Glykosidhydrolasfamiljen 6

Glykosylhydrolaser familj 6
Identifierare
Symbol Glyco_hydro_6
Pfam PF01341
InterPro IPR001524
SCOP2 1cb2 / SCOPe / SUPFAM
CAZy GH6
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning

Inom molekylärbiologi är glykosidhydrolasfamilj 6 en familj av glykosidhydrolaser .

Glykosidhydrolaser EC 3.2.1. är en utbredd grupp av enzymer som hydrolyserar glykosidbindningen mellan två eller flera kolhydrater, eller mellan en kolhydrat och en icke-kolhydratdel . Ett klassificeringssystem för glykosidhydrolaser, baserat på sekvenslikhet, har lett till definitionen av >100 olika familjer. Denna klassificering är tillgänglig på CAZy -webbplatsen och diskuteras även på CAZypedia, ett onlineuppslagsverk över kolhydrataktiva enzymer.

Glykosidhydrolasfamiljen 6 CAZY GH_6 omfattar enzymer med flera kända aktiviteter inklusive endoglukanas ( EC 3.2.1.4 ) och cellobiohydrolas ( EC 3.2.1.91 ). Dessa enzymer var tidigare kända som cellulasfamiljen B. 3D-strukturen av den enzymatiska kärnan av cellobiohydrolas II (CBHII) från svampen Trichoderma reesei avslöjar ett alfa-beta-protein med en veckning som liknar den allestädes närvarande fattopologin som först sågs i triosfosfatisomeras . Den aktiva platsen för CBHII är belägen vid den C-terminala änden av ett parallellt betarör, i en sluten tunnel genom vilken cellulosa tränger. Två asparaginsyrarester , belägna i mitten av tunneln, är de troliga katalytiska resterna.