Haplogrupp R1

Haplogrupp R1
Haplogrupp R1
Möjlig ursprungsort	Sibirien , Centralasien , Sydasien eller Sydostasien
Förfader	R (R-M207)
Ättlingar	R1a (M420), R1b (M343)
Definiera mutationer	M173/P241/Page29, CTS916/M611/PF5859, CTS997/M612/PF6111, CTS1913/M654, CTS2565/M663, CTS2680, CTS2908/M666/CMF3123, CMTS3123, CMTS3123, CPM3123, CTS4075/M682, CTS5611/M694, CTS7085/M716/Y481, CTS8116/M730, F93/M621/PF6114, F102/M625/PF6116, F132/M632, F211/Y290, F245/M659/Y477, F7M3C/Y479, F7M3C/Y479, F7M3C/Y479 /YSC0000288, L1352/ M785/YSC0000230, M306/PF6147/S1, M640/PF6118, M643, M689, M691/CTS4862/PF6042/YSC0001281, M710/PF6132/YSC000009, M7C2YSC000009, M7C2YSC000009, M72009 5, P231, P233, P234, P236, P238/ PF6115, P242/PF6113, P245/PF6117, P286/PF6136, P294/PF6112, PF6120

Haplogroup R1 , eller R-M173 , är en Y-kromosom-DNA-haplogrupp . En primär undergrupp av Haplogroup R (R-M207), den definieras av SNP M173. Den andra primära undergruppen av Haplogroup R är Haplogroup R2 (R-M479).

Hanar som bär R-M173 i moderna populationer verkar bestå av två subklader: R1a och R1b , som huvudsakligen finns i populationer som är infödda till Eurasien (utom Öst- och Sydostasien ). R-M173 innehåller majoriteten av representanter för haplogrupp R i form av dess undergrupper, R1a och R1b ( Rosser 2000 , Semino 2000 , och Genographic 2011 ).

Strukturera

Mänskligt Y-DNA fylogenetiskt träd

Haplogrupp R1

M173 (R1)

M420 (R1a)

M459 (R1a1)

M512	(R1a1a)

	(R1a1*)

	(R1a*)

M343 (R1b)

L278 (R1b1)

L754	(R1b1a)

M335	(R1b1b)

PH155	(R1b1c)

(R1b*)

Ursprung

Ursprunget till haplogrupp R1 är fortfarande oklart. Den och dess syskonklad R2 (R-M79) är de enda omedelbara ättlingarna till Haplogroup R (R-M207). R är en direkt ättling till Haplogroup P1 (P-M45), och därför en syskonklad till Haplogroup Q (Q-M242).

Inga exempel på den basala subkladen R1* har ännu identifierats i levande individer eller fornlämningar. Emellertid var föräldrakladden R* uppenbarligen närvarande hos individer från den övre paleolitiska eran (24 000 år BP ), från Mal'ta-Buret'-kulturen i Sibirien. Det autosomala DNA från Mal'ta-Buret'-folket är en del av en grupp som är känd för forskare inom befolkningsgenetik som Ancient North Eurasians ( ANE). De första större efterkommande haplogrupperna av R1*, R1a och R1b dök sedan upp i mesolitiska Centralasien och Östeuropa, med genotyper härledda, i varierande grad, från ANE.

Allmän fördelning

Eurasien

Haplogrupp R1 är mycket vanlig i hela Eurasien utom Östasien och Sydostasien . Dess utbredning tros vara associerad med återbosättningen av Eurasien efter det sista istidsmaximum . Dess huvudsakliga undergrupper är R1a och R1b . En undergrupp av haplogrupp R1b (särskilt R1b1a2), är den vanligaste haplogruppen i Västeuropa och Bashkortostan ( Lobov 2009 ) , medan en undergrupp av haplogrupp R1a (särskilt haplogrupp R1a1 ) är den vanligaste haplogrupp i stora delar av södra Asien , Östeuropa , Centralasien , västra Kina och södra Sibirien .

Individer vars Y-kromosomer har alla mutationer på interna noder i Y-DNA-trädet ner till och inklusive M207 (som definierar Haplogroup R ) men som varken visar M173-mutationen som definierar haplogrupp R1 eller M479-mutationen som definierar Haplogrupp R2 kategoriseras som tillhörande grupp R * (R-M207). R* har hittats i 10,3% (10/97) av ett prov av Burusho och 6,8% (3/44) av ett prov av Kalash från norra Pakistan ( Firasat 2007 ) .

Amerika

Förekomsten av haplogrupp R1 bland grupper av ursprungsbefolkningar är en kontroversiell fråga. Det är nu den vanligaste haplogruppen efter de olika Q-M242 , speciellt i Nordamerika i Ojibwe -folk med 79%, Chipewyan 62%, Seminole 50%, Cherokee 47%, Dogrib 40% och Tohono O'odham 38%.

Vissa myndigheter pekar på den större likheten mellan haplogrupp R1-subklader som finns i Nordamerika och de som finns i Sibirien (t.ex. Lell och Raghavan), vilket tyder på förhistorisk immigration från Asien och/eller Beringia .

Afrika

En subclade, nu känd som R1b1a2 (R-V88), finns endast vid höga frekvenser bland populationer som är infödda i Västafrika , såsom Fulani , och tros återspegla en förhistorisk tillbakamigrering från Eurasien till Afrika. ^{[ citat behövs ]}

Subclade distribution

R1a (R-M420)

Uppdelningen av R1a (M420) beräknas till ca 25 000 år sedan (95 % KI: 21, 300–29 000 BP), eller ungefär det sista glaciala maximumet . En stor studie utförd 2014 (Underhill et al. 2015), med användning av 16 244 individer från över 126 populationer från hela Eurasien, drog slutsatsen att det fanns övertygande bevis för att "de initiala episoderna av haplogrupp R1a-diversifiering troligen inträffade i närheten av dagens Iran ." Subclade M417 (R1a1a1) diversifierade ca. 5 800 år sedan. Distributionen av M417-underlag R1-Z282 (inklusive R1-Z280) i Central- och Östeuropa och R1-Z93 i Asien antyder att R1a1a diversifierade sig inom de eurasiska stäpperna eller Mellanöstern- och Kaukasusregionen . Ursprungsplatsen för dessa underkläder spelar en roll i debatten om indoeuropéernas ursprung . Höga frekvenser av haplogrupp R1a finns bland västbengaliska brahminer (72 %) och Uttar Pradesh brahminer (67 %), Ishkashimi (68 %), tadzjikernas befolkning i Panjikent (64 %), den kirgiziska befolkningen i centrala Kirgizistan ( 63,5 %), sorber (63,39 %), Bihar -brahminer (60,53 %), Shors (58,8 %), polacker (56,4 %), teleuter (55,3 %), södra altaier (58,1 %), ukrainare (50 %) och ryssar ( 50%) ( Semino 2000 , Wells 2001 , Behar 2003 och Sharma 2007 inget

R1b (R-M343)

Haplogrupp R1b har troligen sitt ursprung i Eurasien före eller under den senaste nedisningen. Det är den vanligaste haplogruppen i Västeuropa och Bashkortostan .( Lobov 2009 ) Den kan ha överlevt det sista glaciala maximumet , i refugia nära södra Uralbergen och Egeiska havet .( Lobov 2009 ) .

Den finns också vid lägre frekvenser i hela Östeuropa, med högre mångfald än i västra Europa, vilket tyder på en gammal migration av haplogrupp R1b från öst. Haplogroup R1b finns också vid olika frekvenser i många olika populationer nära Uralbergen och Centralasien , dess troliga ursprungsregion.

Det kan finnas en korrelation mellan denna haplogrupp och spridningen av Centum- grenar indoeuropeiska språk i södra och västra Europa. Till exempel når den moderna förekomsten av R1b mellan 60 % och 90 % av den manliga befolkningen i de flesta delar av Spanien , Portugal , Frankrike , Storbritannien och Irland . Kladen finns också vid frekvenser på upp till 90 % i Tchadbassängen och finns också i Nordafrika , där dess frekvens överstiger 10 % i vissa delar av Algeriet .

Även om det är sällsynt i södra Asien , visar vissa populationer relativt höga procentsatser för R1b. Dessa inkluderar Lambadi som visar 37 % ( Kivisild 2005 ) , Hazara 32 % ( Sengupta 2005 ) och Agharia (i östra Indien ) Sengupta 2005 ) . Förutom dessa har R1b dykt upp i Balochi (8 %), Bengaler (6,5 %), Chenchu (2 %), Makrani (5 %), Newars (10,6 %), Pallan (3,5 %) och Punjabis (7,6 %) ( Kivisild 2003 , Sengupta 2005 och Gayden 2007 ).

R-M343 (tidigare kallad Hg1 ^{[ citat behövs ]} och Eu18 ^{[ citat behövs ]} ) är den vanligaste Y-kromosomhaplogruppen i Europa . Det är en utlöpare av R-M173, kännetecknad av M343- markören. En överväldigande majoritet av medlemmarna i R-M343 klassificeras som R-P25 (definierad av P25-markören), resten som R-M343* . Dess frekvens är högst i Västeuropa (och på grund av modern europeisk immigration, i delar av Amerika ). Majoriteten av R-M343-bärare av europeisk härkomst tillhör R-M269 (R1b1a2) härstammande linje.

Se även

Eurasiens historia

Genetik

Y-DNA R-M207 underkläder

R-L21
R-L295
R-M124
R-M167
R-M17
R-M173
R (R-M207)
R-M342
R-M420
R-M479
R-U106

Anförda verk

Gayden, T; Cadenas, AM; Regueiro, M; Singh, NB; Zhivotovsky, LA; Underhill, PA; Cavalli-Sforza, LL; Herrera, RJ (2007), "The Himalayas as a directional barrier to genflow." American Journal of Human Genetics , 80 (5): 884–94, doi : 10.1086/516757 , PMC 1852741 , PMID 17436243
Behar; Thomas, MG; Skorecki, K; Hammer, MF; Bulygina, E; Rosengarten, D; Jones, AL; Held, K; Moses, V (2003), "Multiple Origins of Ashkenazi Levites: Y-kromosombevis för både Near Eastern and European Ancestries" ( PDF), Am . J. Hum. Genet. vol. 73, nr. 4, s. 768–779, doi : 10.1086/378506 , PMC 1180600 , PMID 13680527
Luigi Luca Cavalli-Sforza (1994), The History and Geography of Human Genes , Princeton University Press, ISBN 978-0-691-08750-4
Cinnioğlu, C; et al. (2004), "Excavating Y-chromosome haplotype strata in Anatolia", Hum Genet , 114 (2): 127–48, doi : 10.1007/s00439-003-1031-4 , PMID 14586639 30786639 107
Passarino; et al. (2002), "Olika genetiska komponenter i den norska befolkningen avslöjade genom analys av mtDNA- och Y-kromosompolymorfismer", Eur. J. Hum. Genet. vol. 10, nr. 9, s. 521–9, doi : 10.1038/sj.ejhg.5200834 , PMID 12173029
Saha; et al. (2005), "Genetisk affinitet bland fem olika befolkningsgrupper i Indien som återspeglar ett Y-kromosom genflöde", J. Hum. Genet. vol. 50, nej. 1, s. 49–51, doi : 10.1007/s10038-004-0219-3 , PMID 15611834
Semino; et al. (2000), "The Genetic Legacy of Paleolithic Homo sapiens sapiens in Extant Europeans" (PDF) , Science , vol. 290, nr. 5494, s. 1155–9, doi : 10.1126/science.290.5494.1155 , PMID 11073453 , arkiverad från originalet (PDF) 2003-11-25
Sengupta; et al. (2005), "Polaritet och temporalitet hos högupplösta Y-kromosomdistributioner i Indien identifierar både inhemska och exogena expansioner och avslöjar mindre genetiskt inflytande från centralasiatiska pastoralister", Am. J. Hum. Genet. vol. 78, nr. 2, s. 202–21, doi : 10.1086/499411 , PMC 1380230 , PMID 16400607
Soares; et al. (2010), "The Archaeogenetics of Europe", Current Biology , 20 (4): R174–83, doi : 10.1016/j.cub.2009.11.054 , PMID 20178764 , S2CID 7679921
brunnar; et al. (2001), "The Eurasian Heartland: A continental perspective on Y-kromosom diversity", Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol. 98, nr. 18, s. 10244–9, Bibcode : 2001PNAS...9810244W , doi : 10.1073/pnas.171305098 , PMC 56946 , PMID 11526236 . Även [1]