40S ribosomalt protein S3

RPS3
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, S3, ribosomalt protein S3
Externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	; ;
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

40S ribosomalt protein S3 är ett protein som hos människor kodas av RPS3 -genen .

Fungera

Ribosomer , organellerna som katalyserar proteinsyntesen , består av en liten 40S-subenhet och en stor 60S - subenhet . Tillsammans består dessa subenheter av 4 RNA -arter och cirka 80 strukturellt distinkta proteiner. Denna gen kodar för ett ribosomalt protein som är en komponent i 40S-subenheten, där den utgör en del av domänen där translation initieras. Proteinet tillhör S3P-familjen av ribosomala proteiner. Studier av mus- och råttproteiner har visat att proteinet har en extraribosomal roll som ett endonukleas involverat i reparationen av UV -inducerad DNA-skada . Proteinet verkar vara lokaliserat i både cytoplasman och kärnan men inte i nukleolen . Högre nivåer av uttryck av denna gen i kolonadenokarcinom och adenomatösa polyper jämfört med intilliggande normala kolonslemhinnor har observerats. Denna gen samtranskriberas med de små nukleolära RNA- generna U15A och U15B, som finns i dess första respektive femte intron. Som är typiskt för gener som kodar för ribosomala proteiner, finns det flera bearbetade pseudogener av denna gen spridda genom genomet.

Vidare läsning

Bommer UA, Lutsch G, Stahl J, Bielka H (1992). "Eukaryota initieringsfaktorer eIF-2 och eIF-3: interaktioner, struktur och lokalisering i ribosomala initieringskomplex". Biochimie . 73 (7–8): 1007–19. doi : 10.1016/0300-9084(91)90142-N . PMID 1742346 .
Wool IG, Chan YL, Glück A (1996). "Struktur och utveckling av däggdjursribosomala proteiner". Biochem. Cell Biol . 73 (11–12): 933–47. doi : 10.1139/o95-101 . PMID 8722009 .
Zhang XT, Tan YM, Tan YH (1990). "Isolering av ett cDNA som kodar för humant 40S ribosomalt protein s3" . Nucleic Acids Res . 18 (22): 6689. doi : 10.1093/nar/18.22.6689 . PMC 332635 . PMID 2129557 .
Kim J, Chubatsu LS, Admon A, Stahl J, Fellous R, Linn S (1995). "Implikation av däggdjursribosomalt protein S3 vid bearbetning av DNA-skada" . J. Biol. Chem . 270 (23): 13620–9. doi : 10.1074/jbc.270.23.13620 . PMID 7775413 .
Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: en enkel metod för att ersätta lockstrukturen för eukaryota mRNA med oligoribonukleotider". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Tycowski KT, Shu MD, Steitz JA (1993). "Ett litet nukleolärt RNA bearbetas från ett intron av den mänskliga genen som kodar för ribosomalt protein S3" . Genes Dev . 7 (7A): 1176–90. doi : 10.1101/gad.7.7a.1176 . PMID 8319909 .
Vladimirov SN, Ivanov AV, Karpova GG, Musolyamov AK, Egorov TA, Thiede B, Wittmann-Liebold B, Otto A (1996). "Karakterisering av de humana små ribosomala subenhetsproteinerna genom N-terminal och intern sekvensering och masspektrometri" . Eur. J. Biochem . 239 (1): 144–9. doi : 10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x . PMID 8706699 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstruktion och karakterisering av ett fullängdsanrikat och ett 5'-ändsanrikat cDNA-bibliotek". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Kenmochi N, Kawaguchi T, Rozen S, Davis E, Goodman N, Hudson TJ, Tanaka T, Page DC (1998). "En karta över 75 mänskliga ribosomala proteingener" . Genome Res . 8 (5): 509–23. doi : 10.1101/gr.8.5.509 . PMID 9582194 .
Yoshihama M, Uechi T, Asakawa S, Kawasaki K, Kato S, Higa S, Maeda N, Minoshima S, Tanaka T, Shimizu N, Kenmochi N (2002). "De mänskliga ribosomala proteingener: sekvensering och jämförande analys av 73 gener" . Genome Res . 12 (3): 379–90. doi : 10.1101/gr.214202 . PMC 155282 . PMID 11875025 .
Lee CH, Kim SH, Choi JI, Choi JY, Lee CE, Kim J (2002). "Elektronparamagnetisk resonansstudie avslöjar ett förmodat järn-svavelkluster i humant rpS3-protein". Mol. Celler . 13 (1): 154–6. PMID 11911468 .
Lim Y, Lee SM, Kim M, Lee JY, Moon EP, Lee BJ, Kim J (2002). "Fullständig genomisk struktur av mänsklig rpS3: identifiering av funktionell U15b snoRNA i den femte intronen". Gene . 286 (2): 291–7. doi : 10.1016/S0378-1119(02)00502-4 . PMID 11943484 .
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (2004). "En fysisk och funktionell karta över den mänskliga TNF-alfa/NF-kappa B-signaltransduktionsvägen". Nat. Cell Biol . 6 (2): 97–105. doi : 10.1038/ncb1086 . PMID 14743216 . S2CID 11683986 .
Jang CY, Lee JY, Kim J (2004). "RpS3, ett DNA-reparationsendonukleas och ribosomalt protein, är involverat i apoptos" . FEBS Lett . 560 (1–3): 81–5. doi : 10.1016/S0014-5793(04)00074-2 . PMID 14988002 . S2CID 27640563 .
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). "Storskalig karakterisering av HeLa cell nukleära fosfoproteiner" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .