ; SERHL; SERHL2; SPG21 ; CES1 ; CES2 ; C4orf29
Se även
- Ecdysteroid-fosfatfosfatas - strukturen hos ett steroidfosfatfosfotas
- Serinhydrolas - en enzymfamilj som till stor del består av proteiner med alfa-beta-hydrolasveck
externa länkar
- ^ a b Ollis, DL; Cheah, E.; Cygler, M.; Dijkstra, B.; Frolow, F.; Franken, SM; Harel, M.; Remington, SJ; Silman, I.; Schrag, J.; Sussman, JL; Verschueren, KHG & Goldman, A. (1992). "Alfa/beta-hydrolasvecket" (PDF) . Protein Eng . 5 (3): 197–211. doi : 10.1093/protein/5.3.197 . hdl : 11370/2d4c057d-1a67-437d-ad10-701f7a60f1e6 . PMID 1409539 .
- ^ Carr PD, Ollis DL (2009). "Alfa/beta-hydrolasveck: en uppdatering". Protein Pept. Lett . 16 (10): 1137–48. doi : 10.2174/092986609789071298 . PMID 19508187 .
- ^ Nardini M, Dijkstra BW (december 1999). "Alfa/beta-hydrolasveckenzymer: familjen fortsätter att växa". Curr. Opin. Struktur. Biol . 9 (6): 732–7. doi : 10.1016/S0959-440X(99)00037-8 . PMID 10607665 .
- ^ Renault L, Nègre V, Hotelier T, Cousin X, Marchot P, Chatonnet A (december 2005). "Nya vänliga verktyg för användare av ESTHER, databasen för alfa/beta-hydrolas-faldiga superfamiljen av proteiner". Chem. Biol. Interagera . 157–158: 339–43. doi : 10.1016/j.cbi.2005.10.100 . PMID 16297901 .
