Acyl-CoA tioesteras 9
| ACOT9- | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| identifierare | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , ACATE2, MT-ACT48, MTACT48, CGI-16, Acyl-CoA tioesteras 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| externa ID:n | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Acyl-CoA tioesteras 9 är ett protein som kodas av den humana ACOT9 -genen . Det är en medlem av acyl-CoA- tioesteras -superfamiljen, som är en grupp enzymer som hydrolyserar Coenzym A- estrar . Det finns ingen känd funktion, men det har visat sig fungera som ett långkedjigt tioesteras vid låga koncentrationer och ett kortkedjigt tioesteras vid höga koncentrationer.
Gen
Ställe
ACOT9-genen är lokaliserad vid p22.11 på kromosom X. Beläget på minussträngen av kromosomen, är starten vid 23 721 777 bp och slutet är vid 23 761 407 bp, vilket är ett spann på 39 631 baspar .
Alias
ACOT9-genen är främst känd för att koda för Acyl-CoA-tioesteras 9-proteinet. Andra, mindre vanliga namn för genen är ACATE2 och MT-ACT48.
Fungera
Proteinet som kodas av ACOT9-genen är en del av en familj av Acyl-CoA- tioesteraser , som katalyserar hydrolysen av olika Coenzym A- estrar av olika molekyler till den fria syran plus CoA. Dessa enzymer har även i litteraturen hänvisats till som acyl-CoA-hydrolaser, acyl-CoA-tioesterhydrolaser och palmitoyl-CoA-hydrolaser. Reaktionen som utförs av dessa enzymer är som följer:
CoA-ester + H 2 O → fri syra + koenzym A
Dessa enzymer använder samma substrat som långkedjiga acyl-CoA-syntetaser, men har ett unikt syfte genom att de genererar den fria syran och CoA, i motsats till långkedjiga acyl-CoA-syntetaser, som ligerar fettsyror till CoA, för att producera CoA-estern. Rollen för ACOT-familjen av enzymer är inte välkänd; dock har det föreslagits att de spelar en avgörande roll för att reglera de intracellulära nivåerna av CoA-estrar, koenzym A och fria fettsyror. Nyligen genomförda studier har visat att acyl-CoA-estrar har många fler funktioner än bara en energikälla. Dessa funktioner inkluderar allosterisk reglering av enzymer såsom acetyl-CoA-karboxylas , hexokinas IV och det citratkondenserande enzymet. Långkedjiga acyl-CoAs reglerar också öppning av ATP-känsliga kaliumkanaler och aktivering av kalcium ATPaser , och reglerar därigenom insulinutsöndring . Ett antal andra cellulära händelser förmedlas också via acyl-CoA, till exempel signaltransduktion genom proteinkinas C , hämning av retinsyrainducerad apoptos och involvering i knoppning och fusion av endomembransystemet . Acyl-CoAs förmedlar också proteininriktning till olika membran och reglering av G Protein α subenheter, eftersom de är substrat för proteinacylering. I mitokondrierna är acyl-CoA-estrar involverade i acyleringen av mitokondriella NAD+-beroende dehydrogenaser ; eftersom dessa enzymer är ansvariga för aminosyrakatabolism gör denna acylering hela processen inaktiv. Denna mekanism kan ge metabolisk överhörning och verka för att reglera NADH /NAD+-förhållandet för att upprätthålla optimal mitokondriell betaoxidation av fettsyror. Rollen för CoA-estrar i lipidmetabolism och många andra intracellulära processer är väl definierade, och därför antas det att ACOT-enzymer spelar en roll för att modulera de processer som dessa metaboliter är involverade i.
Homologi/evolution
_vs._Time_(MYA)_in_ACOT9.png)
Ortologer
Det finns många ortologer av ACOT9, husmusen ( Mus musculus ) är en av de mest lika, där ACOT9-genen finns vid 72,38cM på kromosom X. Utbudet av ortologer sträcker sig till däggdjur, fåglar, amfibier, anamorfa svampar och andra. [ citat behövs ]
| Sekvensnummer | Släkt och art | Vanligt namn | Datum för avvikelse (MYA) | Tillträdesnummer | Sekvenslängd | Sekvensidentitet | Sekvenslikhet | Anteckningar |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Homo sapiens | Mänsklig | 0 | NP_001028755.2 | 439 | 100 % | 100 % | Mänsklig |
| 2 | Mus musculus | Husmus | 91 | NP_062710.2 | 439 | 83 % | 90 % | Gnagare |
| 3 | Pteropus alecto | Svart flygande räv | 97,4 | XP_006911668.1 | 480 | 81 % | 91 % | fladdermus |
| 4 | Gallus gallus | Kyckling | 324,5 | NP_001012841.1 | 425 | 69 % | 87 % | Fågel |
| 5 | Pseudopodoces humilis | Jordmes | 324,5 | XP_005516751.1 | 417 | 68 % | 85 % | Fågel |
| 6 | Columba livia | Klippduva | 324,5 | XP_005503782.1 | 402 | 67 % | 86 % | Fågel |
| 7 | Geospiza fortis | Mellanmarksfink | 324,5 | XP_005424946.1 | 417 | 67 % | 85 % | Fågel |
| 8 | Pelodiscus sinensis | Kinesisk sköldpadda med mjukt skal | 324,5 | XP_006112565.1 | 439 | 67 % | 85 % | Reptil |
| 9 | Xenopus tropicalis | Västerländsk klös groda | 361,2 | AAI61600.1 | 418 | 65 % | 82 % | Amfibie |
| 10 | Danio rerio | Zebrafisk | 454,6 | AAI59216.1 | 434 | 60 % | 80 % | Fisk |
| 11 | Ceratitis capitata | Medelhavets fruktfluga | 910 | JAB97119.1 | 433 | 32 % | 58 % | Insekt |
| 12 | Glarea lozoyensis 74030 | Anamorfisk svamp | 1368 | EHL00310.1 | 350 | 24 % | 47 % | Svamp |
Paraloger
Hos möss, som är en av de närmaste ortologerna, är ACOT10 en känd paralog av ACOT9-genen.
Uttryck
Uttryck av ACOT9 är allestädes närvarande i vävnaderna hos människor. Vävnader med ett värde på över 500 i storskalig analys av det mänskliga transkriptomet var globus pallidus och kolorektalt adenokarcinom. Den uttryckta sekvenstaggen (eller EST) överflödsprofilen visar också ubiquitär /nästan allestädes närvarande, uttryck genom mänskliga vävnader.
Transkriptionsfaktorer
Det finns många transkriptionsfaktorer i hela ACOT9-promotorsekvensen. Några av de anmärkningsvärda faktorerna är värmechockfaktorer och igenkänningselement för transkriptionsfaktor II B ( TFIIB). [ citat behövs ]
| Transkriptionsfaktor | Start | Slutet | Strå | Sekvens |
|---|---|---|---|---|
| X-genkärnpromotorelement 1 | 683 | 693 | - | ggGCGGgaccg |
| Dubbelsex och mab-3-relaterad transkriptionsfaktor 1 | 81 | 101 | + | tttttttgagacaTTGTctcc |
| cAMP-responsivt elementbindande protein 1 | 491 | 511 | - | agggcgTGACgtcgagaagag |
| Sp4 transkriptionsfaktor | 660 | 676 | - | ccagggGGCGtggccgc |
| Stimulerande protein 1, allestädes närvarande zinkfingertranskriptionsfaktor | 682 | 698 | - | tccggGGGCgggaccgc |
| Värmechockfaktor 1 | 24 | 48 | + | caggactaaactAGAAtctccagcc |
| E2F-transkriptionsfaktor 2 | 808 | 824 | + | ccatcGCGCgcacggca |
| Nukleär faktor för aktiverade T-celler 5 | 380 | 398 | + | tttGGAAagttgcccagga |
| ZF5 POZ-domän zinkfinger, zinkfingerprotein 161 (sekundär DNA-bindningspreferens) | 811 | 825 | + | tcgCGCGcacggcag |
| B-cellsspecifikt aktivatorprotein | 678 | 706 | - | cagcggtgtccgggGGCGggaccgcggcg |
| Pax-6 parat domänbindningsställe | 54 | 72 | + | gtctcAAGCatcagttttt |
| ZF5 POZ-domän zinkfinger, zinkfingerprotein 161 (sekundär DNA-bindningspreferens) | 651 | 665 | - | ggcCGCGctgtgccg |
| Pax-6 parat domänbindningsställe | 758 | 776 | + | ttttaTCGCctcagtttcc |
| Däggdjurs C-typ LTR TATA-låda | 751 | 767 | - | ggcgaTAAAagacgcac |
| Kärnfaktor Y (Y-box bindningsfaktor) | 624 | 638 | + | cccgCCAAtgaacgg |
| Transkriptionsfaktor II B (TFIIB) igenkänningselement | 356 | 362 | + | ccgCGCC |
| Transkriptionsfaktor II B (TFIIB) igenkänningselement | 440 | 446 | - | ccgCGCC |
| Transkriptionsfaktor II B (TFIIB) igenkänningselement | 734 | 740 | - | ccgCGCC |
| Kärnfaktor Y (Y-box bindningsfaktor) | 581 | 595 | - | ccacTCAAtcagttg |
| CCAAT/enhancer-bindande protein alfa | 529 | 543 | - | tcggttgaGTAAacg |
Sekundär struktur
Det finns två regioner i ACOT9-gensekvensen som är märkta som BFIT (Brown Fat Inducible Thioesterase) och BACH (Brain Acyl CoA Hydrolase) regioner. Dessa regioner är en del av en korvvecksuperfamilj , som har visat sig användas i en mängd olika cellroller. Förutsägelser visar att det finns olika alfa-helixar genom hela strukturen, vilket tyder på att det är ett transmembranprotein .
Interaktioner
Ett mitokondriellt klyvningsställe kan hittas vid aminosyra 30 i ACOT9-sekvensen, och sannolikheten för export till mitokondrierna är 0,9374. Acyl-CoA-tioesteras 9-proteinet uppskattas vara 60,9 % mitokondriellt, 21,7 % cytoplasmatiskt , 8,7 % nukleärt, 4,3 % i plasmamembranet och 4,3 % i det endoplasmatiska retikulumet .
ACOT9-proteinet har visat sig interagera med följande proteiner antingen experimentellt eller genom samuttryck:
externa länkar
- Human ACOT9- genomplacering och ACOT9- gendetaljersida i UCSC Genome Browser .
Vidare läsning
- Mulkearns EE, Cooper JA (april 2012). "FCH-domän endast-2 organiserar clathrin-belagda strukturer och interagerar med Disabled-2 för lågdensitetslipoproteinreceptorendocytos" . Cellens molekylärbiologi . 23 (7): 1330–42. doi : 10.1091/mbc.E11-09-0812 . PMC 3315808 . PMID 22323290 .
- Hunt MC, Yamada J, Maltais LJ, Wright MW, Podesta EJ, Alexson SE (sep 2005). "En reviderad nomenklatur för acyl-CoA-tioesteraser/hydrolaser från däggdjur" . Journal of Lipid Research . 46 (9): 2029–32. doi : 10.1194/jlr.E500003-JLR200 . PMID 16103133 .
- Alkhaja AK, Jans DC, Nikolov M, Vukotic M, Lytovchenko O, Ludewig F, Schliebs W, Riedel D, Urlaub H, Jakobs S, Deckers M (Jan 2012). "MINOS1 är en bevarad komponent av mitofilinkomplex och krävs för mitokondriell funktion och cristae-organisation" ( PDF) . Cellens molekylärbiologi . 23 (2): 247–57. doi : 10.1091/mbc.E11-09-0774 . PMC 3258170 . PMID 22114354 .
- Poupon V, Bègue B, Gagnon J, Dautry-Varsat A, Cerf-Bensussan N, Benmerah A (juli 1999). "Molekylär kloning och karakterisering av MT-ACT48, ett nytt mitokondriellt acyl-CoA-tioesteras" . Journal of Biological Chemistry . 274 (27): 19188–94. doi : 10.1074/jbc.274.27.19188 . PMID 10383425 .
Denna artikel innehåller text från United States National Library of Medicine, som är allmän egendom .