Sällsynt skärande enzym
Ett sällsynt-cutter-enzym är ett restriktionsenzym med en igenkänningssekvens som endast förekommer sällan i ett genom. Ett exempel är NotI, som skär efter den första GC av en 5'-GCGGCCGC-3'-sekvens; restriktionsenzymer med igenkänningssekvenser för sju och åtta baspar kallas ofta även för sällsynta-kutter-enzymer (sex bp-igenkänningssekvenser är mycket vanligare).
Till exempel skär enzymer med 7-nukleotidigenkänningsställen en gång var 4:e 7 bp (16 384 bp) och de med 8-nukleotidigenkänningsställen skär var 4:e 8 bp (65 536 bp). De används i top-down kartläggning för att skära en kromosom i bitar av dessa storlekar i genomsnitt.
externa länkar
- Bio-Medicine.coms definition
- Veselkov AG, Demidov VV, Nielson PE, Frank-Kamenetskii MD (juli 1996). "En ny klass av sällsynta genomskärare" . Nucleic Acids Res . 24 (13): 2483–7. doi : 10.1093/nar/24.13.2483 . PMC 145980 . PMID 8692685 .
- TA Brown (2006). Genomes (3:e upplagan). Garland Science. ISBN 0815341385 .
