SSU rRNA
Liten underenhet ribosomal ribonukleinsyra ( SSU rRNA ) är den minsta av de två huvudsakliga RNA- komponenterna i ribosomen . Associerat med ett antal ribosomala proteiner bildar SSU rRNA den lilla subenheten av ribosomen. Den är kodad av SSU- rDNA .
| SSU rRNA- | |
|---|---|
| identifierare | |
| Symbol | SSU |
| Rfam | CL00111 |
| Övriga uppgifter | |
| PDB- strukturer | PDBe |
Egenskaper
| Typ | SSU rRNA storlek | Arter | Längd | Anslutning | Referens |
|---|---|---|---|---|---|
| Bakteriell (prokaryotisk) | 16S | Escherichia coli | 1 541 nt | J01859.1 | |
| Archaeal (prokaryot) | 16S | Halobacterium salinarum | 1 473 nt | M38280.1 | |
| Eukaryot | 18S | Homo sapiens | 1 969 nt | M10098.1 | |
| Mitokondrie | 12S | Homo sapiens | 954 nt | NC_012920.1 | , |
| Plastid | 16S | Arabidopsis thaliana | 1 491 nt | NC_000932.1 |
Används inom fylogenetiken
SSU rRNA-sekvenser används i stor utsträckning för att bestämma evolutionära relationer mellan organismer, eftersom de är av gammalt ursprung och finns i alla kända livsformer.
Se även
- LSU rRNA : den stora subenhetens ribosomala ribonukleinsyra .