BAP1

BAP1-
identifierare
, HUCEP-13, UCHL2, hucep-6, BRCA1-associerat protein 1, KURIS
externa ID :n
Ortologer
Arter Mänsklig Mus
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Plats (UCSC)
PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

BRCA1-associerat protein-1 (ubiquitin carboxy-terminal hydrolase) är ett deubiquitinating enzym som hos människor kodas av BAP1 - genen . BAP1 kodar för ett 80,4 kDa nukleärt lokaliserande protein med en ubiquitin carboxy-terminal hydrolase (UCH) domän som ger BAP1 dess deubiquitinasaktivitet . Nyligen genomförda studier har visat att BAP1 och dess fruktflugehomolog , Calypso , är medlemmar av polykamgruppsproteinerna (PcG) av högkonserverade transkriptionsrepressorer som krävs för långvarig tystnad av gener som reglerar cellödebestämning , stamcellspluripotens och andra utvecklingsprocesser.

Nomenklatur

BAP1 är också känd som:

Gen

Hos människor kodas BAP1 av BAP1 -genen som ligger på den korta armen av kromosom 3 (3p21.31-p21.2).

Strukturera

Human BAP1 är 729 aminosyror lång och har tre domäner :

  1. en ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (UCH) N-terminus katalytisk domän, som avlägsnar ubiquitin från ubiquitylerade substrat: resterna 1-240, med ett aktivt ställe innefattande Cysteine ​​91, Alanine 95 och Glycine 178 resterna.
  2. en unik länkregion, som inkluderar en värdcellfaktor Cl- bindande domän vid resterna 356-385.
  3. en C-terminal domän: resterna 598-729, som inkluderar en UCH37 -liknande domän (ULD) vid resterna 675-693 och två nukleära lokaliseringssekvenser vid resterna 656-661 och 717-722.

Fungera

I både Drosophila och människor fungerar BAP1 som den katalytiska subenheten av Polycomb repressive deubiquitinase (PR-DUB) komplexet, som kontrollerar homeobox- gener genom att reglera mängden ubiquitinerad histon H2A i nukleosomer bundna till deras promotorer . Hos flugor och människor bildas PR-DUB-komplexet genom interaktionen mellan BAP1 och ASXL1 ( Asx i fruktflugor ) BAP1 har också visat sig associera med andra faktorer involverade i kromatinmodulering och transkriptionsreglering, såsom värdcellsfaktor C1 , som fungerar som en adapter för att koppla E2F- transkriptionsfaktorer till kromatinmodifierande komplex under cellcykelprogression .

Roll i sjukdom

Vid cancer kan BAP1 fungera både som en tumörsuppressor och som en metastasuppressor .

Somatiska mutationer i cancer

BAP1 tumörpredispositionssyndrom

Två studier använde genomsekvensering oberoende för att identifiera könslinjemutationer i BAP1 i familjer med genetiska anlag för mesoteliom och melanocytiska hudtumörer. De atypiska melanocytiska lesionerna liknar spitz nevi och har karakteriserats som "atypiska spetstumörer" (AST), även om de har en unik histologi och uppvisar både BRAF- och BAP1-mutationer. Ytterligare studier har identifierat könslinje BAP1-mutationer associerade med andra cancerformer. Dessa studier tyder på att könslinjemutation av BAP1 resulterar i ett tumörpredispositionssyndrom som länkar BAP1 till många fler cancerformer.

Immunkemi

Immunhistokemi för BAP1 är en prognostisk biomarkör för att förutsäga dåliga onkologiska resultat och ogynnsamma klinikopatologiska egenskaper hos patienter med icke-metastaserande klarcellig njurcellscancer (CCRCC). BAP1-bedömning med hjälp av immunhistokemi på nålbiopsi kan gynna preoperativ riskstratifiering och vägleda behandlingsplanering.

Interaktioner

BAP1 har visat sig interagera med

Modellorganismer

Modellorganismer har använts i studien av BAP1-funktion. En villkorlig knockout-muslinje kallad Bap1 tm1a(EUCOMM)Hmgu genererades vid Wellcome Trust Sanger Institute . Han- och hondjur genomgick en standardiserad fenotypisk screening för att bestämma effekterna av deletion. Ytterligare undersökningar utförda: - Djupgående immunologisk fenotypning - djupgående ben- och broskfenotypning

externa länkar

Vidare läsning

Hämtad från " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=BAP1&oldid=1116891843 "