L-isoaspartylmetyltransferas
| Protein-L-isoaspartat (D-aspartat) O-metyltransferas (PIMT, PCMT) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Kristallografisk struktur av humant L-isoaspartylmetyltransferas.
| |||||||||
| Identifierare | |||||||||
| EG nr. | 2.1.1.77 | ||||||||
| CAS-nr. | 105638-50-4 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Protein-L-isoaspartat(D-aspartat) O- | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| metyltransferasidentifierare | |||||||||||
| Symbol | PCMT | ||||||||||
| Pfam | PF01135 | ||||||||||
| InterPro | IPR000682 | ||||||||||
| PROSITE | PDOC00985 | ||||||||||
| SCOP2 | 1dl5 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||||
| |||||||||||
Protein L-isoaspartylmetyltransferas (PIMT, PCMT) , även kallat S-adenosyl-L-metionin:protein-L-isoaspartat O-metyltransferas, är ett enzym som känner igen och katalyserar reparationen av skadade L -isoaspartyl- och D - aspartylgrupper i proteiner. Det är ett mycket konserverat enzym som finns i nästan alla eukaryoter , arkebakterier och gramnegativa eubakterier.
Fungera
PIMT verkar för att överföra metylgrupper från S -adenosyl- L -metionin till alfasidokedjans karboxylgrupper i skadade L -isoaspartyl- och D -aspartylaminosyror. Enzymet tar slutmetylresten från metioninsidokedjan och lägger till den till sidokedjans karboxylgrupp av L -isoaspartat eller D -aspartat för att skapa en metylester. Efterföljande icke-enzymatiska reaktioner resulterar i en snabb omvandling till L -succinimid, som är en prekursor till aspartat och isoaspartat. L - succinimiden kan sedan genomgå icke-enzymatisk hydrolys, vilket genererar några reparerade L -aspartylrester såväl som några L -isoaspartylrester, som sedan kan gå in i cykeln igen för eventuell omvandling till den normala peptidkopplingen.
PIMT tenderar att verka på proteiner som har skadats icke-enzymatiskt på grund av ålder. Genom att utföra denna reparationsmekanism hjälper enzymet till att bibehålla den övergripande proteinintegriteten. Denna mekanism har observerats av flera grupper och har bekräftats genom experimentell testning. I en rapport hämmades PIMT av adenosindialdehyd. Resultaten stödde den föreslagna funktionen hos enzymet, eftersom mängden onormala L -aspartatrester ökade när cellerna behandlades med den indirekta hämmaren, adenosindialdehyd. Dessutom S -adenosylhomocystein känt för att vara en kompetitiv hämmare av PIMT. När PIMT inte finns i cellerna, ackumuleras de onormala aspartylrester, vilket skapar onormala proteiner som har varit kända för att orsaka dödlig progressiv epilepsi hos möss. Det har föreslagits att calmodulin kan spela en roll för att stimulera funktionen av PIMT, även om förhållandet mellan dessa två molekyler inte har undersökts noggrant. Förutom kalmodulin har guanosin 5'- O- [gamma-tio]trifosfat ( GTPgammaS ) visat sig stimulera PIMT-aktivitet.
Strukturera
Enzymet finns närvarande i human cytosol i två former på grund av alternativ splitsning och skiljer sig mellan individer i populationen på grund av en enda polymorfism vid rest 119, antingen valin eller isoleucin . Enzymstrukturen beskrivs som en "dubbelt sårad alfa/beta/alfa sandwichstruktur" som är ganska konsekvent i alla arter som hittills analyserats. Om det finns någon skillnad i sekvenserna mellan olika organismer sker den i de regioner som förbinder de tre motiven i sandwichstrukturen, men sekvensen för de individuella motiven tenderar att vara mycket konserverad. Forskare har funnit att det aktiva stället är i slingan mellan betastrukturen och den andra alfahelixen och har bestämt att den är mycket specifik för isoaspartylrester. Till exempel roteras resterna som finns vid C-terminalen av drosophila PIMT (dPIMT) 90 grader för att ge mer utrymme för ett substrat att interagera med enzymet. Faktum är att dPIMT tycks växla mellan denna unika öppna konformation och den mindre öppna konformationen som är vanlig för PIMT i andra organismer. Även om det möjligen inte är relaterat till detta, har ökade nivåer av dPIMT i drosophila korrelerats med ökad förväntad livslängd hos dessa organismer på grund av deras betydelse för proteinreparation.
Reaktion
