IRGM

IRGM-
identifierare
	, IFI1, IRGM1, LRG-47, LRG47, immunitetsrelaterad GTPase M, immunitetsrelaterad GTPase M
Externa IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS n/a
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Immunitetsrelaterat GTPase-familjen M-protein (IRGM), även känt som interferon-inducerbart protein 1 (IFI1), är ett enzym som hos människor kodas av IRGM - genen .

IRGM är en medlem av den interferoninducerbara GTPase- familjen. Det kodade proteinet kan spela en roll i det medfödda immunsvaret genom att reglera autofagibildning som svar på intracellulära patogener.

Genen har inaktiverats av ett Alu-element i minst 25 miljoner år i primatlinjen , vilket leder till människoapor inklusive människor, men den återaktiverades av ett endogent retrovirus som heter ERV-9.

Klinisk relevans

Polymorfismer som påverkar det normala uttrycket av denna gen är associerade med en känslighet för Crohns sjukdom och tuberkulos .

Vidare läsning

•    Laukens D, Georges M, Libioulle C, Sandor C, Mni M, Vander Cruyssen B, et al. (november 2010). "Bevis för betydande överlappning mellan vanliga riskvarianter för Crohns sjukdom och ankyloserande spondylit" . PLOS ETT . 5 (11): e13795. Bibcode : 2010PLoSO...513795L . doi : 10.1371/journal.pone.0013795 . PMC 2970560 . PMID 21072187 .
•   Henckaerts L, Van Steen K, Verstreken I, Cleynen I, Franke A, Schreiber S, et al. (september 2009). "Genetisk riskprofilering och förutsägelse av sjukdomsförlopp hos patienter med Crohns sjukdom" . Klinisk gastroenterologi och hepatologi . 7 (9): 972–980.e2. doi : 10.1016/j.cgh.2009.05.001 . PMID 19422935 .
•   Palomino-Morales RJ, Oliver J, Gómez-García M, López-Nevot MA, Rodrigo L, Nieto A, et al. (juni 2009). "Association av ATG16L1- och IRGM-generpolymorfismer med inflammatorisk tarmsjukdom: en metaanalysmetod" . Gener och immunitet . 10 (4): 356–64. doi : 10.1038/gene.2009.25 . PMID 19491842 .
•    Intemann CD, Thye T, Niemann S, Browne EN, Amanua Chinbuah M, Enimil A, et al. (september 2009). "Autophagy genvariant IRGM -261T bidrar till skydd mot tuberkulos orsakad av Mycobacterium tuberculosis men inte av M. africanum-stammar" . PLOS Patogener . 5 (9): e1000577. doi : 10.1371/journal.ppat.1000577 . PMC 2735778 . PMID 19750224 .
•   Che N, Li S, Gao T, Zhang Z, Han Y, Zhang X, et al. (november 2010). "Identifiering av en ny IRGM-promotor enkel nukleotidpolymorfism associerad med tuberkulos". Clinica Chimica Acta; International Journal of Clinical Chemistry . 411 (21–22): 1645–9. doi : 10.1016/j.cca.2010.06.009 . PMID 20547146 .
•   Dema B, Fernández-Arquero M, Maluenda C, Polanco I, Figueredo MA, de la Concha EG, et al. (november 2009). "Brist på association av NKX2-3, IRGM och ATG16L1 inflammatoriska tarmsjukdomskänslighetsvarianter med celiaki". Human Immunology . 70 (11): 946–9. doi : 10.1016/j.humimm.2009.08.004 . PMID 19683022 .
•    Zhang ZD, Frankish A, Hunt T, Harrow J, Gerstein M (2010). "Identifiering och analys av enhetliga pseudogener: historiska och samtida genförluster hos människor och andra primater" . Genombiologi . 11 (3): R26. doi : 10.1186/gb-2010-11-3-r26 . PMC 2864566 . PMID 20210993 .
•    Wolfkamp SC, Te Velde AA, Weersma RK, Ponsioen CY, Stokkers PC (augusti 2010). "Finns det en roll för Crohns sjukdom-associerade autofagi gener ATG16L1 och IRGM i bildandet av granulom?". European Journal of Gastroenterology & Hepatology . 22 (8): 933–7. doi : 10.1097/MEG.0b013e32833775e6 . PMID 20395867 . S2CID 20331665 .
•    Singh SB, Ornatowski W, Vergne I, Naylor J, Delgado M, Roberts E, et al. (december 2010). "Human IRGM reglerar autofagi och cellautonoma immunitetsfunktioner genom mitokondrier" . Naturens cellbiologi . 12 (12): 1154–65. doi : 10.1038/ncb2119 . PMC 2996476 . PMID 21102437 .
•    Latiano A, Palmieri O, Corritore G, Valvano MR, Bossa F, Cucchiara S, et al. (juli 2010). "Varianter vid 3p21-lokuset påverkar känslighet och fenotyp både hos vuxna och tidigt debuterande patienter med inflammatorisk tarmsjukdom". Inflammatoriska tarmsjukdomar . 16 (7): 1108–17. doi : 10.1002/ibd.21176 . hdl : 10533/126913 . PMID 20024904 . S2CID 34309305 .
•    Delgado M, Singh S, De Haro S, Master S, Ponpuak M, Dinkins C, et al. (januari 2009). "Autofagi och mönsterigenkänningsreceptorer i medfödd immunitet" . Immunologiska recensioner . 227 (1): 189–202. doi : 10.1111/j.1600-065X.2008.00725.x . PMC 2788953 . PMID 19120485 .
•   Törkvist L, Halfvarson J, Ong RT, Lördal M, Sjöqvist U, Bresso F, et al. (juni 2010). "Analys av 39 riskloki för Crohns sjukdom hos svenska patienter med inflammatorisk tarmsjukdom". Inflammatoriska tarmsjukdomar . 16 (6): 907–9. doi : 10.1002/ibd.21105 . PMID 19760754 .
•   Budarf ML, Goyette P, Boucher G, Lian J, Graham RR, Claudio JO, et al. (januari 2011). "En riktad associationsstudie i systemisk lupus erythematosus identifierar flera mottaglighetsalleler" . Gener och immunitet . 12 (1): 51–8. doi : 10.1038/gene.2010.47 . PMID 20962850 .
•    Bekpen C, Xavier RJ, Eichler EE (december 2010). "Human IRGM-gen "att vara eller inte vara" " . Seminarier i immunopatologi . 32 (4): 437–44. doi : 10.1007/s00281-010-0224-x . PMID 20737271 . S2CID 39006249 .
•    Cleynen I, Mahachie John JM, Henckaerts L, Van Moerkercke W, Rutgeerts P, Van Steen K, Vermeire S (september 2010). "Molekylär omklassificering av Crohns sjukdom genom klusteranalys av genetiska varianter" . PLOS ETT . 5 (9): e12952. Bibcode : 2010PLoSO...512952C . doi : 10.1371/journal.pone.0012952 . PMC 2944846 . PMID 20886065 .
•    Wagner J, Sim WH, Ellis JA, Ong EK, Catto-Smith AG, Cameron DJ, et al. (november 2010). "Interaktion mellan gener för känslighet för Crohns sjukdom i en australisk pediatrisk kohort" . PLOS ETT . 5 (11): e15376. Bibcode : 2010PLoSO...515376W . doi : 10.1371/journal.pone.0015376 . PMC 2975706 . PMID 21079743 .
•    Meggyesi N, Kiss LS, Koszarska M, Bortlik M, Duricova D, Lakatos L, et al. (november 2010). "NKX2-3- och IRGM-varianter är associerade med sjukdomskänslighet för IBD hos östeuropeiska patienter" . World Journal of Gastroenterology . 16 (41): 5233–40. doi : 10.3748/wjg.v16.i41.5233 . PMC 2975094 . PMID 21049557 .

Denna artikel innehåller text från United States National Library of Medicine, som är allmän egendom .