Tymidylatkinas
| tymidylatkinas | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Tymidylatkinasdimer, Human
| |||||||||
| Identifiers | |||||||||
| EG nr. | 2.7.4.9 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Tymidylatkinasidentifierare | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| _ | |||||||||||
| Symbol | Tymidylat_kin | ||||||||||
| Pfam | PF02223 | ||||||||||
| InterPro | IPR000062 | ||||||||||
| PROSITE | PDOC01034 | ||||||||||
| |||||||||||
Tymidylatkinas ( EC 2.7.4.9 ; dTMP-kinas ) katalyserar fosforyleringen av tymidin 5'-monofosfat (dTMP) för att bilda tymidin 5'-difosfat (dTDP) i närvaro av ATP och magnesium:
- ATP + tymidin 5'-fosfat ADP + tymidin 5'-difosfat
Tymidylatkinas är ett allestädes närvarande enzym på cirka 25 Kd och är viktigt i dTTP-syntesvägen för DNA-syntes. Funktionen av dTMP-kinas i eukaryoter kommer från studiet av en cellcykelmutant, cdc8, i Saccharomyces cerevisiae . Strukturella och funktionella analyser tyder på att cDNA kodar för autentiskt humant dTMP-kinas. mRNA-nivåerna och enzymaktiviteterna motsvarade cellcykelprogression och celltillväxtstadier.
Tymidylatkinas underfamilj är förutsagt tymidylatkinas, TKRP1. InterPro : IPR014505
Humant protein DTYMK innehåller denna domän.
Strukturstudier
I slutet av 2007 har 40 strukturer lösts för denna klass av enzymer, med PDB - accessionskoderna 1E2D , 1E2E , 1E2F , 1E2G , 1E2Q , 1E98 , 1E99 , 1E9A , 1E9B , 1E9C , 1E9B , 1E9D , 1E , 1G3U , 1GSI , 1GTV , 1MRN , 1MRS , 1N5I , 1N5J , 1N5K , 1N5L , 1NMX , 1NMY , 1NMZ , 1NN0 , 1NN1 , 1NN3 , 1NN5 , 1WCCH2 , 1WCCH , 1WCCH , 1WCCH , 1WJCCG , 2CCK , 2PBR , 2TMK , 3TMK , 4TMK och 5TMP .
Se även
- Hurwitz J (1959). "Den enzymatiska inkorporeringen av ribonukleotider i polydeoxinukleotidmaterial". J. Biol. Chem . 234 : 2351-2358. PMID 14405566 .
- Kielley RK (1970). "Rening och egenskaper hos tymidinmonofosfatkinas från mushepatom". J. Biol. Chem . 245 (16): 4204–12. PMID 4323166 .
- Nelson DJ, Carter CE (1969). "Rening och karakterisering av tymidin 5-monofosfatkinas från Escherichia coli B". J. Biol. Chem . 244 (19): 5254–62. PMID 4899016 .
