ACAD9

ACAD9
Identifiers
	, NPD002, acyl-CoA dehydrogenas family member 9, MC1DN20
External IDs
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	n/a
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Acyl-CoA dehydrogenas familjemedlem 9, mitokondrie är ett enzym som hos människor kodas av ACAD9 -genen . Mitokondriellt komplex I-brist med varierande kliniska manifestationer har associerats med mutationer i ACAD9 .

Strukturera

ACAD9-genen innehåller en öppen läsram på 1866 baspar; denna gen kodar för ett protein med 621 aminosyrarester . Justering av ACAD9-proteinsekvensen med den för andra humana ACAD-proteiner visade att ACAD-9-protein uppvisar 46–27 % identitet och 56–38 % likhet med de åtta medlemmarna i ACAD-familjen, inklusive ACADVL , ACADS , ACADM , ACADL , IVD, GCD, ACADSB och ACD8. Den beräknade molekylvikten för ACAD9 är 68,8 kDa.

Fungera

ACAD9-enzymet katalyserar ett avgörande steg i beta-oxidation av fettsyror genom att bilda en C2-C3 transdubbelbindning i fettsyran. LVCAD är specifik för mycket långkedjiga fettsyror, vanligtvis C16-acylCoA och längre. Det har observerats att ACAD9 kan katalysera acyl-CoAs med mycket långa kedjor. ACAD9s specifika aktivitet mot palmitoyl-CoA (C16:0) är tre gånger högre än mot stearoyl-CoA (C18:0). ACAD-9 har liten aktivitet på n-oktanoyl-CoA (C8:0), n-butyryl-CoA (C4:0) eller isovaleryl-CoA (C5:0).

I motsats till ACADVL är ACAD9 också involverat i sammansättningen av det oxidativa fosforyleringskomplexet I. ACAD9 binder komplex I sammansättningsfaktorer NDUFAF1 och Ecsit och krävs specifikt för sammansättningen av komplex I. Dessutom resulterar ACAD9-mutationer i komplex I-brist och inte i störd långkedjig fettsyraoxidation.

Klinisk signifikans

Mutationer i ACAD9-genen är associerade med mitokondriekomplex I-brist typ 20, som är autosomalt recessiv . Denna brist är den vanligaste enzymdefekten av de oxidativa fosforyleringsrubbningarna. Brist på mitokondriekomplex I visar extrem genetisk heterogenitet och kan orsakas av mutation i kärnkodade gener eller i mitokondriekodade gener. Det finns inga uppenbara genotyp - fenotypkorrelationer , och slutsatsen av den underliggande basen från den kliniska eller biokemiska presentationen är svår, för att inte säga omöjlig. Men majoriteten av fallen orsakas av mutationer i nukleärt kodade gener. neurodegenerativa störningar i vuxen ålder . Fenotyper inkluderar makrocefali med progressiv leukodystrofi , ospecifik encefalopati , hypertrofisk kardiomyopati , myopati , leversjukdom , Leighs syndrom , Leber ärftlig optisk neuropati och vissa former av Parkinsons sjukdom .

Ett fåtal fall som är specifika för ACAD9 har rapporterats. Vissa fall visades med episodisk leverdysfunktion under annars lindriga sjukdomar eller kardiomyopati, tillsammans med kronisk neurologisk dysfunktion. Hjärnfynd var anmärkningsvärda för generaliserat ödem med diffus ventrikulär kompression, akut vänster tonsillbråck och diffus multifokal akut skada i hippocampus . Dessutom sågs vissa abnormiteter som överensstämmer med icke-akuta förändringar, inklusive en subakut höger cerebellär hemisfärinfarkt och minskning av antalet neuroner i flera områden. Hos en patient, vars kliniska manifestationer av hypotoni , kardiomyopati och laktacidos , tillät en kraftfull behandling med riboflavin individen att ha normal psykomotorisk utveckling och ingen kognitiv försämring vid 5 års ålder. Ansträngningsinducerad rabdomyolys , mitokondriell encefalomyopati och hyperplasi i lever, hjärtmyocyter , skelettmuskler och njurtubuli har också observerats hos patienter med ACAD9 -mutationer.

Interaktioner

ACAD9 är en del av MCIA-komplexet (mitochondrial complex I assembly). Komplexet omfattar åtminstone TMEM126B , NDUFAF1 , ECSIT och ACAD9, som interagerar direkt med NDUFAF1 och ECSIT.

externa länkar

Mänskligt ACAD9- genomplacering och ACAD9- geninformationssida i UCSC Genome Browser .

Vidare läsning

Fragaki K, Chaussenot A, Boutron A, Bannwarth S, Cochaud C, Richelme C, Sacconi S, Paquis-Flucklinger V (juni 2017). "Svår defekt i mitokondriellt komplex I-sammansättning med mitokondriella DNA-deletioner i ACAD9-defekt mild myopati". Muskel & nerv . 55 (6): 919–922. doi : 10.1002/mus.25262 . PMID 27438479 . S2CID 5530200 .
Szafranski K, Schindler S, Taudien S, Hiller M, Huse K, Jahn N, Schreiber S, Backofen R, Platzer M (2008). "Brott mot splitsningsreglerna: TG-dinukleotider fungerar som alternativa 3'-splitsningsställen i U2-beroende introner" . Genombiologi . 8 (8): R154. doi : 10.1186/gb-2007-8-8-r154 . PMC 2374985 . PMID 17672918 .
He M, Rutledge SL, Kelly DR, Palmer CA, Murdoch G, Majumder N, Nicholls RD, Pei Z, Watkins PA, Vockley J (juli 2007). "En ny genetisk störning i mitokondriell fettsyra beta-oxidation: ACAD9-brist" . American Journal of Human Genetics . 81 (1): 87–103. doi : 10.1086/519219 . PMC 1950923 . PMID 17564966 .
Oey NA, Ruiter JP, Ijlst L, Attie-Bitach T, Vekemans M, Wanders RJ, Wijburg FA (juli 2006). "Acyl-CoA-dehydrogenas 9 (ACAD 9) är det långkedjiga acyl-CoA-dehydrogenaset i mänskliga embryonala och fosterhjärnor". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 346 (1): 33–7. doi : 10.1016/j.bbrc.2006.05.088 . PMID 16750164 .
Ensenauer R, He M, Willard JM, Goetzman ES, Corydon TJ, Vandahl BB, Mohsen AW, Isaya G, Vockley J (september 2005). "Humant acyl-CoA-dehydrogenas-9 spelar en ny roll i mitokondriell beta-oxidation av omättade fettsyror" . Journal of Biological Chemistry . 280 (37): 32309–16. doi : 10.1074/jbc.M504460200 . PMID 16020546 .
Oey NA, den Boer ME, Ruiter JP, Wanders RJ, Duran M, Waterham HR, Boer K, van der Post JA, Wijburg FA (2004). "Hög aktivitet av fettsyraoxidationsenzymer i human placenta: konsekvenser för foster-modern sjukdom". Journal of Inherited Metabolic Disease . 26 (4): 385–92. doi : 10.1023/A:1025163204165 . PMID 12971426 . S2CID 12128475 .