RBBP7

RBBP7
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, RbAp46, retinoblastombindande protein 7, RB-bindande protein 7, kromatinremodelleringsfaktor
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Histonbindande protein RBBP7 är ett protein som hos människor kodas av RBBP7 -genen .

Fungera

Detta protein är ett allmänt uttryckt nukleärt protein och tillhör en mycket konserverad underfamilj av WD-repeterande proteiner. Det finns bland flera proteiner som binder direkt till retinoblastomprotein, som reglerar cellproliferation. Det kodade proteinet finns i många histon-deacetylaskomplex, inklusive mSin3-samrepressorkomplex. Det finns också i proteinkomplex involverade i kromatinsammansättning. Detta protein kan interagera med BRCA1-tumörsuppressorgenen och kan ha en roll i regleringen av cellproliferation och differentiering.

Modellorganismer

Rbbp7 knockout mus fenotyp

Karakteristisk	Fenotyp
Homozygot viabilitet	Vanligt
Homozygot fertilitet	Vanligt
Kroppsvikt	Vanligt
Ångest	Vanligt
Neurologisk bedömning	Vanligt
Greppstyrka	Vanligt
Varm tallrik	Vanligt
Dysmorfologi	Vanligt
Indirekt kalorimetri	Vanligt
Glukostoleranstest	Vanligt
Auditiv hjärnstammsrespons	Vanligt
DEXA	Vanligt
Radiografi	Vanligt
Kroppstemperatur	Vanligt
Ögonmorfologi	Vanligt
Klinisk kemi	Vanligt
Hematologi	Vanligt
Perifera blodlymfocyter	Onormal
Mikrokärntest	Vanligt
Hjärtvikt	Vanligt
Hjärnhistopatologi	Vanligt
Alla tester och analyser från

Modellorganismer har använts i studien av RBBP7-funktion. En villkorlig knockout-muslinje , kallad Rbbp7 ^{tm1a(EUCOMM)Wtsi} genererades som en del av programmet International Knockout Mouse Consortium - ett högkapacitetsmutagenesprojekt för att generera och distribuera djurmodeller av sjukdomar till intresserade forskare.

Han- och hondjur genomgick en standardiserad fenotypisk screening för att bestämma effekterna av deletion. Tjugoen tester utfördes på mutanta möss och en signifikant abnormitet observerades: hemizygota mutanta hanar hade minskat CD4-positiva och CD8-positiva T-cellantal .

Interaktioner

RBBP7 har visat sig interagera med:

• BRCA1 ,
• GATAD2B ,
• HDAC1 ,
• MTA2 ,
• Retinoblastom protein ,
• SAP30 , och
• SIN3A .

Vidare läsning

•    Huang S, Lee WH, Lee EY (1991). "Ett cellulärt protein som konkurrerar med SV40 T-antigen för att binda till retinoblastomgenprodukten". Naturen . 350 (6314): 160–162. Bibcode : 1991Natur.350..160H . doi : 10.1038/350160a0 . PMID 2005966 . S2CID 4345233 .
•   Zhang Y, Iratni R, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (1997). "Histoneacetylaser och SAP18, en ny polypeptid, är komponenter i ett humant Sin3-komplex" . Cell . 89 (3): 357–364. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80216-0 . PMID 9150135 .
•    Verreault A, Kaufman PD, Kobayashi R, Stillman B (1998). "Nukleosomalt DNA reglerar den kärn-histonbindande subenheten av det mänskliga Hat1-acetyltransferaset" . Curr. Biol . 8 (2): 96–108. doi : 10.1016/S0960-9822(98)70040-5 . PMID 9427644 . S2CID 201273 .
•   Zhang Y, Sun ZW, Iratni R, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Hampsey M, Reinberg D (1998). "SAP30, ett nytt protein som konserveras mellan människa och jäst, är en komponent i ett histon-deacetylaskomplex" . Mol. Cell . 1 (7): 1021-1031. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80102-1 . PMID 9651585 .
•   Guan LS, Rauchman M, Wang ZY (1998). "Induktion av Rb-associerat protein (RbAp46) av Wilms tumörsuppressor WT1 förmedlar tillväxthämning" . J. Biol. Chem . 273 (42): 27047–27050. doi : 10.1074/jbc.273.42.27047 . PMID 9765217 .
•    Zhang Y, LeRoy G, Seelig HP, Lane WS, Reinberg D (1998). "Det dermatomyosit-specifika autoantigenet Mi2 är en komponent i ett komplex som innehåller histon-deacetylas och nukleosomombyggnadsaktiviteter. " Cell . 95 (2): 279–289. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 . PMID 9790534 . S2CID 18786866 .
•    Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL (1998). "Kromatindeacetylering av ett ATP-beroende nukleosomombyggnadskomplex". Naturen . 395 (6705): 917–921. Bibcode : 1998Natur.395..917T . doi : 10.1038/27699 . PMID 9804427 . S2CID 4355885 .
•    Yarden RI, Brody LC (1999). "BRCA1 interagerar med komponenter i histon-deacetylaskomplexet" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (9): 4983–4988. Bibcode : 1999PNAS...96.4983Y . doi : 10.1073/pnas.96.9.4983 . PMC 21803 . PMID 10220405 .
•    Zhang Y, Ng HH, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Bird A, Reinberg D (1999). "Analys av NuRD-subenheterna avslöjar ett histon-deacetylas-kärnkomplex och ett samband med DNA-metylering" . Genes Dev . 13 (15): 1924–1935. doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . PMC 316920 . PMID 10444591 .
•    Wade PA, Gegonne A, Jones PL, Ballestar E, Aubry F, Wolffe AP (1999). "Mi-2-komplex kopplar DNA-metylering till kromatinombyggnad och histondeacetylering". Nat. Genet . 23 (1): 62–66. doi : 10.1038/12664 . PMID 10471500 . S2CID 52868103 .
•    Zhang Q, Vo N, Goodman RH (2000). "Histonbindande protein RbAp48 interagerar med ett komplex av CREB-bindande protein och fosforylerat CREB" . Mol. Cell. Biol . 20 (14): 4970–4978. doi : 10.1128/MCB.20.14.4970-4978.2000 . PMC 85947 . PMID 10866654 .
•   Humphrey GW, Wang Y, Russanova VR, Hirai T, Qin J, Nakatani Y, Howard BH (2001). "Stabila histon-deacetylaskomplex kännetecknas av närvaron av SANT-domänproteiner CoREST/kiaa0071 och Mta-L1" . J. Biol. Chem . 276 (9): 6817–6824. doi : 10.1074/jbc.M007372200 . PMID 11102443 .
•   Skowyra D, Zeremski M, Neznanov N, Li M, Choi Y, Uesugi M, Hauser CA, Gu W, Gudkov AV, Qin J (2001). "Differentiell association av produkter av alternativa transkript av kandidattumörsuppressorn ING1 med mSin3/HDAC1 transkriptionell corepressorkomplex" . J. Biol. Chem . 276 (12): 8734–8739. doi : 10.1074/jbc.M007664200 . PMID 11118440 .
•   Chen GC, Guan LS, Yu JH, Li GC, Choi Kim HR, Wang ZY (2001). "Rb-associerat protein 46 (RbAp46) hämmar transkriptionell transaktivering medierad av BRCA1". Biochem. Biophys. Res. Commun . 284 (2): 507–514. doi : 10.1006/bbrc.2001.5003 . PMID 11394910 .
•    Yarden RI, Brody LC (2002). "Identifiering av proteiner som interagerar med BRCA1 genom Far-Western-biblioteksscreening" . J. Cell. Biochem . 83 (4): 521–531. doi : 10.1002/jcb.1257 . PMID 11746496 . S2CID 29703139 .
•    Kuzmichev A, Zhang Y, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (2002). "Roll av Sin3-histondeacetylaskomplexet i tillväxtreglering av kandidattumörsuppressorn p33(ING1)" . Mol. Cell. Biol . 22 (3): 835–848. doi : 10.1128/MCB.22.3.835-848.2002 . PMC 133546 . PMID 11784859 .
•    Vaute O, Nicolas E, Vandel L, Trouche D (2002). "Funktionell och fysisk interaktion mellan histonmetyltransferaset Suv39H1 och histondeacetylaser" . Nucleic Acids Res . 30 (2): 475–481. doi : 10.1093/nar/30.2.475 . PMC 99834 . PMID 11788710 .
•   Saito M, Ishikawa F (2002). "Den mCpG-bindande domänen av human MBD3 binder inte till mCpG utan interagerar med NuRD/Mi2-komponenterna HDAC1 och MTA2" . J. Biol. Chem . 277 (38): 35434–35439. doi : 10.1074/jbc.M203455200 . PMID 12124384 .
•    Kuzmichev A, Nishioka K, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (2002). "Histonmetyltransferasaktivitet associerad med ett humant multiproteinkomplex som innehåller Zeste-proteinets Enhancer" . Genes Dev . 16 (22): 2893–2905. doi : 10.1101/gad.1035902 . PMC 187479 . PMID 12435631 .