Glykosidhydrolasfamiljen 19

Glycosyl hydrolases family 19
PDB 2baa EBI.jpg
den raffinerade kristallstrukturen av ett endokitinas från hordeum vulgare l. frön till 1,8 Ångströms upplösning
Identifierare
Symbol Glyco_hydro_19
Pfam PF00182
Pfam klan CL0037
InterPro IPR000726
PROSITE PDOC00620
SCOP2 2baa / SCOPe / SUPFAM
CAZy GH19
CDD cd00325
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning

Inom molekylärbiologi är glykosidhydrolasfamiljen 19 en familj av glykosidhydrolaser .

Glykosidhydrolaser EC 3.2.1. är en utbredd grupp av enzymer som hydrolyserar glykosidbindningen mellan två eller flera kolhydrater, eller mellan en kolhydrat och en icke-kolhydratdel . Ett klassificeringssystem för glykosidhydrolaser, baserat på sekvenslikhet, har lett till definitionen av >100 olika familjer. Denna klassificering är tillgänglig på CAZy -webbplatsen och diskuteras även på CAZypedia, ett onlineuppslagsverk över kolhydrataktiva enzymer. å[ _]9

Glykosidhydrolasfamiljen 19 CAZY GH_19 omfattar enzymer med endast en känd aktivitet; kitinas ( EC 3.2.1.14 ).

Kitinaser är enzymer som katalyserar hydrolysen av beta-1,4-N-acetyl-D-glukosaminbindningarna i kitinpolymerer. Kitinaser tillhör glykosidhydrolasfamiljerna 18 eller 19. Kitinaser av familj 19 (även kända som klasserna IA eller I och IB eller II) är enzymer från växter som fungerar i försvaret mot svamp- och insektspatogener genom att förstöra deras kitininnehållande cellvägg . Klass IA/I och IB/II enzymer skiljer sig åt i närvaro (IA/I) eller frånvaro (IB/II) av en N-terminal kitinbindande domän. Den katalytiska domänen av dessa enzymer består av cirka 220 till 230 aminosyrarester.

Aktiv sida

Aktivt ställe för gykosidhydrolasfamiljen 19 papayakitinas (​) . Konserverade rester visas kring den katalytiska syran, Glu67. En GlcNAc2-enhetsbindning i -1- och +1-subställena visas i smal stickrepresentation och en pil indikerar positionen för det glykosidiska syret.

GH19-enzymer har ett konserverat sekvensmotiv ([FHY]-GRG-[AP]-ζ-Q-[IL]-[ST]-[FHYW]-[HN]-[FY]-[NY], ζ= hydrofil amino acid) på sin aktiva plats.

Den här artikeln innehåller text från det offentliga området Pfam och InterPro : IPR000726