Exonukleas III
| Exonukleas III | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Kristallstruktur av exonukleas III från E. coli . | |||||||
| Identifierare | |||||||
| Organism | |||||||
| Symbol | xthA | ||||||
| Alt. symboler | ExoIII | ||||||
| Entrez | 946254 | ||||||
| RefSeq (Prot) | NP_416263 | ||||||
| UniProt | P09030 | ||||||
| Övriga uppgifter | |||||||
| EG-nummer | 3.1.11.2 | ||||||
| Kromosom | genom: 1,83 - 1,83 Mb | ||||||
| |||||||
Exonukleas III (ExoIII) är ett enzym som tillhör exonukleasfamiljen . ExoIII katalyserar det stegvisa avlägsnandet av mononukleotider från 3'-hydroxyltermini av dubbelsträngat DNA . Ett begränsat antal nukleotider tas bort under varje bindningshändelse, vilket resulterar i koordinerade progressiva deletioner inom populationen av DNA- molekyler .
Fungera
De föredragna substraten är trubbiga eller försänkta 3'-terminaler, även om ExoIII också verkar vid skåror i duplex-DNA för att producera enkelsträngade luckor. Enzymet är inte aktivt på enkelsträngat DNA, och därför är 3'-utskjutande ändar resistenta mot klyvning. Graden av motstånd beror på förlängningens längd, där förlängningar 4 baser eller längre är väsentligen resistenta mot klyvning. Denna egenskap används för att producera enkelriktade deletioner från en linjär molekyl med en resistent (3'-överhäng) och en känslig (trubbig eller 5'-överhäng) ände.
ExoIII-aktivitet beror delvis på DNA-spiralstrukturen och uppvisar sekvensberoende (C>A=T>G).
ExoIII har också rapporterats ha RNas H, 3'-fosfatas och AP-endonukleasaktiviteter.
Aktuella studier
Det finns många olika exonukleaser och många återstår fortfarande att upptäcka i bakterier, aktuella studier genomförs i E. coli . Många exonukleaser faller in i superfamiljer med olika livsdomäner, vilket bevisar att exonukleas III har visat sig vara gammalt. Exonukleaser utvecklades tidigt i livets historia och har viktiga biologiska roller.
förordning
Temperatur , saltkoncentration och förhållandet mellan enzym och DNA påverkar enzymaktiviteten i hög grad, vilket kräver att reaktionsförhållandena skräddarsys för specifika tillämpningar .
Vidare läsning
- Richardson CC, Lehman IR, Kornberg A (januari 1964). "Ett deoxiribonukleinsyrafosfatas-exonukleas från Escherichia coli . II. Karakterisering av exonukleasaktiviteten" ( PDF) . Journal of Biological Chemistry . 239 (1): 251–8. doi : 10.1016/S0021-9258(18)51775-0 . PMID 14114851 .
- Linxweiler W, Hörz W (augusti 1982). "Sekvensspecificitet för exonukleas III från E. coli" . Nukleinsyraforskning . 10 (16): 4845–59. doi : 10.1093/nar/10.16.4845 . PMC 320823 . PMID 6752885 .
