Glykosidhydrolasfamiljen 29

Alfa-L-fucosidas
PDB 1hl8 EBI.jpg
kristallstruktur av thermotoga maritima alfa-fucosidas
Identifiers
Symbol Alpha_L_fucos
Pfam PF01120
Pfam klan CL0058
InterPro IPR000933
PROSITE PDOC00324
SCOP2 1hl9 / SCOPe / SUPFAM
CAZy GH29
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning

Inom molekylärbiologi är glykosidhydrolasfamiljen 29 en familj av glykosidhydrolaser .

Glykosidhydrolaser EC 3.2.1. är en utbredd grupp av enzymer som hydrolyserar glykosidbindningen mellan två eller flera kolhydrater, eller mellan en kolhydrat och en icke-kolhydratdel . Ett klassificeringssystem för glykosidhydrolaser, baserat på sekvenslikhet, har lett till definitionen av >100 olika familjer. Denna klassificering är tillgänglig på CAZy -webbplatsen och diskuteras även på CAZypedia, ett onlineuppslagsverk över kolhydrataktiva enzymer.

Glykosidhydrolasfamiljen 29 inkluderar alfa-L-fukosidaser . De är lysosomala enzymer som är ansvariga för att hydrolysera den alfa-1,6-kopplade fukosen som är förenad med den reducerande änden av N-acetylglukosamin i kolhydratgrupperna i glykoproteiner . Alfa-L-fukosidas är ansvarigt för att hydrolysera den alfa-1,6-kopplade fukosen som är förenad med den reducerande änden av N-acetylglukosamin i kolhydratgrupperna i glykoproteiner .

Fukosylerade glykokonjugat är involverade i många biologiska händelser, vilket gör alfa-l-fukosidaser, de enzymer som är ansvariga för deras bearbetning, av avgörande betydelse. Brist på alfa-l-fukosidasaktivitet är associerad med fucosidos, en lysosomal lagringsstörning som kännetecknas av snabb neurodegeneration, vilket resulterar i allvarlig mental och motorisk försämring. Enzymet är en hexamer och uppvisar en tvådomänsveckning, sammansatt av en katalytisk (beta/alfa)(8)-liknande domän och en C-terminal beta-sandwichdomän .

Drosophila melanogaster spermatozoer innehåller ett alfa-l-fucosidas som kan vara involverat i befruktning genom att interagera med alfa-l-fukosrester på mikropylen av äggskalet. I mänskliga spermier är membranassocierat alfa-l-fukosidas stabilt under långa tidsperioder, vilket möjliggörs av membrandomäner och kompartmentalisering . Dessa hjälper till att bevara proteinintegriteten.

Den här artikeln innehåller text från det offentliga området Pfam och InterPro : IPR000933