Proteinkodande gen i arten Homo sapiens
H2AC20-
identifierare
, H2A, H2A-GL101, H2A/q, H2AFQ, histonkluster 2, H2ac, histonkluster 2 H2A-familjemedlem c, H2A-klustrad histon 20, HIST2H2AC Externa
ID :n
Wikidata
Histone H2A typ 2-C är ett protein som hos människor kodas av HIST2H2AC -genen .
Histoner är grundläggande kärnproteiner som är ansvariga för nukleosomstrukturen hos kromosomfibrerna i eukaryoter . Två molekyler av var och en av de fyra kärnhistonerna (H2A, H2B, H3 och H4) bildar en oktamer , runt vilken cirka 146 bp DNA är insvept i repeterande enheter, kallade nukleosomer. Linkerhistonen, H1, interagerar med linker-DNA mellan nukleosomer och fungerar i komprimeringen av kromatin till strukturer av högre ordning. Denna gen är intronlös och kodar för en medlem av histon H2A-familjen.
Vidare läsning
El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (1998). "Transkriptionsaktivering av den integrerade kromatinassocierade humana immunbristvirus typ 1-promotom" . Mol. Cell. Biol . 18 (5): 2535–44. doi : 10.1128/mcb.18.5.2535 . PMC 110633 . PMID 9566873 .
Kimura A, Horikoshi M (1999). "Tip60 acetylerar sex lysiner av en specifik klass i kärnhistoner in vitro" . Gener Celler . 3 (12): 789–800. doi : 10.1046/j.1365-2443.1998.00229.x . PMID 10096020 .
Deng L, de la Fuente C, Fu P, et al. (2001). "Acetylering av HIV-1 Tat av CBP/P300 ökar transkriptionen av integrerat HIV-1-genom och förbättrar bindningen till kärnhistoner" . Virologi . 277 (2): 278–95. doi : 10.1006/viro.2000.0593 . PMID 11080476 .
Deng L, Wang D, de la Fuente C, et al. (2001). "Förbättring av p300 HAT-aktiviteten genom HIV-1 Tat på kromatin-DNA" . Virologi . 289 (2): 312–26. doi : 10.1006/viro.2001.1129 . PMID 11689053 .
Chen A, Kleiman FE, Manley JL, et al. (2002). "Autoubiquitination av BRCA1*BARD1 RING ubiquitinligas" . J. Biol. Chem . 277 (24): 22085–92. doi : 10.1074/jbc.M201252200 . PMID 11927591 .
Lahn BT, Tang ZL, Zhou J, et al. (2002). "Tidigare okarakteriserade histonacetyltransferaser involverade i däggdjursspermatogenes" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (13): 8707–12. Bibcode : 2002PNAS...99.8707L . doi : 10.1073/pnas.082248899 . PMC 124363 . PMID 12072557 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Yoon HG, Chan DW, Huang ZQ, et al. (2003). "Rening och funktionell karakterisering av det mänskliga N-CoR-komplexet: rollerna för HDAC3, TBL1 och TBLR1" . EMBO J . 22 (6): 1336–46. doi : 10.1093/emboj/cdg120 . PMC 151047 . PMID 12628926 .
Fujita K, Shimazaki N, Ohta Y, et al. (2004). "Terminal deoxinukleotidyltransferas bildar ett ternärt komplex med ett nytt kromatinremodellerande protein med 82 kDa och kärnhiston" . Gener Celler . 8 (6): 559–71. doi : 10.1046/j.1365-2443.2003.00656.x . PMID 12786946 . S2CID 25223336 .
Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). "Reglering av HIV-1-genuttryck genom histonacetylering och faktorrekrytering vid LTR-promotorn" . EMBO J . 22 (24): 6550–61. doi : 10.1093/emboj/cdg631 . PMC 291826 . PMID 14657027 .
Zhang Y, Griffin K, Mondal N, Parvin JD (2004). "Fosforylering av histon H2A hämmar transkription på kromatinmallar" . J. Biol. Chem . 279 (21): 21866–72. doi : 10.1074/jbc.M400099200 . PMID 15010469 .
Aihara H, Nakagawa T, Yasui K, et al. (2004). "Nukleosomalt histonkinas-1 fosforylerar H2A Thr 119 under mitos i det tidiga Drosophila-embryot" . Genes Dev . 18 (8): 877–88. doi : 10.1101/gad.1184604 . PMC 395847 . PMID 15078818 .
Wang H, Wang L, Erdjument-Bromage H, et al. (2004). "Roll av histon H2A ubiquitination i Polycomb tystnad". Naturen . 431 (7010): 873–8. Bibcode : 2004Natur.431..873W . doi : 10.1038/nature02985 . PMID 15386022 . S2CID 4344378 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIH fullängds cDNA-projektet: Däggdjursgensamlingen (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Braastad CD, Hovhannisyan H, van Wijnen AJ, et al. (2005). "Funktionell karakterisering av en mänsklig histongenklusterduplicering". Gene . 342 (1): 35–40. doi : 10.1016/j.gene.2004.07.036 . PMID 15527963 .
Hagiwara T, Hidaka Y, Yamada M (2005). "Deimination av histon H2A och H4 vid arginin 3 i HL-60 granulocyter". Biokemi . 44 (15): 5827–34. doi : 10.1021/bi047505c . PMID 15823041 .
Bonenfant D, Coulot M, Towbin H, et al. (2006). "Karakterisering av histon H2A och H2B varianter och deras post-translationella modifieringar genom masspektrometri" . Mol. Cell. Proteomik . 5 (3): 541–52. doi : 10.1074/mcp.M500288-MCP200 . PMID 16319397 .
PDB galleri
1aoi : KOMPLEX MELLAN NUKLEOSOMKÄRNPARTIKEL (H3,H4,H2A,H2B) OCH 146 BP LÅNGT DNA-FRAGMENT
1eqz : RÖNTGENSTRUKTUR HOS NUKLEOSOMKÄRNPARTIKELN VID 2,5 A UPPLÖSNING
1hq3 : KRISTALSTRUKTUR HOS HISTONEKÄRNEOKTAMEREN I KCL/FOSFAT
1kx3 : Röntgenstruktur av nukleosomkärnpartikeln, NCP146, vid 2,0 A-upplösning
1kx4 : Röntgenstruktur av nukleosomkärnpartikeln, NCP146b, vid 2,6 A-upplösning
1kx5 : Röntgenstruktur av nukleosomkärnpartikeln, NCP147, vid 1,9 A-upplösning
1m18 : LIGANDBINDNING ÄNDRINGAR STRUKTUREN OCH DYNAMIKN FÖR NUKLEOSOMAL DNA
1m19 : LIGANDBINDNING ÄNDRINGAR STRUKTUREN OCH DYNAMIKN FÖR NUKLEOSOMAL DNA
1m1a : LIGANDBINDNING ÄNDRAR STRUKTUREN OCH DYNAMIKN FÖR NUKLEOSOMAL DNA
1p34 : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3a : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3b : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3f : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3g : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3i : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3k : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3l : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3m : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3o : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1p3p : Kristallografiska studier av nukleosomkärnpartiklar som innehåller histon-"Sin"-mutanter
1s32 : Molekylär igenkänning av den nukleosomala "supergrooven"
1tzy : Kristallstruktur av Core-Histone Octamer till 1,90 Ångströms upplösning
1zbb : Struktur av 4_601_167 tetranukleosomen
1zla : Röntgenstruktur av en Kaposis sarkom herpesvirus LANA-peptid bunden till den nukleosomala kärnan
2aro : Kristallstruktur av den naturliga histonoktameren till 2,1 Ångströms upplösning, kristalliserad i närvaro av S-Nitrosoglutation
2cv5 : Kristallstruktur av mänsklig nukleosomkärnpartikel
2f8n : 2,9 Ångström röntgenstruktur av hybrid makroH2A nukleosomer
2fj7 : Kristallstruktur av nukleosomkärnpartikel som innehåller ett poly(dA.dT) sekvenselement
2hio : HISTONEOKTAMER (KYCKLING), KROMOSOMALT PROTEIN
2nzd : Nukleosomkärnpartikel innehållande 145 bp DNA