Lagovirus
|
|
| Lagovirus | |
|---|---|
| CryoEM rekonstruktion av kanin hemorragisk sjukdom virus (RHDV) kapsid . EMDB -post | |
| Virusklassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Riboviria |
| Rike: | Orthornavirae |
| Provins: | Pisuviricota |
| Klass: | Pisoniviricetes |
| Beställa: | Picornavirales |
| Familj: | Caliciviridae |
| Släkte: | Lagovirus |
| Arter | |
|
|
Lagovirus är ett släkte av virus i familjen Caliciviridae . Lagomorfer fungerar som naturliga värdar. Det finns två arter i detta släkte. Sjukdomar associerade med detta släkte inkluderar: nekrotiserande hepatit som leder till dödliga blödningar.
Taxonomi
Släktet innehåller följande arter:
- European Brown Hare syndrome-virus
- Kanin hemorragisk sjukdom virus
Virion egenskaper
Morfologi
Virioner består av en kapsid . Kapsiden är inte omsluten, rund med T=3 ikosaedrisk symmetri . Den isometriska kapsiden har en diameter på 35–39 nm. Partiklar med T=1-symmetri, sammansatta av 60 kapsidproteiner observeras också, vilka har en diameter på cirka 15 nm. Kapsider verkar runda till hexagonala i konturerna. Kapsidens ytstruktur avslöjar ett regelbundet mönster med särdrag. Kapsomerarrangemanget är tydligt synligt . Kapsid med 32 skålformade fördjupningar.
| Släkte | Strukturera | Symmetri | Capsid | Genomiskt arrangemang | Genomisk segmentering |
|---|---|---|---|---|---|
| Lagovirus | Icosahedral | T=1, T=3 | Ej kuverterade | Linjär | Endelad |
Livscykel
Viral replikation är cytoplasmatisk. Inträde i värdcellen uppnås genom bindning till värdreceptorer, vilket förmedlar endocytos. Replikation följer den positiva strängade RNA-virusreplikationsmodellen. Positivt strängat RNA-virustranskription är metoden för transkription. Översättning sker genom RNA-terminering-reinitiering. Lagomorfer fungerar som den naturliga värden.
| Släkte | Värdinformation | Vävnadstropism | Inträdesuppgifter | Releaseinformation | Replikeringsplats | Monteringsplats | Överföring |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Lagovirus | Lagomorfer | Lever | Cellreceptorendocytos | Lysis | Cytoplasma | Cytoplasma | Kontakt |
Fysiska och kemiska egenskaper
Molekylmassan (Mr) för virioner är 15 × 10 6 . Virioner har en flyttäthet i cesiumklorid (CsCl) på 1,33–1,36 g/cm 3 . Densitetsgradienten för virioner i kaliumtartrat-glycerol är 1,29 g/ cm 3 . Sedimentationskoefficienten är 170–187 svedberg (s 20,w ) ; av de andra är topp 160–170 svedberg (s 20,w ) (tros bestå av defekta interfererande partiklar). Under in vitro -förhållanden inaktiveras virioner i sur miljö med pH 4,5–7; stabil i alkalisk miljö med pH 7–10,5. Virioner är inte stabila vid förhöjd temperatur i närvaro av hög koncentration av Mg ++ . Virioner är känsliga för behandling med trypsin (i vissa stammar , inte känsliga för behandling med milda rengöringsmedel, eller eter eller kloroform . Infektiviteten förstärks efter behandling med trypsin (i vissa stammar) .
Genom
Genomet är inte segmenterat och innehåller en enda molekyl av linjär positiv känsla , ss RNA . Mindre arter av icke- genomisk nukleinsyra finns ibland också i virioner. Den inkapslade nukleinsyran är huvudsakligen av genomiskt ursprung, men virioner kan också innehålla subgenomiskt RNA. Det fullständiga genomet är 7450 nukleotider långt. Genomet har en guanin + cytosinhalt på 49,3–50,1 %. 5' -änden av genomet har ett vanligtvis genomkopplat protein ( VPg ), eller metylerat nukleotidlock (i fallet med hepatit E-virus ). 3'-terminalen har en poly(A) -kanal. Varje virion innehåller en fullängdskopia eller defekta störande kopior .
Proteiner
Det virala genomet kodar för viralt strukturprotein . Virioner består av 1 strukturellt protein(er) (viktiga arter som finns i kapsiden.
Viralt strukturellt protein: Kapsidprotein har en molmassa på 59000–71000 Da ; är pälsproteinet . Kapsidprotein har en molekylmassa på mindre "lösligt" 28–30 k Da .
Antigenicitet
Korsreaktivitet hittas. Korsreaktivitet mellan arter av samma serotyp , men inte med arter av en annan serotyp och vissa arter av samma serotyp, men inte med alla. Även om graden av antigen specificitet varierar med graden av släktskap, är antigeniciteten skild från serogrupper av samma släkte. De flesta arter i släktet är antigeniskt besläktade. De delar några epitoper i de strukturella proteinerna.
- ICTVdB Management (2006). 00.012.0.02. Lagovirus. I: ICTVdB—The Universal Virus Database, version 4. Büchen-Osmond, C. (Ed), Columbia University, New York, USA
externa länkar