Polynukleotid 5'-fosfatas
| polynukleotid 5'- | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| fosfatasidentifierare | |||||||||
| EG nr. | 3.1.3.33 | ||||||||
| CAS-nr. | 37288-17-8 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Enzymet polynukleotid 5'-fosfatas ( RNA 5'-trifosfatas , RTPase , EC 3.1.3.33) är ett enzym som katalyserar reaktionen
- en 5'-fosfopolynukleotid + H 2 O en polynukleotid + fosfat
Detta enzym tillhör familjen hydrolaser , speciellt de som verkar på fosformonoesterbindningar . Det systematiska namnet är polynukleotid 5'-fosfohydrolas . Detta enzym kallas även 5'-polynukleotidas .
Den enda specifika molekylära funktionen som är känd är katalysen av reaktionen:
- en 5'-änds trifosfo-(purin-ribonukleotid) i mRNA + H 2 O = en 5'-änds difosfo-(purin-ribonukleosid) i mRNA + fosfat
RTPaser klyver den 5′-terminala γ-β fosfoanhydridbindningen av begynnande budbärar-RNA- molekyler, vilket möjliggör tillägg av en fem-prime cap som en del av post-transkriptionella modifieringar . RTPaser genererar 5'-difosfatändad mRNA och en fosfatjon från 5'-trifosfatändad prekursor-mRNA . mRNA guanylyltransferas lägger sedan till en bakåtriktad guanosinmonofosfatgrupp (GMP) från GTP , vilket genererar pyrofosfat , och mRNA (guanin-N7-)-metyltransferas metylerar guaninen för att bilda den slutliga 5'-kapselstrukturen.
Det finns två familjer av RTPaser kända hittills:
- den metallberoende familjen. Jäst- , protozo- och virala RTPaser kräver en metallkofaktor för sin aktivitet, som oftast är antingen Mg2 + eller Mn2 + . Denna klass av enzymer kan också hydrolysera fria nukleosidtrifosfater i närvaro av antingen Mn2 + eller Co2 + .
- den metalloberoende familjen. Dessa grupper kräver inte metaller för sin aktivitet, och vissa enzymer har visat sig inaktiveras i närvaro av metalljoner. Dessa enzymer påminner mycket om proteintyrosinfosfataser i sin struktur och mekanism. Denna familj inkluderar RTPaser från däggdjur, växter och andra högre eukaryoter, och skiljer sig strukturellt och mekaniskt från den metallberoende RTPas-familjen.
Strukturstudier
I slutet av 2007 har 5 strukturer lösts för denna klass av enzymer, med PDB- accessionskoderna 1D8H , 1D8I , 1I9S , 1I9T och 1YN9 .
Se även
Vidare läsning
- Becker A, Hurwitz J (mars 1967). "Den enzymatiska klyvningen av fosfatterminaler från polynukleotider" . Journal of Biological Chemistry . 242 (5): 936–50. doi : 10.1016/S0021-9258(18)96215-0 . PMID 4289819 .
