Astacin
| Astacinstruktur | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 av astacin med en hydroxamsyrahämmare
| |||||||||
| Identifierare | |||||||||
| Symbol | Astacin | ||||||||
| Pfam | PF01400 | ||||||||
| Pfam klan | CL0126 | ||||||||
| InterPro | IPR001506 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00129 | ||||||||
| MEROPS | M12 | ||||||||
| SCOP2 | 1ast / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd04280 | ||||||||
| |||||||||
| astacinidentifierare | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| _ | |||||||||
| EG nr. | 3.4.24.21 | ||||||||
| CAS-nr. | 143179-21-9 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Astaciner är en familj av multidomän metalloendopeptidaser som antingen utsöndras eller membranförankras. Dessa metallopeptidaser tillhör MEROPS- peptidasfamiljen M12, underfamiljen M12A (astacinfamiljen, klan MA(M)). Proteinvecket i peptidasdomänen för medlemmar av denna familj liknar det för thermolysin , typexemplet för klan MA och de förutsagda resterna av det aktiva stället för medlemmar av denna familj och termolysin förekommer i motivet HEXXH.
Astacinfamiljen av metalloendopeptidaser (EC 3.4.24.21) omfattar en rad proteiner som finns i hydra till människor, i mogna system och utvecklingssystem. Deras funktioner inkluderar aktivering av tillväxtfaktorer , nedbrytning av polypeptider och bearbetning av extracellulära proteiner . Proteinerna syntetiseras med N-terminala signal- och pro-enzymsekvenser, och många innehåller flera domäner C-terminala till proteasdomänen . De utsöndras antingen från celler eller är associerade med plasmamembranet .
Astacinmolekylen antar en njurform med en djup klyfta mellan dess N- och C-terminala domäner . Zinkjonen klyftan , uppvisar ett unikt penta-koordinerat bindningssätt, som involverar 3 histidinrester , en tyrosin och en vattenmolekyl (som också är bunden till karboxylatsidokedjan av Glu93). Den N-terminala domänen omfattar 2 alfa-helixar och ett 5-strängat beta-ark . Den övergripande topologin för denna domän delas av det arketypiska zink-endopeptidas-termolysinet. Astacinproteasdomäner också gemensamma drag med serralysiner , matrismetalloendopeptidaser och ormgiftproteaser ; de klyver peptidbindningar i polypeptider såsom insulin B -kedja och bradykinin , och i proteiner såsom kasein och gelatin ; och de har arylamidasaktivitet.
Historia
1965 observerade R. Zwilling under sitt doktorandarbete att oncosphaere av musbandmasken Hymenolepis diminuta lätt kläcktes in vitro i närvaro av matsmältningsvätskan från dess mellanvärd Tenebrio molitor (mjölbagge). Efter smältningen av dess proteinskal oncosphaere sina typiska krokrörelser. Samma effekt kunde inte uppnås med bovint trypsin vilket väckte frågan med vilka olika proteaser ryggradslösa djur kan smälta sin proteindiet. Detta var okänt vid den tiden. Från de små Tenebrio-baggarna kunde inte tillräcklig matsmältningsvätska för utökade studier erhållas. Men från stora kräftkulturer (Astacus astacus) var det möjligt att samla upp till 100-200 ml magsaft från de levande djuren genom att föra in en glaskapillär genom snabeln i cardia ( magen). Från den resulterande mörkbruna vätskan renades de proteolytiska fraktionerna genom gelfiltrering, anjonbyteskromatografi och affinitetskromatografi i hög grad. Det frystorkade materialet som erhålls på detta sätt har förblivit basen för alla ytterligare studier av kräftastacin, inklusive klargörandet av aminosyrasekvensen, genomisk organisation och rumslig konfiguration. På basis av sin primära struktur representerade en proteolytisk fraktion från Astacus uppenbarligen ett okänt protein och fick namnet Astacin . Förutom astacin har kräftorna ett ryggradslöst trypsin, men inget pepsin. Strax därefter, Wozney et al. har visat att astacinsekvensen är insatt i det humana benmorfogenetiska proteinet (BMP) med signifikant homologi.
Astacin familjemedlemmar
Proteiner som innehåller astacindomänen inkluderar:
- Astacin-liknande metallo-endopeptidas (ASTL)
- Benmorfogenetiskt protein 1 (BMP1)
- Meprin A subenhet alfa (MEP1A)
- Meprin A subenhet beta (MEP1B)
- Tolloidliknande protein 1 (TLL1)
- Tolloidliknande protein 2 (TLL2)
Vidare läsning
- Zwilling R, Stöcker W, red. (1997). Astacinerna. Struktur och funktion hos en ny proteinfamilj . Hamburg: Verlag Kovacs. sid. 370. ISBN 3-86064-624-9 .
