SCP2

SCP2
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, NLTP, NSL-TP, SCP-2, SCP-CHI, SCP-X, SCPX, sterolbärarprotein 2, SCOX
Externa IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS n/a
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Icke-specifikt lipid-överföringsprotein även känt som steroy bärarprotein 2 (SCP-2) eller propanoyl-CoA C-acyltransferas är ett protein som hos människor kodas av SCP2 - genen .

Fungera

Denna gen kodar för två proteiner: sterolbärarprotein X (SCPx) och sterolbärarprotein 2 (SCP2), som ett resultat av transkriptionsinitiering från 2 oberoende reglerade promotorer. Transkriptet som initieras från den proximala promotorn kodar för det längre SCPx-proteinet, och transkriptet som initieras från den distala promotorn kodar för det kortare SCP2-proteinet, med de två proteinerna som delar en gemensam C- terminal . Bevis tyder på att SCPx-proteinet är ett peroxisom -associerat tiolas som är involverat i oxidationen av grenade fettsyror, medan SCP2-proteinet tros vara ett intracellulärt lipidöverföringsprotein. Alternativ splitsning av denna gen producerar flera transkriptvarianter, varav några kodar för olika isoformer. Fullängdskaraktären för alla transkriptvarianter har inte fastställts.

Klinisk signifikans

Denna gen är starkt uttryckt i organ involverade i lipidmetabolism, och kan spela en roll i Zellwegers syndrom , där celler har brist på peroxisomer och har nedsatt gallsyrasyntes .

Interaktioner

SCP2 har visats interagera med Caveolin 1 och peroxisomal receptor PEX5 .

Vidare läsning

•   Seedorf U, Ellinghaus P, Roch Nofer J (2000). "Sterolbärarprotein-2". Biochim. Biophys. Acta . 1486 (1): 45–54. doi : 10.1016/s1388-1981(00)00047-0 . PMID 10856712 .
•   Gallegos AM, Atshaves BP, Storey SM, et al. (2001). "Genstruktur, intracellulär lokalisering och funktionella roller för sterolbärarprotein-2". Prog. Lipid Res . 40 (6): 498–563. doi : 10.1016/S0163-7827(01)00015-7 . PMID 11591437 .
•   Yamamoto R (1993). "[Lokalisering av human sterolbärarprotein 2-gen och cDNA-uttryck i COS-7-cell]". Hokkaido Igaku Zasshi . 67 (6): 839–48. PMID 1483685 .
•   Baker ME, Billheimer JT, Strauss JF (1992). "Likhet mellan den aminoterminala delen av däggdjurs 58-kD sterolbärarprotein (SCPx) och Escherichia coli acetyl-CoA acyltransferas: bevis för en genfusion i SCPx". DNA Cell Biol . 10 (9): 695–8. doi : 10.1089/dna.1991.10.695 . PMID 1755959 .
•   Schroeder F, Butko P, Nemecz G, Scallen TJ (1990). "Interaktion av fluorescerande delta 5,7,9(11),22-ergostatetraen-3 beta-ol med sterolbärarprotein-2" . J. Biol. Chem . 265 (1): 151–7. doi : 10.1016/S0021-9258(19)40208-1 . PMID 2294101 .
•   Ohba T, Holt JA, Billheimer JT, Strauss JF (1995). "Humant sterolbärarprotein x/sterolbärarprotein 2-gen har två promotorer". Biokemi . 34 (33): 10660–8. doi : 10.1021/bi00033a042 . PMID 7654720 .
•   Ohba T, Rennert H, Pfeifer SM, et al. (1995). "Strukturen av det humana sterolbärarproteinet X/sterolbärarprotein 2-genen (SCP2)" . Genomik . 24 (2): 370–4. doi : 10.1006/geno.1994.1630 . PMID 7698762 .
•   Woodford JK, Colles SM, Myers-Payne S, et al. (1995). "Sterolbärarprotein-2 stimulerar intermembransterolöverföring genom direkt membraninteraktion". Chem. Phys. Lipider . 76 (1): 73–84. doi : 10.1016/0009-3084(95)02436-M . PMID 7788802 .
•   Vesa J, Hellsten E, Barnoski BL, et al. (1994). "Tilldelning av sterolbärarprotein X/sterolbärarprotein 2 till 1p32 och dess uteslutning som den orsakande genen för infantil neuronal ceroid lipofuscinosis". Brum. Mol. Genet . 3 (2): 341–6. doi : 10.1093/hmg/3.2.341 . PMID 8004106 .
•   Seedorf U, Brysch P, Engel T, et al. (1994). "Sterolbärarprotein X är peroxisomalt 3-oxoacylkoenzym A tiolas med inneboende sterolbärare och lipidöverföringsaktivitet" . J. Biol. Chem . 269 ​​(33): 21277–83. doi : 10.1016/S0021-9258(17)31960-9 . PMID 8063752 .
•    Szyperski T, Scheek S, Johansson J, et al. (1993). "NMR-bestämning av den sekundära strukturen och det tredimensionella polypeptidryggradsvecket av det humana sterolbärarproteinet 2". FEBS Lett . 335 (1): 18–26. doi : 10.1016/0014-5793(93)80431-S . PMID 8243660 . S2CID 9969358 .
•   Seedorf U, Scheek S, Engel T, et al. (1994). "Strukturaktivitetsstudier av humant sterolbärarprotein 2" . J. Biol. Chem . 269 ​​(4): 2613–8. doi : 10.1016/S0021-9258(17)41988-0 . PMID 8300590 .
•   Yanase T, Hara T, Sakai Y, et al. (1996). "Uttryck av sterolbärarprotein 2 (SCP2) i human binjurebarkvävnad". Eur. J. Endocrinol . 134 (4): 501–7. doi : 10.1530/eje.0.1340501 . PMID 8640304 .
•   Stolowich NJ, Frolov A, Atshaves B, et al. (1997). "Sterolbärarprotein-2-fettsyrabindningsstället: en NMR, cirkulär dikroisk och fluorescensspektroskopisk bestämning". Biokemi . 36 (7): 1719–29. doi : 10.1021/bi962317a . PMID 9048555 .
•    Schalk JA, Offenberg HH, Peters E, et al. (1999). "Isolering och karakterisering av humant SCP2 cDNA och kromosomal lokalisering av genen". Mamma. Genom . 10 (6): 642–4. doi : 10.1007/s003359901062 . PMID 10341103 . S2CID 9107396 .
•   Jatzke C, Hinz HJ, Seedorf U, Assmann G (1999). "Stabilitet och bindningsegenskaper hos vildtyps- och c17s-muterat humant sterolbärarprotein 2". Biochim. Biophys. Acta . 1432 (2): 265–74. doi : 10.1016/S0167-4838(99)00114-4 . PMID 10407148 .
•   Kimura H, Fujii H, Suzuki S, et al. (1999). "Lipidbindande proteiner i råtta och mänskliga njure" . Kidney Int. Suppl . 71 : S159–62. doi : 10.1046/j.1523-1755.1999.07141.x . PMID 10412765 .
•   Huang H, Ball JM, Billheimer JT, Schroeder F (1999). "Sterolbärarprotein-2-aminoterminalen: en membraninteraktionsdomän". Biokemi . 38 (40): 13231–43. doi : 10.1021/bi990870x . PMID 10529196 .