EIF1AX

EIF1AX
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, EIF1A, EIF1AP1, EIF4C, eIF-1A, eIF-4C, eukaryotisk translationsinitieringsfaktor 1A, X-länkad, eukaryotisk translationsinitieringsfaktor 1A X-länkad Externa ID:
n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Eukaryot translationsinitieringsfaktor 1A, X-kromosomal ( eIF1A ) är ett protein som hos människor kodas av EIF1AX - genen . Denna gen kodar för en väsentlig eukaryotisk translationsinitieringsfaktor. Proteinet är en komponent i 43S pre-initiation complex (PIC), som förmedlar rekryteringen av den lilla 40S ribosomala subenheten till 5'-locket av budbärar-RNA.

Fungera

eIF1A är ett litet protein (17 kDa i spirande jäst) och en komponent i 43S-förinitieringskomplexen (PIC). eIF1A binder nära det ribosomala A-stället , på ett sätt som liknar den funktionellt relaterade bakteriella motsvarigheten IF1 .

Klinisk signifikans

Mutationer i denna gen har återkommande setts förknippade med fall av uvealt melanom med disomi 3. eIF1A är muterad i sköldkörtelcancer .

Interaktioner

EIF1AX har visat sig interagera med IPO13 .

Se även

• Eukaryota initieringsfaktorer

Vidare läsning

•   Battiste JL, Pestova TV, Hellen CU, Wagner G (januari 2000). "eIF1A-lösningsstrukturen avslöjar en stor RNA-bindande yta som är viktig för skanningsfunktionen. " Molekylär cell . 5 (1): 109–19. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80407-4 . PMID 10678173 .
•    Choi SK, Olsen DS, Roll-Mecak A, Martung A, Remo KL, Burley SK, Hinnebusch AG, Dever TE (okt 2000). "Fysisk och funktionell interaktion mellan de eukaryota ortologerna av prokaryota translationsinitieringsfaktorer IF1 och IF2" . Molekylär och cellulär biologi . 20 (19): 7183–91. doi : 10.1128/MCB.20.19.7183-7191.2000 . PMC 86272 . PMID 10982835 .
•    Mingot JM, Kostka S, Kraft R, Hartmann E, Görlich D (Jul 2001). "Importin 13: en ny förmedlare av kärnkraftsimport och -export" . EMBO Journal . 20 (14): 3685–94. doi : 10.1093/emboj/20.14.3685 . PMC 125545 . PMID 11447110 .
•    Sørensen HP, Hedegaard J, Sperling-Petersen HU, Mortensen KK (maj 2001). "Anmärkningsvärt bevarande av translationsinitieringsfaktorer: IF1/eIF1A och IF2/eIF5B är universellt distribuerade fylogenetiska markörer". IUBMB liv . 51 (5): 321–7. doi : 10.1080/152165401317190842 . PMID 11699879 . S2CID 45654480 .
•    Bohnsack MT, Regener K, Schwappach B, Saffrich R, Paraskeva E, Hartmann E, Görlich D (november 2002). "Exp5 exporterar eEF1A via tRNA från kärnor och samverkar med andra transportvägar för att begränsa translation till cytoplasman. " EMBO Journal . 21 (22): 6205–15. doi : 10.1093/emboj/cdf613 . PMC 137205 . PMID 12426392 .
•    Olsen DS, Savner EM, Mathew A, Zhang F, Krishnamoorthy T, Phan L, Hinnebusch AG (januari 2003). "Domäner av eIF1A som förmedlar bindning till eIF2, eIF3 och eIF5B och främjar ternär komplex rekrytering in vivo" . EMBO Journal . 22 (2): 193–204. doi : 10.1093/emboj/cdg030 . PMC 140105 . PMID 12514125 .
•    Marintchev A, Kolupaeva VG, Pestova TV, Wagner G (feb 2003). "Kartläggning av det bindande gränssnittet mellan mänskliga eukaryota initieringsfaktorer 1A och 5B: en ny interaktion mellan gamla partners" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 100 (4): 1535–40. Bibcode : 2003PNAS..100.1535M . doi : 10.1073/pnas.0437845100 . PMC 149867 . PMID 12569173 .
•   Agate RJ, Choe M, Arnold AP (feb 2004). "Könsskillnader i struktur och uttryck av könskromosomgenerna CHD1Z och CHD1W i zebrafinkar" . Molekylärbiologi och evolution . 21 (2): 384–96. doi : 10.1093/molbev/msh027 . PMID 14660691 .
•    Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY , Smolyar A, Bosak S , Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (okt 2005). "Mot en proteomskalakarta över det mänskliga protein-proteininteraktionsnätverket". Naturen . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
•   Kim S, Kim GJ, Miyoshi H, Moon SH, Ahn SE, Lee JH, Lee HJ, Cha KY, Chung HM (aug 2007). "Effektiviteten av förlängningsfaktor-1alfa-promotorn i embryonala stamceller från däggdjur med hjälp av lentivirala genleveranssystem". Stamceller och utveckling . 16 (4): 537–45. doi : 10.1089/scd.2006.0088 . PMID 17784828 .

externa länkar

• Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : P47813 (Eukaryotisk translationsinitieringsfaktor 1A, X-kromosom) vid PDBe-KB .