60S ribosomalt protein L3

RPL3
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, ASC-1, L3, TARBP-B, ribosomalt protein L3
Externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	n/a
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

60S ribosomalt protein L3 är ett protein som hos människor kodas av RPL3 -genen .

Fungera

Ribosomer , komplexen som katalyserar proteinsyntes, består av en liten 40S- subenhet och en stor 60S -subenhet. Tillsammans består dessa subenheter av 4 RNA-arter och cirka 80 strukturellt distinkta proteiner. RPL3 - genen kodar för ett ribosomalt protein som är en komponent i 60S-subenheten. Proteinet tillhör L3P-familjen av ribosomala proteiner och det finns i cytoplasman . Proteinet kan binda till HIV-1 TAR mRNA , och det har föreslagits att proteinet bidrar till tat -medierad transaktivering . Denna gen samtranskriberas med flera små nukleolära RNA- gener, som finns i flera av denna gens introner . Alternativa transkriptionella splitsningsvarianter, som kodar för olika isoformer, har karakteriserats. Som är typiskt för gener som kodar för ribosomala proteiner, finns det flera bearbetade pseudogener av denna gen spridda genom genomet.

Vidare läsning

Wool IG, Chan YL, Glück A (1996). "Struktur och utveckling av däggdjursribosomala proteiner". Biochem. Cell Biol . 73 (11–12): 933–47. doi : 10.1139/o95-101 . PMID 8722009 .
Adams MD, Dubnick M, Kerlavage AR, Moreno R, Kelley JM, Utterback TR, Nagle JW, Fields C, Venter JC (1992). "Sekvensidentifiering av 2 375 mänskliga hjärngener". Naturen . 355 (6361): 632–4. Bibcode : 1992Natur.355..632A . doi : 10.1038/355632a0 . PMID 1538749 . S2CID 4234345 .
Reddy TR, Suhasini M, Rappaport J, Looney DJ, Kraus G, Wong-Staal F (1995). "Molekylär kloning och karakterisering av en TAR-bindande nukleär faktor från T-celler". AIDS Res. Brum. Retrovirus . 11 (6): 663–9. doi : 10.1089/aid.1995.11.663 . PMID 7576925 .
Matoba R, Okubo K, Hori N, Fukushima A, Matsubara K (1994). "Tillägget av 5'-kodande information till ett 3'-riktat cDNA-bibliotek förbättrar analysen av genuttryck". Gene . 146 (2): 199–207. doi : 10.1016/0378-1119(94)90293-3 . PMID 8076819 .
Van Raay TJ, Connors TD, Klinger KW, Landes GM, Burn TC (1997). "En ny ribosomalt protein L3-liknande gen (RPL3L) kartläggs till den autosomala dominanta polycystiska njursjukdomsgenregionen". Genomik . 37 (2): 172–6. doi : 10.1006/geno.1996.0538 . PMID 8921388 .
Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN , Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (1999). "DNA-sekvensen av human kromosom 22" . Naturen . 402 (6761): 489–95. Bibcode : 1999Natur.402..489D . doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208 .
Duga S, Asselta R, Malcovati M, Tenchini ML, Ronchi S, Simonic T (2000). "Den introninnehållande L3 ribosomala proteingenen (RPL3): sekvensanalys och identifiering av U43 och av två nya introniska små nukleolära RNA". Biochim. Biophys. Acta . 1490 (3): 225–36. doi : 10.1016/S0167-4781(99)00237-7 . PMID 10684968 .
Uechi T, Tanaka T, Kenmochi N (2001). "En komplett karta över de mänskliga ribosomala proteingener: tilldelning av 80 gener till den cytogenetiska kartan och implikationer för mänskliga sjukdomar". Genomik . 72 (3): 223–30. doi : 10.1006/geno.2000.6470 . PMID 11401437 .
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (2002). "Riktad proteomisk analys av den mänskliga nukleolen" . Curr. Biol . 12 (1): 1–11. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298 . S2CID 14132033 .
Odintsova TI, Müller EC, Ivanov AV, Egorov TA, Bienert R, Vladimirov SN, Kostka S, Otto A, Wittmann-Liebold B, Karpova GG (2004). "Karakterisering och analys av posttranslationella modifieringar av de mänskliga stora cytoplasmatiska ribosomala subenhetsproteinerna genom masspektrometri och Edman-sekvensering". J. Protein Chem . 22 (3): 249–58. doi : 10.1023/A:1025068419698 . PMID 12962325 . S2CID 10710245 .
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (2004). "En fysisk och funktionell karta över den mänskliga TNF-alfa/NF-kappa B-signaltransduktionsvägen". Nat. Cell Biol . 6 (2): 97–105. doi : 10.1038/ncb1086 . PMID 14743216 . S2CID 11683986 .
Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, Goward ME, Aguado B, Mallya M, Mokrab Y, Huckle EJ, Beare DM, Dunham I (2005). "En genomannoteringsdriven metod för att klona det mänskliga ORFeome" . Genome Biol . 5 (10): R84. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604 . PMID 15461802 .
Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (2005). "Immunaffinitetsprofilering av tyrosinfosforylering i cancerceller". Nat. Biotechnol . 23 (1): 94–101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (2005). "Nukleolär proteomdynamik". Naturen . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .