TMEM126B

TMEM126B
Identifiers
	, HT007, transmembranprotein 126B
Externa IDs
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Transmembranprotein 126B är ett protein som hos människor kodas av TMEM126B -genen . TMEM126B är ett mitokondriellt transmembranprotein som är en komponent i det mitokondriella komplexet I-sammansättningskomplexet. TMEM126B - genen är konserverad i däggdjur. Det kodade proteinet fungerar som en sammansättningsfaktor som krävs för bildning av komplexets membranarm. Den interagerar med NADH- dehydrogenas [ubiquinon] 1 alfa subkomplex assembly factor 13. Naturligt förekommande mutationer i denna gen är associerade med isolerad komplex I-brist. En pseudogen av denna gen har definierats på kromosom 9 .

Strukturera

TMEM126B ligger på q-armen av kromosom 11 i position 14.1 och har 7 exoner . TMEM126B - genen producerar ett 4,6 kDa protein som består av 54 aminosyror . Det är en del av mitochondrial complex I assembly), sammansatt av NDUFAF1 , ECSIT och ACAD9 (genom likhet). Det associeras med det mellanliggande 370 kDa subkomplexet av ofullständigt sammansatt komplex I. Komplex I består av 45 evolutionärt konserverade kärnsubenheter, inklusive både mitokondriellt DNA och nukleärt kodade subenheter. En av dess armar är inbäddad i mitokondriernas inre membran och den andra är inbäddad i organellen . De två armarna är anordnade i en L-formad konfiguration. Den totala molekylvikten för komplexet är 1MDa. En tecknad representation av den förutsagda orienteringen av TMEM126B i cellmembranet, preliminärt baserad på fosforylerings- och hydrofobicitetsdata visas nedan.

Fungera

TMEM126B - genen kodar för ett mitokondriellt transmembranprotein som är en komponent i det mitokondriella komplexet I-sammansättningskomplexet. Det kodade proteinet fungerar som en sammansättningsfaktor som krävs för bildning av komplexets membranarm. TMEM126B comigrerar med andra monteringsfaktorer inklusive ACAD9 , CIA30 och ECSIT . I frånvaro av TMEM126B rekryterades inte sådana monteringsfaktorer in i mitokondriella membranet och deltog inte i komplex I-montering. Dysfunktion av TMEM126B har känt till att orsaka flera komplikationer i komplex I som kännetecknas av allvarliga svårigheter i mitokondriell andning och fullständigt misslyckande med komplex I-sammansättning. Det är dock inte känt att ha signifikant effekt på sammansättningarna av mitokondriella komplex III, IV och V.

Klinisk signifikans

Mutationer i TMEM126B är kända för att resultera i mitokondriella sjukdomar och associerade störningar. Det är huvudsakligen förknippat med en komplex I-brist, en brist i det första komplexet av den mitokondriella andningskedjan . En komplex I-brist som involverar dysfunktion av den mitokondriella andningskedjan kan orsaka ett brett spektrum av kliniska manifestationer från dödlig neonatal sjukdom till neurodegenerativa störningar i vuxen ålder. Fenotyper inkluderar makrocefali med progressiv leukodystrofi , ospecifik encefalopati , kardiomyopati , Leighs syndrom , myopati , leversjukdom , Leber ärftlig optisk neuropati och vissa former av Parkinsons sjukdom . Förutom komplex I-brist TMEM126B -mutationer också samband med allvarliga multisystemstörningar under spädbarnsåldern, såsom kronisk njursvikt och kardiomyopati , och myopati i barndomen eller vuxen ålder.

Upptäckt

TMEM126B upptäcktes först i en studie av proteinuttryck i vävnader i hypotalamus - hypofys - binjureaxeln med hjälp av fullständig cDNA- kloning. Det har sedan dess upptäckts i andra vävnader.

Gen

TMEM126B finns på kromosom 11 hos människor, flankerad av följande gener:

DLG2 : En medlem av den membranassocierade guanylatkinasfamiljen .
TMEM126A : En paralog av TMEM126B uttryckt i mitokondrierna .
CREBZF: Även känt som Zhangfei-proteinet, ett protein som interagerar med herpes simplex-virus .

Översättning

En konceptuell översättning av TMEM126B-proteinet, inklusive en projektion av den sekundära strukturen , förutsägelser av transmembranregioner och förmodade fosforylerings- och glykeringsställen ingår nedan:

Vävnadsfördelning

TMEM126B uttrycks i de flesta vävnadstyper , med de anmärkningsvärda undantagen av fettvävnad , öronvävnad , struphuvudet , lymfvävnad , nervvävnad , hypofysen , mjälte , tymus , sköldkörteln , luftstrupen och navelsträngen . Det verkar också vara starkt uttryckt i bisköldkörtel , benmärg och urinblåsvävnad . Det finns också bevis för att en av isoformerna av TMEM126B uttrycks i cellmembranet i minnes B-celler i det adaptiva immunsystemet .

Förutspådda egenskaper

Följande egenskaper hos TMEM126B förutspåddes med hjälp av bioinformatisk analys :

Molekylvikt : 22,7 KDal
Isoelektrisk punkt : 9,02
TMEM126B ortologer har mycket variabla isoelektriska punkter.
Post-translationell modifiering : flera möjliga fosforyleringsställen upptäcktes och ett par möjliga glykationsställen förutspåddes
Ingen signalpeptid har förutspåtts.

Interaktioner

Förutom co-subenheter för komplex I har TMEM126B protein-proteininteraktioner med ECSIT , NDUFAF1 , NDUFC2 , NDUFA13 och andra.

Vidare läsning

Kiel DP, Demissie S, Dupuis J , Lunetta KL, Murabito JM, Karasik D (september 2007). "Genomomfattande association med benmassa och geometri i Framingham Heart Study" . BMC Medical Genetics . 8 Suppl 1: S14. doi : 10.1186/1471-2350-8-S1-S14 . PMC 1995606 . PMID 17903296 .
Estrada K, Krawczak M, Schreiber S, van Duijn K, Stolk L, van Meurs JB, Liu F, Penninx BW, Smit JH, Vogelzangs N, Hottenga JJ, Willemsen G, de Geus EJ, Lorentzon M, von Eller-Eberstein H. , Lips P, Schoor N, Pop V, de Keijzer J, Hofman A, Aulchenko YS, Oostra BA, Ohlsson C, Boomsma DI, Uitterlinden AG, van Duijn CM, Rivadeneira F, Kayser M (september 2009). "En genomomfattande associationsstudie av nordvästeuropeer involverar signalvägen för C-typ natriuretisk peptid i etiologin för mänsklig längdvariation. " Human molekylär genetik . 18 (18): 3516–24. doi : 10.1093/hmg/ddp296 . PMC 2729669 . PMID 19570815 .