Glykosidhydrolasfamiljen 5
| Cellulas (glykosylhydrolasfamilj 5) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifierare | |||||||||
| Symbol | Cellulas | ||||||||
| Pfam | PF00150 | ||||||||
| Pfam klan | CL0058 | ||||||||
| InterPro | IPR001547 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00565 | ||||||||
| SCOP2 | 2exo / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| OPM superfamilj | 117 | ||||||||
| OPM-protein | 2osx | ||||||||
| CAZy | GH5 | ||||||||
| Membran | 1365 | ||||||||
| |||||||||
Inom molekylärbiologi är glykosidhydrolasfamilj 5 en familj av glykosidhydrolaser .
Glykosidhydrolaser EC 3.2.1. är en utbredd grupp av enzymer som hydrolyserar glykosidbindningen mellan två eller flera kolhydrater, eller mellan en kolhydrat och en icke-kolhydratdel . Ett klassificeringssystem för glykosidhydrolaser, baserat på sekvenslikhet, har lett till definitionen av >100 olika familjer. Denna klassificering är tillgänglig på CAZy -webbplatsen och diskuteras även på CAZypedia, ett onlineuppslagsverk över kolhydrataktiva enzymer.
Glykosidhydrolasfamiljen 5 CAZY GH_5 omfattar enzymer med flera kända aktiviteter inklusive endoglukanas ( EC 3.2.1.4 ); beta-mannanas ( EC 3.2.1.78 ); exo-1,3-glukanas ( EC 3.2.1.58 ); endo-1,6-glukanas ( EC 3.2.1.75 ); xylanas ( EC 3.2.1.8 ); endoglykoceramidas ( EC 3.2.1.123 ); xantanas.
Den mikrobiella nedbrytningen av cellulosa och xylaner kräver flera typer av enzymer. Svampar och bakterier producerar ett spektrum av cellulolytiska enzymer (cellulaser) och xylanaser som på basis av sekvenslikheter kan klassificeras i familjer. En av dessa familjer är känd som cellulasfamiljen A eller som glykosylhydrolasfamiljen 5. En av de konserverade regionerna i denna familj innehåller en konserverad glutaminsyrarest som är potentiellt involverad i den katalytiska mekanismen.
I en nyligen genomförd studie som använder Molecular Dynamics -simuleringar har en avsevärd korrelation mellan termisk stabilitet och strukturell styvhet hos medlemmar av familj 5 med lösta strukturer bevisats.
