Glykosidhydrolasfamiljen 15
Glykosylhydrolaser familj 15 | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifierare | |||||||||
Symbol | Glyco_hydro_15 | ||||||||
Pfam | PF00723 | ||||||||
Pfam klan | CL0059 | ||||||||
SCOP2 | 1glm / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
CAZy | GH15 | ||||||||
|
Inom molekylärbiologi är glykosidhydrolasfamiljen 15 en familj av glykosidhydrolaser .
Glykosidhydrolaser EC 3.2.1. är en utbredd grupp av enzymer som hydrolyserar glykosidbindningen mellan två eller flera kolhydrater, eller mellan en kolhydrat och en icke-kolhydratdel . Ett klassificeringssystem för glykosidhydrolaser, baserat på sekvenslikhet, har lett till definitionen av >100 olika familjer. Denna klassificering är tillgänglig på CAZy -webbplatsen och diskuteras även på CAZypedia, ett onlineuppslagsverk över kolhydrataktiva enzymer. å[ _]9
Glykosidhydrolasfamiljen 15 CAZY GH_15 omfattar enzymer med flera kända aktiviteter; glukoamylas ( EC 3.2.1.3 ); alfa-glukosidas ( EC 3.2.1.20 ); glukodextranas ( EC 3.2.1.70 ).
Glukoamylas (GA) katalyserar frisättningen av D-glukos från de icke-reducerande ändarna av stärkelse och andra oligo- eller polysackarider. Studier av svamp GA har indikerat 3 tätt klustrade sura rester som spelar en roll i den katalytiska mekanismen. Denna region är också konserverad i en nyligen sekvenserad bakteriell GA.
3D-strukturen av pseudotetrasackariden akarbos komplexbunden med glukoamylas II(471) från Aspergillus awamori var. X100 har fastställts till 2,4 A upplösning. Proteinet tillhör huvudsakligen alfaklassen och innehåller 19 helixar och 9 strängar .