Vitamin K epoxidreduktas
| Vitamin K epoxidreduktas (warfarinkänslig | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ) | |||||||||
 Reaktionsidentifierare
| |||||||||
| EG nr. | 1.17.4.4 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Vitamin K epoxidreduktas | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Struktur av en bakteriell VKOR, membran betecknat som linjer ().
| |||||||||
| Identifierare | |||||||||
| Symbol | VKOR | ||||||||
| Pfam | PF07884 | ||||||||
| InterPro | IPR012932 | ||||||||
| CATH | 3kp9 | ||||||||
| TCDB | 9.B.265 | ||||||||
| OPM superfamilj | 18 | ||||||||
| OPM-protein | 3kp9 | ||||||||
| |||||||||
Vitamin K epoxidreduktas ( VKOR ) är ett enzym ( EC 1.17.4.4 ) som reducerar vitamin K efter att det har oxiderats i karboxyleringen av glutaminsyrarester i blodkoagulationsenzymer . VKOR är medlem i en stor familj av förutspådda enzymer som finns i ryggradsdjur, Drosophila , växter, bakterier och arkéer . I vissa växt- och bakteriehomologer är VKOR- domänen sammansmält med domäner av tioredoxinfamiljen av oxidoreduktaser .
Fyra cysteinrester och en rest, som antingen är serin eller treonin, identifieras som troliga rester på det aktiva stället . Lösta bakteriella VKOR-strukturer har möjliggjort fler insikter i den katalytiska mekanismen. Alla VKOR är transmembranproteiner med minst tre TM-helixar vid den katalytiska kärnan. Kinonet som ska reduceras är bundet av ett redoxaktivt CXXC-motiv i de C-terminala helixarna, liknande det aktiva DsbB -stället. Två andra cysteiner till N-terminalen är belägna i en slinga utanför transmembranområdet; de vidarebefordrar elektroner med ett redoxprotein (eller i fallet med bakteriehomologen, dess egen fusionerade domän).
Den mänskliga genen för VKOR kallas VKORC1 (VKOR komplex subenhet 1). Det är målet för antikoagulant warfarin . Dess partner är ett redoxprotein med okänd identitet.
Det finns också en liknande gen som kallas VKORC1L1. VKORL1-komplexet som det bildar är mycket mindre effektivt för att reducera epoxiden, men det har förmågan att reducera kinonformen av vitamin K till en diolform (KH 2 ). Även om EC 1.17.4.4 noterar att båda paralogerna har båda aktiviteterna, diskuteras den exakta arbetsfördelningen in vitro .
