Prefenatdehydrogenas
| prefenatdehydrogenas | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Prefenatdehydrogenashomodimer, Bacillus anthracis
| |||||||||
| Identifierare | |||||||||
| EG nr. | 1.3.1.12 | ||||||||
| CAS-nr. | 9044-92-2 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Prefenatdehydrogenas är ett enzym som finns i shikimatvägen och hjälper till att katalysera reaktionen från prefenat till tyrosin.
Nomenklatur
Gen: ( Saccharomyces Cerevisiae ) TYR1
Shikimatväg : Arogenat/ prefenat (ADH/PDH). Även om arogenat- och prefenatdehydrogenas i shikimatvägen katalyserar olika reaktioner, kan de ibland användas omväxlande.
- TyrA (tyrosin A: inom tyrosinvägen)
- Prefenatdehydrogenas
- Prefenat (nikotinamidadenindinukleotidfosfat) dehydrogenas
- Prefenatdehydrogenas (NADP)
- NADP+ oxidoreduktas
Homologi
Detta enzym har hittills hittats i sexton olika organismer; tolv olika sorters bakterier (mest cyanobakterier ) och fyra olika sorters växter (mest olika sorters bönor).
Bakterieorganismer (exempel): Acenitobacter calcoaceticus, Fischerella sp., Flavobacterium so., Comamonas testosteroni och nostoc sp.
Växtorganismer: phaseolus coccineus , phaseolus vulgaris , vicia faba , vigna radiata
Fungera
Finns i shikimatvägen, i vägen för att syntetisera tyrosin (en icke-essentiell aminosyra i både växter och djur). Det katalyserar den oxidativa dekarboxyleringsreaktionen av prefenat till 4-hydroxifenylpyruvat.
Reaktion
Inom enzymologi är ett prefenatdehydrogenas ( EC 1.3.1.12 ) ett enzym som katalyserar den kemiska reaktionen
- prefenat + NAD + 4-hydroxifenylpyruvat + CO 2 + NADH
Således är de två substraten för detta enzym prefenat och NAD + CO2 , medan dess 3 produkter är 4-hydroxifenylpyruvat , och NADH .
Strukturera
Detta enzym tillhör familjen oxidoreduktaser , speciellt de som verkar på givarens CH-CH-grupp med NAD+ eller NADP+ som acceptor. Det systematiska namnet på denna enzymklass är prefenat:NAD+ oxidoreduktas (dekarboxylerande) . Andra namn i vanlig användning inkluderar hydroxifenylpyruvatsyntas och korismatmutas ---prefenatdehydrogenas . Detta enzym deltar i biosyntesen av fenylalanin, tyrosin och tryptofan och biosyntesen av novobiocin .
Finns även i haemophilus influenzae , synechocystis (bakterier) och aquifex aeolicus (växt).
I haemophilus influenzae fusioneras emellertid prefenatdehydrogenas med enzymet korismatmutas . Denna fusion finns inte i växter eller djur.
Strukturstudier
I slutet av 2007 har två strukturer lösts för denna klass av enzymer, med PDB- accessionskoderna 2G5C och 2PV7 .
