Paragrupp
Paragroup är en term som används inom populationsgenetik för att beskriva linjer inom en haplogrupp som inte definieras av några ytterligare unika markörer .
I humana Y-kromosom-DNA-haplogrupper representeras paragrupper vanligtvis av en asterisk ( * ) placerad efter huvudhaplogruppen.
Termen "paragrupp" är en portmanteau av termerna parafyletisk haplogrupp , vilket indikerar att paragrupper bildar parafyletiska undergrupper. Förutom mutationerna som definierar moderhaplogruppen, kanske paragrupper inte har några ytterligare unika markörer. Alternativt kan paragrupper ha unika markörer som inte har upptäckts. Om en unik markör upptäcks inom en paragrupp, ges den specifika härstamningen ett unikt namn och flyttas ut ur paragruppen för att bilda en oberoende subclade.
Till exempel är paragruppen för human Y-DNA Haplogroup DE DE*. En medlem av DE* har markören som definierar DE, men inte markörerna som definierar DE:s enda kända omedelbara undergrupper, haplogrupper D och E . På samma sätt haplogruppen E1b1b1g (även känd som E-M293) ett exempel på en relativt ny undergrupp, upptäckt inom en tidigare utsedd paragrupp och tilldelad ett nytt namn. Tills SNP/UEP-markören M293 upptäcktes 2008, var medlemmarna i subclade omöjliga att skilja från andra komponenter i paragruppen E1b1b1* (även känd som E3b* och E-M35*).
Ett annat exempel är en medlem av Y-DNA- haplogruppen R (definierad av markör M207) kan tillhöra sub-haplogruppen R1 (definierad av markör M173) eller R2 (definierad av markör M124). Individer med ingen av dessa mutationer skulle kategoriseras som tillhörande haplogrupp R*.
- ^ a b Y-kromosomkonsortiet, TYC (2002). "Ett nomenklatursystem för trädet av mänskliga Y-kromosomala binära haplogrupper" ( PDF) . Genomforskning . Cold Spring Harbor Laboratory Press. 12 (2): 339–48. doi : 10.1101/gr.217602 . PMC 155271 . PMID 11827954 .
- ^ Weale, Michael E.; et al. (2003). "Sällsynta djuprotade Y-kromosomlinjer hos människor: Lektioner för phylogeography" . Genetik . 165 (1): 229–34. doi : 10.1093/genetics/165.1.229 . PMC 1462739 . PMID 14504230 .
- ^ Henn, BM; et al. (2008). "Y-kromosomala bevis på en pastoralistisk migration genom Tanzania till södra Afrika" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . PNAS. 105 (31): 10693–8. Bibcode : 2008PNAS..10510693H . doi : 10.1073/pnas.0801184105 . PMC 2504844 . PMID 18678889 .
Fylogenetiska träd av humant mitokondriellt DNA (mtDNA) haplogrupper |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mitokondriellt Eva ( L ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L0 | L1–6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L1 | L2 | L3 | L4 | L5 | L6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CZ | D | E | G | F | O | A | S | R | jag | W | X | Y | |||||||||||||||||||||||||||
C | Z | B | F | R0 | före JT | P | U | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HV | JT | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H | V | J | T |