Glykosidhydrolasfamiljen 28
| Glykosylhydrolaser familj 28 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 rhamnogalakturonas a från aspergillus aculeatus
| |||||||||
| Identifierare | |||||||||
| Symbol | Glyco_hydro_28 | ||||||||
| Pfam | PF00295 | ||||||||
| Pfam klan | CL0268 | ||||||||
| InterPro | IPR000743 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00415 | ||||||||
| SCOP2 | 1rmg / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| CAZy | GH28 | ||||||||
| Membran | 73 | ||||||||
| |||||||||
Inom molekylärbiologi är glykosidhydrolasfamiljen 28 en familj av glykosidhydrolaser .
Glykosidhydrolaser EC 3.2.1. är en utbredd grupp av enzymer som hydrolyserar glykosidbindningen mellan två eller flera kolhydrater, eller mellan en kolhydrat och en icke-kolhydratdel . Ett klassificeringssystem för glykosidhydrolaser, baserat på sekvenslikhet, har lett till definitionen av >100 olika familjer. Denna klassificering är tillgänglig på CAZy -webbplatsen och diskuteras även på CAZypedia, ett onlineuppslagsverk över kolhydrataktiva enzymer.
Glykosidhydrolasfamiljen 28 CAZY GH_28 omfattar enzymer med flera kända aktiviteter; polygalakturonas ( EC 3.2.1.15 ); exo-polygalakturonas ( EC 3.2.1.67 ); exo-polygalakturonas ( EC 3.2.1.82 ); rhamnogalakturonas (EC inte definierat).
Polygalakturonas (PG) (pektinas) katalyserar den slumpmässiga hydrolysen av 1,4-alfa-D-galaktosiduronbindningar i pectate och andra galakturonaner. I frukt spelar polygalakturonas en viktig roll i cellväggens metabolism under mognad. I växtbakteriella patogener såsom Erwinia carotovora eller Ralstonia solanacearum (Pseudomonas solanacearum) och svamppatogener såsom Aspergillus niger , är polygalakturonas involverat i maceration och mjuk ruttnande av växtvävnad. Exo-poly-alfa-D-galakturonosidas ( EC 3.2.1.82 ) (exoPG) hydrolyserar peptinsyra från den icke-reducerande änden och frisätter digalakturonat. PG och exoPG delar några regioner med sekvenslikhet och tillhör familj 28 av glykosylhydrolaserna.
