Glykosidhydrolasfamiljen 15

Glykosylhydrolaser familj 15
Identifierare
Symbol Glyco_hydro_15
Pfam PF00723
Pfam klan CL0059
SCOP2 1glm / SCOPe / SUPFAM
CAZy GH15
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning

Inom molekylärbiologi är glykosidhydrolasfamiljen 15 en familj av glykosidhydrolaser .

Glykosidhydrolaser EC 3.2.1. är en utbredd grupp av enzymer som hydrolyserar glykosidbindningen mellan två eller flera kolhydrater, eller mellan en kolhydrat och en icke-kolhydratdel . Ett klassificeringssystem för glykosidhydrolaser, baserat på sekvenslikhet, har lett till definitionen av >100 olika familjer. Denna klassificering är tillgänglig på CAZy -webbplatsen och diskuteras även på CAZypedia, ett onlineuppslagsverk över kolhydrataktiva enzymer. å[ _]9

Glykosidhydrolasfamiljen 15 CAZY GH_15 omfattar enzymer med flera kända aktiviteter; glukoamylas ( EC 3.2.1.3 ); alfa-glukosidas ( EC 3.2.1.20 ); glukodextranas ( EC 3.2.1.70 ).

Glukoamylas (GA) katalyserar frisättningen av D-glukos från de icke-reducerande ändarna av stärkelse och andra oligo- eller polysackarider. Studier av svamp GA har indikerat 3 tätt klustrade sura rester som spelar en roll i den katalytiska mekanismen. Denna region är också konserverad i en nyligen sekvenserad bakteriell GA.

3D-strukturen av pseudotetrasackariden akarbos komplexbunden med glukoamylas II(471) från Aspergillus awamori var. X100 har fastställts till 2,4 A upplösning. Proteinet tillhör huvudsakligen alfaklassen och innehåller 19 helixar och 9 strängar .