Mikrobiologins grenar

Livsmedelsmikrobiologiska laboratoriet vid fakulteten för livsmedelsteknologi, Lettlands universitet för biovetenskap och teknologi .

Mikrobiologins grenar kan delas in i rena och tillämpade vetenskaper . Mikrobiologi kan också klassificeras baserat på taxonomi , när det gäller bakteriologi , mykologi , protozoologi och fykologi . Det finns en betydande överlappning mellan de specifika grenarna av mikrobiologi med varandra och med andra discipliner, och vissa aspekter av dessa grenar kan sträcka sig utanför mikrobiologins traditionella räckvidd. Generellt kan mikrobiologins område delas in i den mer grundläggande grenen (ren mikrobiologi). och den tillämpade mikrobiologin ( bioteknik ). Inom det mer fundamentala området studeras organismerna som själva ämnet på en djupare (teoretisk) nivå. Tillämpad mikrobiologi avser de områden där mikroorganismerna används i vissa processer som bryggning eller fermentering. Organismerna i sig studeras ofta inte som sådana, utan används för att upprätthålla vissa processer.

Ren mikrobiologi

Bakteriologi : studiet av bakterier
Mykologi : studiet av svampar
Protozoologi : studiet av protozoer
Fykologi /algologi: studiet av alger
Parasitologi : studiet av parasiter
Immunologi : studiet av immunsystemet
Virologi : studiet av virus
Nematologi : studiet av nematoder
Mikrobiell cytologi : studiet av mikroskopiska och submikroskopiska detaljer hos mikroorganismer
Mikrobiell fysiologi: studiet av hur den mikrobiella cellen fungerar biokemiskt. Inkluderar studiet av mikrobiell tillväxt, mikrobiell metabolism och mikrobiell cellstruktur
Mikrobiell patogenes : studiet av patogener som råkar vara mikrober
Mikrobiell ekologi : förhållandet mellan mikroorganismer och deras miljö
Mikrobiell genetik : studiet av hur gener är organiserade och reglerade i mikrober i relation till deras cellulära funktioner Nära besläktad med molekylärbiologins område
Cellulär mikrobiologi : en disciplin som överbryggar mikrobiologi och cellbiologi
Evolutionär mikrobiologi: studiet av evolutionen av mikrober. Detta fält kan delas in i:
- Mikrobiell taxonomi: namngivning och klassificering av mikroorganismer
  - Bakteriell taxonomi : namngivning och klassificering av bakterier
- Mikrobiell systematik: studiet av mikroorganismers mångfald och genetiska förhållande
- Mikrobiell fylogenetik : studiet av det sätt på vilket olika grupper av mikroorganismer är genetiskt besläktade
- Bakteriell fylodynamik : studiet av immunologi , epidemiologi och fylogenetik hos bakteriella patogener för att bättre förstå deras evolutionära roll
- Viral fylodynamik : studiet av hur epidemiologiska , immunologiska och evolutionära processer verkar och potentiellt interagerar för att forma virala fylogenier
Generationsmikrobiologi: studiet av de mikroorganismer som har samma karaktärer som sina föräldrar
Systemmikrobiologi: en disciplin som överbryggar systembiologi och mikrobiologi.
Molekylär mikrobiologi : studiet av de molekylära principerna för de fysiologiska processerna i mikroorganismer

Övrig

Astromikrobiologi : studiet av mikroorganismer i yttre rymden
Biologiskt agens : studiet av de mikroorganismer som används i vapenindustrier.
Nanomikrobiologi : studiet av dessa mikroskopiska organismer på nanonivå.
Förutsägande mikrobiologi : kvantifiering av relationer mellan kontrollerande faktorer i livsmedel och reaktioner från patogena och förstörande mikroorganismer med hjälp av matematisk modellering

Tillämpad mikrobiologi

Medicinsk mikrobiologi : studiet av patogena mikrober och mikrobers roll i mänskliga sjukdomar. Inkluderar studiet av mikrobiell patogenes och epidemiologi och är relaterat till studiet av sjukdomspatologi och immunologi . Detta område av mikrobiologi omfattar också studiet av mänsklig mikrobiota , cancer och tumörens mikromiljö .
Farmaceutisk mikrobiologi : studiet av mikroorganismer som är relaterade till produktionen av antibiotika, enzymer, vitaminer, vacciner och andra farmaceutiska produkter och som orsakar farmaceutisk kontaminering och fördärv.
Industriell mikrobiologi : exploatering av mikrober för användning i industriella processer. Exempel är industriell jäsning och avloppsvattenrening . Nära kopplat till bioteknikindustrin . Detta område inkluderar också bryggning , en viktig tillämpning av mikrobiologi.
Mikrobiell bioteknik: manipulering av mikroorganismer på genetisk och molekylär nivå för att generera användbara produkter.
Livsmedelsmikrobiologi : studiet av mikroorganismer som orsakar matförstöring och livsmedelsburna sjukdomar. Använda mikroorganismer för att producera livsmedel, till exempel genom jäsning.
Jordbruksmikrobiologi : studiet av jordbruksrelevanta mikroorganismer. Detta fält kan ytterligare klassificeras i följande:
- Växtmikrobiologi och växtpatologi : Studiet av växelverkan mellan mikroorganismer och växter och växtpatogener.
- Markmikrobiologi : studiet av de mikroorganismer som finns i marken.
Veterinär mikrobiologi: studiet av mikrobernas roll i veterinärmedicin eller djurtaxonomi .
Miljömikrobiologi : studiet av mikrobers funktion och mångfald i deras naturliga miljöer. Detta involverar karakterisering av nyckelbakteriella livsmiljöer som rhizosfären och fyllosfären , jord- och grundvattenekosystem , öppna hav eller extrema miljöer ( extremofiler ) . Detta område inkluderar andra grenar av mikrobiologi som:
- Mikrobiell ekologi
- Mikrobiellt medierad näringskretslopp
- Geomikrobiologi
- Mikrobiell mångfald
- Bioremediering : användning av mikroorganismer för att rena luft, vatten och jordar.
Vattenmikrobiologi (eller akvatisk mikrobiologi): Studiet av de mikroorganismer som finns i vatten.
Aeromikrobiologi (eller luftmikrobiologi): Studiet av luftburna mikroorganismer.
Bioteknik : relaterad till rekombinant DNA-teknik eller genteknik.