Glykosidhydrolasfamiljen 33

PDB 4sli EBI.jpg
Sialidas, N-terminala
domänidentifierare
Symbol Sialidas
Pfam PF02973
InterPro IPR004124
SCOP2 1sli / SCOPe / SUPFAM
CAZy GH33
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning

Inom molekylärbiologi är glykosidhydrolasfamiljen 33 en familj av glykosidhydrolaser .

Glykosidhydrolaser EC 3.2.1. är en utbredd grupp av enzymer som hydrolyserar glykosidbindningen mellan två eller flera kolhydrater, eller mellan en kolhydrat och en icke-kolhydratdel . Ett klassificeringssystem för glykosidhydrolaser, baserat på sekvenslikhet, har lett till definitionen av >100 olika familjer. Denna klassificering är tillgänglig på CAZy -webbplatsen och diskuteras även på CAZypedia, ett onlineuppslagsverk över kolhydrataktiva enzymer.

Denna familj innehåller sialidaser ( CAZY GH_33 ), som hydrolyserar alfa-(2->3)-, alfa-(2->6)-, alfa-(2->8)-glykosidbindningar av terminala sialiska rester i oligosackarider , glykoproteiner glykolipider , colominsyra och syntetiska substrat . Sialidaser kan fungera som patogena faktorer vid mikrobiella infektioner. 1,8 A - strukturen av trans-sialidas från blodiggel ( Macrobdella decora ,) i komplex med 2-deoxi-2,3-didehydro-NeuAc löstes. Den förfinade modellen som innefattar resterna 81-769 har en katalytisk beta-propellerdomän, en N-terminal lektinliknande domän och en oregelbunden betasträngad domän insatt i den katalytiska domänen.