SPTLC2
| SPTLC2- | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| identifierare | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , HSN1C, LCB2, LCB2A, NSAN1C, SPT2, hLCB2a, serinpalmitoyltransferas långkedjig bassubenhet 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Externa ID :n | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Serinpalmitoyltransferas, långkedjig bassubenhet 2, även känd som SPTLC2 , är ett protein som hos människor kodas av SPTLC2 -genen . SPTLC2 tillhör klass II pyridoxalfosfatberoende aminotransferasfamiljen.
Fungera
SPTLC2 kodar för en långkedjig bassubenhet av serinpalmitoyltransferas (SPT). Heterodimeren bildad med LCB1/SPTLC1 utgör den katalytiska kärnan. Det katalyserar den pyridoxal-5'-fosfatberoende kondensationen av L- serin med en acyl-CoA-tioester för att ge en aminoalkohol. Sammansättningen av SPT-komplexet bestämmer substratpreferensen. SPTLC1-SPTLC2-SPTSSA-komplexet visar en stark preferens för C16-CoA-substrat, medan SPTLC1-SPTLC2-SPTSSB-komplexet visar en preferens för C18-CoA-substrat.
SPT-komplexet syntetiserar molekyler som används i olika biologiska processer. Till exempel kan sfingosin, en 18-kols aminoalkohol med en omättad kolvätekedja, fosforyleras via sfingosinkinas. Det resulterande sfingosin-1-fosfatet är en potent signallipid. Sfingosin är också ett substrat för syntesen av olika andra molekyler inklusive ceramider , sfingomyelin , cerebrosider och globosider .
Epidermala ceramider är kritiska för normal hudbarriärfunktion och SPTLC2 uttrycks differentiellt över kroppsställen för att reglera epidermal ceramidsammansättning. Speciellt är SPTLC2 uppreglerad i akrala granulära keratinocyter .
Vävnadsfördelning
SPTLC2 uttrycks brett i alla vävnader.
Klinisk signifikans
Mutationer i SPTLC2 identifierades hos patienter med ärftlig sensorisk neuropati typ I.
Som svar på IL-17A och TNF är SPTLC2 starkt uppreglerad vid psoriasis och är sannolikt ansvarig för några av de epidermala ceramidförändringarna som ses i psoriasisplack.
Alternativt splitsade varianter som kodar för olika isoformer av SPTLC2 har identifierats.
SPTLC2-uttryck är kraftigt ökat på proteinnivå i hjärnan hos patienter med Alzheimers sjukdom . Inga förändringar observeras på mRNA-nivån.
Vidare läsning
- Takeda J, Yano H, Eng S, Zeng Y, Bell GI (november 1993). "En molekylär inventering av mänskliga pankreatiska öar: sekvensanalys av 1000 cDNA-kloner". Human molekylär genetik . 2 (11): 1793–1798. doi : 10.1093/hmg/2.11.1793 . PMID 7506601 .
- Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, et al. (september 1996). "Generering och analys av 280 000 mänskliga uttryckta sekvenstaggar" . Genomforskning . 6 (9): 807–828. doi : 10.1101/gr.6.9.807 . PMID 8889549 .
- Nagiec MM, Lester RL, Dickson RC (oktober 1996). "Sfingolipidsyntes: identifiering och karakterisering av däggdjurs-cDNA som kodar för Lcb2-subenheten av serinpalmitoyltransferas". Gene . 177 (1–2): 237–241. doi : 10.1016/0378-1119(96)00309-5 . PMID 8921873 .
- Weiss B, Stoffel W (oktober 1997). "Humant och murint serin-palmitoyl-CoA-transferas - kloning, uttryck och karakterisering av nyckelenzymet i sfingolipidsyntes" . European Journal of Biochemistry . 249 (1): 239–247. doi : 10.1111/j.1432-1033.1997.00239.x . PMID 9363775 .
- Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (februari 1998). "Förutsägelse av de kodande sekvenserna för oidentifierade mänskliga gener. IX. De kompletta sekvenserna av 100 nya cDNA-kloner från hjärnan som kan koda för stora proteiner in vitro" . DNA-forskning . 5 (1): 31–39. doi : 10.1093/dnares/5.1.31 . PMID 9628581 .
- Hanada K, Hara T, Nishijima M (mars 2000). "Rening av serinpalmitoyltransferaskomplexet som är ansvarigt för syntes av sfingoidbas genom att använda affinitetspeptidkromatografitekniker" . Journal of Biological Chemistry . 275 (12): 8409–8415. doi : 10.1074/jbc.275.12.8409 . PMID 10722674 .
- Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, Briones MR, Nagai MA, da Silva W, et al. (mars 2000). "Hagelgevärssekvensering av det mänskliga transkriptomet med ORF-uttryckta sekvenstaggar" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (7): 3491–3496. Bibcode : 2000PNAS...97.3491D . doi : 10.1073/pnas.97.7.3491 . PMC 16267 . PMID 10737800 .
- Dawkins JL, Brahmbhatt S, Auer-Grumbach M, Wagner K, Hartung HP, Verhoeven K, et al. (oktober 2002). "Uteslutning av serinpalmitoyltransferas långkedjig bassubenhet 2 (SPTLC2) som en vanlig orsak till ärftlig sensorisk neuropati". Neuromuskulära störningar . 12 (7–8): 656–658. doi : 10.1016/S0960-8966(02)00015-9 . PMID 12207934 . S2CID 1248860 .
- Stachowitz S, Alessandrini F, Abeck D, Ring J, Behrendt H (november 2002). "Störning av permeabilitetsbarriären ökar nivån av serinpalitoyltransferas i human epidermis" . Journal of Investigative Dermatology . 119 (5): 1048–1052. doi : 10.1046/j.1523-1747.2002.19524.x . PMID 12445191 .
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, et al. (oktober 2005). "Mot en karta i proteomskala över det mänskliga protein-proteininteraktionsnätverket". Naturen . 437 (7062): 1173–1178. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (november 2006). "Global, in vivo och platsspecifik fosforyleringsdynamik i signalnätverk" . Cell . 127 (3): 635–648. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 .
- Chen M, Han G, Dietrich CR, Dunn TM, Cahoon EB (december 2006). "Den väsentliga naturen hos sfingolipider i växter som avslöjas av den funktionella identifieringen och karakteriseringen av Arabidopsis LCB1-subenheten av serinpalmitoyltransferas" . Växtcellen . 18 (12): 3576–3593. doi : 10.1105/tpc.105.040774 . PMC 1785403 . PMID 17194770 .
- Hornemann T, Wei Y, von Eckardstein A (juli 2007). "Är däggdjursserinpalitoyltransferaset ett komplex med hög molekylär massa?" . The Biochemical Journal . 405 (1): 157–164. doi : 10.1042/BJ20070025 . PMC 1925250 . PMID 17331073 .