Glykosidhydrolasfamiljen 13

Alfa-amylas, N-terminal ig-liknande domän
PDB 2d0h EBI.jpg
kristallstruktur av thermoactinomyces vulgaris r-47 alfa-amylas 1 (tvai) mutant d356n/e396q komplexbunden med p2, en pullulan modell oligosackarid
Identifiers
Symbol Alfa-amylas_N
Pfam PF02903
InterPro IPR004185
SCOP2 1sma / SCOPe / SUPFAM
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning
Alfa-amylas katalytisk domän
PDB 1cyg EBI.jpg
cyklodextrin glukanotransferas (ec2.4.1.19) (cgtas)
Identifierare
Symbol Alfa-amylas
Pfam PF00128
Pfam klan CL0058
InterPro IPR006047
SCOP2 1ppi / SCOPe / SUPFAM
CAZy GH13
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning

Inom molekylärbiologi är glykosidhydrolasfamiljen 13 en familj av glykosidhydrolaser .

Glykosidhydrolaser EC 3.2.1. är en utbredd grupp av enzymer som hydrolyserar glykosidbindningen mellan två eller flera kolhydrater, eller mellan en kolhydrat och en icke-kolhydratdel . Ett klassificeringssystem för glykosidhydrolaser, baserat på sekvenslikhet, har lett till definitionen av >100 olika familjer. Denna klassificering är tillgänglig på CAZy -webbplatsen och diskuteras även på CAZypedia, ett onlineuppslagsverk över kolhydrataktiva enzymer.

Enzymer som innehåller denna domän tillhör familj 13 ( CAZY GH_13 ) av glykosylhydrolaserna. Det maltogena alfa-amylaset är ett enzym som katalyserar hydrolys av (1-4)-alfa-D-glukosidbindningar i polysackarider för att avlägsna successiva alfa-maltosrester från de icke-reducerande ändarna av kedjorna vid omvandlingen av stärkelse till maltos . Andra enzymer i denna familj inkluderar neopullulanas, som hydrolyserar pullulan till panos , och cyklomaltodextrinas , som hydrolyserar cyklodextriner .