Ubiquitin C

UBC
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, HMG20, Ubiquitin C
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Polyubiquitin-C är ett protein som kodas av UBC- genen hos människor. Polyubiquitin-C är en av källorna till ubiquitin , tillsammans med UBB , UBA52 och RPS27A .

UBC -genen är en av de två stressreglerade polyubiquitingenerna ( UBB och UBC ) hos däggdjur. Det spelar en nyckelroll för att upprätthålla cellulära ubiquitinnivåer under stressförhållanden . Defekter i UBC- genen kan leda till embryonal dödlighet i mitten av graviditeten.

Strukturera

Gen

UBC -genen är belägen vid kromosom 12q 24.3, bestående av 2 exoner . Promotorn för UBC -genen innehåller förmodade värmechockelement (HSE), som förmedlar UBC-induktion vid stress . UBC -genen skiljer sig från UBB- genen i antalet Ub-kodande enheter de innehåller. Nio till tio Ub-enheter fanns i UBC- genen.

Protein

I polyubiquitin-C är C-terminalen av en given ubiquitin-molekyl kovalent konjugerad till antingen den N-terminala resten eller en av sju lysinrester av en annan ubiquitin-molekyl. Olika länkar av ubiquitin-kedjor resulterar i distinkta konformationer. Det finns 8 kopplingstyper av polyubiquitin-C, och varje typ har den kopplingsberoende dynamiken och en kopplingsspecifik konformation.

Fungera

Mångfalden av polyubiquitin-C innebär att ubiquitylering bidrar till regleringen av många cellulära händelser. Polyubiquitin-C aktiverar inte värmechockresponsen, men den spelar en nyckelroll för att upprätthålla responsen. UBC- gentranskription induceras under stress och ger extra ubiquitin som behövs för att ta bort skadade/oveckade proteiner. Polyubiquitin-C har en viktig roll i olika biologiska processer, såsom medfödd immunitet , DNA-reparation och kinasaktivitet . Oförankrat polyubiquitin-C är också viktiga signalmolekyler som förbinder och koordinerar proteasomen och autofagin för att eliminera giftiga proteinaggregat.

Klinisk signifikans

Förlust av en enda UBC- allel har ingen uppenbar fenotyp, medan homozygot deletion av UBC-genen leder till embryonal dödlighet i mitten av graviditeten på grund av en defekt i fostrets leverutveckling, såväl som en försening i cellcykelprogression och ökad mottaglighet för cellulär stress. Det har också rapporterats att homozygot deletion av UBC-genen i musembryonala fibroblaster kommer att orsaka minskad cellulär Ub-nivå och minskad livsduglighet under oxidativ stress.

Interaktioner

Polyubiquitin-C har visats interagera med:

• BIRC2 ,
• BSG ,
• CDC2 ,
• CFAP298 ,
• E2F1 ,
• EGFR ,
• HDAC3 ,
• HIF1A ,
• IRAK1 ,
• KIAA0753 .
• MARK4 ,
• MDM2 ,
• NDUFA3 ​​,
• NFE2L2 ,
• NOTCH1 ,
• NUAK1 ,
• OPRK1 ,
• P53 ,
• PCNA
• PARK2 ,
• RIPK1 ,
• RPS6KB1 ,
• S100A10 ,
• SCNN1A ,
• SCNN1G ,
• SFPQ ,
• SMAD3 ,
• SMURF2 ,
• SP1 ,
• TRAF6 , och
• THRA .

Vidare läsning

•   Mazzé FM, Degrève L (2006). "Virala och cellulära proteiners roll i spirande av humant immunbristvirus". Acta Virologica . 50 (2): 75–85. PMID 16808324 .
•   Kanayama H, Tanaka K, Aki M, Kagawa S, Miyaji H, Satoh M, Okada F, Sato S, Shimbara N, Ichihara A (december 1991). "Förändringar i uttryck av proteasom- och ubiquitingener i mänskliga njurcancerceller". Cancerforskning . 51 (24): 6677–85. PMID 1660345 .
•    Baker RT, Board PG (april 1989). "Ojämn korsning genererar variation i ubiquitinkodningsenhetsnummer vid det mänskliga UbC polyubiquitin-lokuset" . American Journal of Human Genetics . 44 (4): 534–42. PMC 1715567 . PMID 2564731 .
•   Einspanier R, Sharma HS, Scheit KH (september 1987). "Kloning och sekvensanalys av ett cDNA som kodar för poly-ubiquitin i humana ovariegranulosaceller". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 147 (2): 581–7. doi : 10.1016/0006-291X(87)90970-3 . PMID 2820408 .
•   Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (april 1996). "En "dubbel adapter"-metod för förbättrad konstruktion av hagelgevärsbibliotek. Analytisk biokemi . 236 (1): 107–13. doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
•   Nenoi M, Mita K, Ichimura S, Cartwright IL, Takahashi E, Yamauchi M, Tsuji H (oktober 1996). "Heterogen struktur av polyubiquitingenen UbC av HeLa S3-celler". Gene . 175 (1–2): 179–85. doi : 10.1016/0378-1119(96)00145-X . PMID 8917096 .
•    Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (april 1997). "Storskalig sammanlänkning av cDNA-sekvensering" . Genomforskning . 7 (4): 353–8. doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 .
•    Nenoi M, Mita K, Ichimura S, Kawano A (februari 1998). "Högre frekvens av samordnade evolutionära händelser hos gnagare än hos människa vid polyubiquitingenen VNTR-lokus" . Genetik . 148 (2): 867–76. doi : 10.1093/genetics/148.2.867 . PMC 1459823 . PMID 9504932 .
•    Ott DE, Coren LV, Copeland TD, Kane BP, Johnson DG, Sowder RC, Yoshinaka Y, Oroszlan S, Arthur LO, Henderson LE (april 1998). "Ubiquitin är kovalent bundet till p6Gag-proteinerna från humant immunbristvirus typ 1 och simian immunbristvirus och till p12Gag-proteinet från Moloney murint leukemivirus" . Journal of Virology . 72 (4): 2962–8. doi : 10.1128/JVI.72.4.2962-2968.1998 . PMC 109742 . PMID 9525617 .
•   Kim NS, Yamaguchi T, Sekine S, Saeki M, Iwamuro S, Kato S (juli 1998). "Klonning av humant polyubiquitin cDNA och en ubiquitin-bindande analys som involverar dess in vitro translationsprodukt". Journal of Biochemistry . 124 (1): 35–9. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022093 . PMID 9644242 .
•    Schubert U, Ott DE, Chertova EN, Welker R, Tessmer U, Princiotta MF, Bennink JR, Krausslich HG, Yewdell JW (november 2000). "Proteasomhämning stör gag-polyproteinbearbetning, frisättning och mognad av HIV-1 och HIV-2" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (24): 13057–62. Bibcode : 2000PNAS...9713057S . doi : 10.1073/pnas.97.24.13057 . PMC 27177 . PMID 11087859 .
•    Strack B, Calistri A, Accola MA, Palu G, Gottlinger HG (november 2000). "En roll för rekrytering av ubiquitinligas i retrovirusfrisättning" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (24): 13063–8. Bibcode : 2000PNAS...9713063S . doi : 10.1073/pnas.97.24.13063 . PMC 27178 . PMID 11087860 .
•   Ott DE, Coren LV, Chertova EN, Gagliardi TD, Schubert U (december 2000). "Ubiquitination av HIV-1 och MuLV Gag" . Virologi . 278 (1): 111–21. doi : 10.1006/viro.2000.0648 . PMID 11112487 .
•    Strack B, Calistri A, Göttlinger HG (juni 2002). "Sen sammansättningsdomänfunktion kan uppvisa sammanhangsberoende och involverar ubiquitinrester som är inblandade i endocytos" . Journal of Virology . 76 (11): 5472–9. doi : 10.1128/JVI.76.11.5472-5479.2002 . PMC 137019 . PMID 11991975 .
•    Huang L, Feng L, Yang L, Zhou W, Zhao S, Li C (september 2002). "Skärm och identifiering av proteiner som interagerar med ADAM19 cytoplasmatisk svans". Molekylärbiologiska rapporter . 29 (3): 317–23. doi : 10.1023/A:1020409217215 . PMID 12463424 . S2CID 22611084 .
•    Ott DE, Coren LV, Sowder RC, Adams J, Schubert U (mars 2003). "Retrovirus har olika krav på proteasomfunktion i spirandeprocessen" . Journal of Virology . 77 (6): 3384–93. doi : 10.1128/JVI.77.6.3384-3393.2003 . PMC 149504 . PMID 12610113 .
•   Evans PC, Smith TS, Lai MJ, Williams MG, Burke DF, Heyninck K, Kreike MM, Beyaert R, Blundell TL, Kilshaw PJ (juni 2003). "En ny typ av deubiquitinating enzym" . Journal of Biological Chemistry . 278 (25): 23180–6. doi : 10.1074/jbc.M301863200 . PMID 12682062 .