Protoparvovirus

Protoparvovirus
	Elektronmikrofotografi av hundparvovirus
Virusklassificering
(orankad):	Virus
Rike :	Monodnaviria
Rike:	Shotokuvirae
Provins:	Cossaviricota
Klass:	Quintoviricetes
Beställa:	Piccovirales
Familj:	Parvoviridae
Underfamilj:	Parvovirinae
Släkte:	Protoparvovirus
Art
	se text

Protoparvovirus är ett släkte av virus i underfamiljen Parvovirinae av virusfamiljen Parvoviridae . Ryggradsdjur fungerar som naturliga värdar. Det finns 15 arter i släktet, inklusive gnagare protoparvovirus 1, för vilket exemplet virus är små virus av möss (MVM). Detta släkte inkluderar även hundparvovirus (CPV), som orsakar skador i mag-tarmkanalen hos valpar som är cirka 80 % dödliga, och porcint parvovirus (PPV), som är en viktig orsak till fosterdöd och infertilitet hos grisar. Släktet delar sig fylogenetiskt i två grenar, en som innehåller många grundare av familjen, såsom MVM, CPV och PPV, som har studerats i avsevärd detalj, och en andra gren som uteslutande ockuperas av förutspådda virus vars kodande sekvenser identifierades nyligen i det vilda med hjälp av virusupptäcktsmetoder, men vars biologi förblir minimalt utforskad. Denna andra gren innehåller för närvarande två arter vars medlemmar infekterar människor, kallade Primate protoparvovirus 1 och Primate protoparvovirus 3 . Fram till 2014 kallades släktet Parvovirus , men det döptes om för att eliminera förvirring mellan medlemmar av detta släkte och medlemmar av hela familjen Parvoviridae .

Taxonomi

15 arter är för närvarande erkända, många innehåller flera namngivna virus, virusstammar, genotyper eller serotyper. När den tillämpas på virus är definitionen av art lite ovanlig. Det är helt enkelt ett abstrakt taxonomiskt koncept som samlar ett urval av genetiska varianter, vilket hjälper till att särskilja grenar i en fylogenetisk härstamning, men det är inte en fysisk enhet som ett virus som kan infektera ett djur eller isoleras. Om mångfaldsnivån som används för att definiera en art sätts mycket lågt kommer många effektivt att innehålla ett enda virus, och viruset och arten kan till och med få samma namn, vilket resulterar i förvirring mellan de två begreppen i litteraturen och marginalisering av den fylogenetiska arttaxons roll. För att motverka detta problem är mångfaldsnivån som nu erkänns för arter i Parvoviridae relativt bred: arter definieras som ett kluster av liknande virus som kodar för ett särskilt replikationsprotein, vanligtvis kallat NS1, som är minst 85 % identiskt med det protein som kodas av andra medlemmar av arten.

Erkända arter i släktet Protoparvovirus inkluderar:

Carnivore protoparvovirus 1 (som inkluderar virusen hundparvovirus och kattparvovirus );
Köttätare protoparvovirus 2
Köttätare protoparvovirus 3
Köttätare protoparvovirus 4
Chiropteran protoparvovirus 1 (megabat bufavirus 1);
Eulipotyphla protoparvovirus 1 (Mpulungu bufavirus);
Primatprotoparvovirus 1 (human bufavirus);
Primatprotoparvovirus 2 (apviruset Wuharv parvovirus 1);
Primatprotoparvovirus 3 (cutavirus);
Primat protoparvovirus 4
Gnagarprotoparvovirus 1 (som inkluderar H-1-parvovirus, Kilham-råttvirus, LuIII-virus, minutvirus från möss , musparvovirus, tumörvirus X och råttminutvirus);
Gnagare protoparvovirus 2 (rått parvovirus 1)
Gnagarprotoparvovirus 3 (råttbufavirus SY-2015);
Hovdjur protoparvovirus 1 ( svin parvovirus )
Hovdjursprotoparvovirus 2 (protoparvovirus Zsana/2013/HUN);

Protoparvovirus som infekterar människor upptäcktes först 2012 i avföring från barn från Burkina Faso och namngavs med hjälp av siglum bufavirus. Tre genotyper av bufavirus har hittills upptäckts, som cirkulerar i Tunisien, Finland och Bhutan

Ett andra virus i detta släkte som infekterar människor — cutavirus — isolerades från början från avföring från barn med diarré.

Ett tredje potentiellt humant protoparvovirus — tusavirus 1 — har rapporterats i avföringen från en enda människa, men om det kan infektera människor eller inte, eller inte, återstår att klargöra.

Strukturera

Virus i släktet Protoparvovirus har icke-höljeförsedda proteinkapsider runt 18–26 nm i diameter, som visar T=1 ikosaedrisk symmetri. Genom är enkelsträngat linjärt DNA mellan 4–6 kb i längd, med små (100–500b) imperfekta palindromiska sekvenser vid varje ände som viker sig för att bilda distinkta duplexa hårnålstelomerer.

Släkte	Strukturera	Symmetri	Capsid	Genomiskt arrangemang	Genomisk segmentering
Protoparvovirus	Icosahedral	T=1	Ej kuverterade	Linjärt ssDNA	Nej

Kapsiden tros bestå av 60 VP-proteiner (), både VP1 och VP2.

Genomisk organisation

Protoparvovirusgenomet har två ORF:er . Den icke-strukturella ORF (NS) är den "första" på 5'-sidan, med den strukturella (VP) på 3'-änden. Genomet uttrycks genom omfattande alternativ splitsning . Detta tillåter inte bara att VP uttrycks, utan producerar också flera alternativt skarvade versioner av varje ORF, typiskt kallade NS1, NS2(P,Y,L), VP1 och VP2. Några exempel på annoterade proteiner från UniProt är:

NS1 från Minute virus av möss (MVM),
NS2 av MVM,
VP1 av hundparvovirus (CPV),
VP2 för CPV,

Livscykel

Viral replikation är nukleär. Inträde i värdcellen uppnås genom bindning till värdreceptorer, vilket förmedlar clathrin-medierad endocytos. Replikering följer modellen med rullande hårnålar. I vissa virus/värdcellskombinationer kan avkommavirioner transporteras genom cytoplasman i vesiklar och frisättas från föräldravärdcellen före celldöd, medan de återstående virionerna frisätts efter cellys. Ryggradsdjur från 6 ordnar är för närvarande kända för att fungera som naturliga värdar. Smittvägar är vanligtvis fekal-orala och/eller andningsvägar.

Släkte	Värdinformation	Vävnadstropism	Inträdesuppgifter	Releaseinformation	Replikeringsplats	Monteringsplats	Överföring
Protoparvovirus	Ryggradsdjur	Variabel	endocytos	tidig vesikulär export/celllys	Kärna	Kärna	fekal-oral eller respiratorisk

Historia

Kilham-råttvirus, isolerat 1959, var den första medlemmen i denna familj av små, linjära, enkelsträngade DNA-virus som identifierades.

Under de följande åren extraherades en serie fysiskt liknande virus, inklusive H1, LuIII, små virus från möss och tumörvirus X, från celler eller vävnader i rutinmässig användning i forskningslaboratorier och porcint parvovirus, PPV, en av de främsta orsakerna till reproduktionssvikt hos svin, isolerades från infekterade grisar. År 1971 erkändes alla dessa virus som en del av ett taxonomiskt släkte kallat Parvovirus i den första rapporten från den nyskapade International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)

Den andra ICTV-rapporten, publicerad 1976, etablerade familjen Parvoviridae , som vid den tiden inkluderade tre släkten, varav ett behöll namnet Parvovirus och innehöll alla ovan nämnda virus plus felint panleukopeniavirus (nu kallat felint parvovirus , förkortat FPV) , som hade visat sig orsaka epidemier av enterit, panleukopeni och medfödd cerebellär ataxi hos huskatter. 1978 uppstod ett virus från samma art som FPV som kunde infektera hundar (kallat hundparvovirus eller CPV), som snabbt spreds globalt och orsakade pandemier av svår tarm- och kranskärlssjukdom.

Genus Parvovirus fortsatte att samla nya virus fram till 2014, då dess namn ändrades till Protoparvovirus .

externa länkar